multifactor dimensionality reduction Опции

[_alena_]

Если вы НЕ анализируете межгенные взаимодействия или же взаимодействие ген-окружающая среда, то зачем вам нужно использовать метод MDR??
MDR разрабатывался для анализа генетических данных.

мне сказали что если правильно закодировать данные то не важно межгенные там взаимодействия или какие то другие

[Olga_]

мне сказали что если правильно закодировать данные то не важно межгенные там взаимодействия или какие то другие

Странный совет вам дали. 0, 1, 2 обычно кодируется генотип (АА, Аа, аа).
Используйте обычные статистические пакеты, т.к. не понимая ни основ статистики, ни генетического анализа, вы не сможете правильно закодировать данные и посчитать результат.

[Larina Tatjana]

есть данные по кардиологии. предоперационных набор параметров и постоперационных.планирую применить логистическую регрессиюю для определения риска того или иного вмешатальства и ислледования влияния пороков. посоветовали воспользоваться multifactor dimensionality reduction и permutation test.пока понятия не имею с чего начать и к чему приступить

Привет, _alena_ !
Хочу напомнить, что термин "Reduction" означает свёртку, уменьшение, снижение (в контексте письма) размерности пространства признаков. Т.е. это не 1 какой-то конкретный метод, а целый набор различных методов. Многие из этих методов описаны в книгах по многомерной статистике, и не только в книгах. Можете найти на Ютюбе "Канал пользователя biostat1911", где некоторые из этих методов кратко описаны в видео-формате. Это означает, что неправильно ориентироваться на выбор 1 единственного метода. Все методы этой группы взаимно дополняют друг друга. В принципе я согласна с "p2004r" в том, что логит-регрессия в данном случае более предпочтительна. Однако для того чтобы выбрать лучшие уравнения логистической регрессии, и далее верно интерпретировать эти уравнения, нужны результаты и по другим методам. А сделать корректно это под силу лишь профессиональным биостатистикам. Это ведь не вычисление дисперсии или коэффициентов корреляции. У меня тоже в своё время были аналогичные данные и задачи. И я сама кое-что наковыряла. Но когда познакомилась с результатами лог-регрессии у своего научного руководителя, которому считал профессионал, поняла, что мои результаты не имеют никакой ценности. И далее списалась с профи. В результате из сотни с лишним уравнений, полученных для разных подгрупп больных, выбрала около десятка самых ценных и удобных. Вообще надо понимать, на что лучше с большей пользой потратить время: на самоделки в сложной статистике, или на осмысление результатов, полученных профи. Я лично за второй вариант. Кстати, у америкосов в журналах прямо об этом говорится. Потому у них среди соавторов статей так много профессиональных биостатистиков.

[_alena_]

Вообще надо понимать, на что лучше с большей пользой потратить время: на самоделки в сложной статистике, или на осмысление результатов, полученных профи.

Здравствуйте, Татьяна!

Я понимаю, но особо противоречить научруку не могу....сказал посмотреть что этим методом получится вот и пытаюсь как то разобраться и в логрегрессии и дискриминантном анализе и в MDR....

(((

уж совсем отчаялась....

[p2004r]

Здравствуйте, Татьяна!

Я понимаю, но особо противоречить научруку не могу....сказал посмотреть что этим методом получится вот и пытаюсь как то разобраться и в логрегрессии и дискриминантном анализе и в MDR....

(((

уж совсем отчаялась....

так данные загрузите в форум в формате csv (если они не секретные конечно), с небольшим пояснением что из показателей выход, а что вход классификации. давайте вместе посмотрим что в них видно.

[_alena_]

так данные загрузите в форум в формате csv (если они не секретные конечно), с небольшим пояснением что из показателей выход, а что вход классификации. давайте вместе посмотрим что в них видно.

а вы и в МDR сможете мне что то подсказать?

[TheThing]

Да выкладывайте уже, сможем-сможем

[_alena_]

Да выкладывайте уже, сможем-сможем

Cпасибо, только не хочу чтоб кто то что то сделал, выложил и все... я хочу сама разобраться... у меня есть много вопросов....

Задача моя посмотреть какие переменные влияют на исходную "Прогресс".

Что я уже делала с этими данными - строила корреляцию Кенделла и Тауба, результаты практически не отличаются...затем все переменные вводила в дискриминантный анализ и логистическую регрессию. результаты тоже между собой не давали особых отличий. Тоесть у меня если правильно - то появился список этих переменных?
Есть еще вопрос который стоило задать вначале - правильно ли я определила тип переменных???

Если все до этого было более менее правильно то теперь мне еще нужно точно так же с помощью MDR проверить какие переменные влияют на "Прогресс"

Прикрепленные файлы

 1.rar ( 12,36 килобайт ) Кол-во скачиваний: 323

 

[YVR]

Cпасибо, только не хочу чтоб кто то что то сделал, выложил и все... я хочу сама разобраться... у меня есть много вопросов....

Задача моя посмотреть какие переменные влияют на исходную "Прогресс".

С уверенностью можно сказать какие переменные точно не влияют на Прогресс: СА, Stenoz артерий ног, Insult V. anemneze

Эти переменные можно исключить из рассмотрения.

Под сомнением стоят: Пол и Stenoz A. Realis, т.к. у них есть всего одно различие.

Сообщение отредактировал YVR - 21.03.2012 - 09:53

[_alena_]

мне сам принцип понять.... я просто взяла выборку из 20 человек... и не проследила что там нету различных значений

[YVR]

мне сам принцип понять.... я просто взяла выборку из 20 человек... и не проследила что там нету различных значений

Чтобы понять принцип, нужны полные данные, а не отдельные выборки. У меня телепатические способности не развиты, поэтому что увидел в выборке, то и сообщил.

Сообщение отредактировал YVR - 21.03.2012 - 10:22

[p2004r]

Cпасибо, только не хочу чтоб кто то что то сделал, выложил и все... я хочу сама разобраться... у меня есть много вопросов....

Задача моя посмотреть какие переменные влияют на исходную "Прогресс".

У Вас только 20 случаев? Или это маленькая выборка из основной?

Сообщение отредактировал p2004r - 21.03.2012 - 10:50

[_alena_]

извините, не думала что прям так важно все данные скидывать.

это маленькая из основной. для понимания принципа как и что делать... если нужно больше то загружу остальное

[YVR]

извините, не думала что прям так важно все данные скидывать.

это маленькая из основной. для понимания принципа как и что делать... если нужно больше то загружу остальное

Загружайте все что есть, если данные не секретные

А по выборке есть закономерности:

вероятность прогресса = 1 - A - B + 2AB

где:

В = (С + D) / 2

А - Shunt (1 - наличие, 0 - отсутствие)
C - AG Terapia (1 - наличие, 0 - отсутствие)
D - AIK (1 - наличие, 0 - отсутствие)

При условии, что обозначения в файле выборки соответствуют: 2 - наличие, 1 - отсутствие

Сообщение отредактировал YVR - 21.03.2012 - 10:53

[p2004r]

извините, не думала что прям так важно все данные скидывать.

это маленькая из основной. для понимания принципа как и что делать... если нужно больше то загружу остальное

лучше больше случаев видеть конечно.

переменная Statiny : что означают её уровни?