Глупый вопрос про вычисление среднего и ст. отклонения |
Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )
Глупый вопрос про вычисление среднего и ст. отклонения |
15.03.2012 - 21:50
Сообщение
#1
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 3 Регистрация: 15.03.2012 Пользователь №: 23567 |
Возможно вопрос из категории глупых, однако хотелось бы понять, как правильно вычислить среднее и стандартное отклонение в таком случае: В группе крыс, которым вводится определенный препарат, проводится морфометрическая оценка гепатоцитов (диаметр ядра, клетки, ядерно-цитоплазматическое соотношение и пр.), допустим оценивается по 100 гепатоцитов в каждом животном, соответственно получаются ряды числовых значений для каждого животного. Вопрос в том, как в конечном итоге определить среднее и ст. отклонение по группе? Нужно сначала определить средние параметры гепатоцитов для каждого животного, а потом из получившихся значений вычислить групповые средние и ст. отклонения, или как-то иначе? Заранее благодарен.
|
|
15.03.2012 - 22:13
Сообщение
#2
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 902 Регистрация: 23.08.2010 Пользователь №: 22694 |
Цитата Нужно сначала определить средние параметры гепатоцитов для каждого животного, а потом из получившихся значений вычислить групповые средние и ст. отклонения... Именно так |
|
16.03.2012 - 10:43
Сообщение
#3
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 1091 Регистрация: 26.08.2010 Пользователь №: 22699 |
Именно так А смысл? Код > zzz <-replicate(10, rnorm(100, mean = 10, sd = 2)) # 10 случайных выборок из общей генсовокупности > colMeans(zzz) # Средние выборок [1] 10.477161 9.741375 9.858446 10.071031 10.254527 9.861759 10.038437 [8] 9.749043 10.010075 9.755980 > mean(colMeans(zzz)) # Средние средних выборок [1] 9.981783 > mean(as.numeric(zzz)) # просто среднее по числам составляющим все выборки [1] 9.981783 > Тут по моему надо посмотреть глазами на распределение в генсовокупности морфологического параметра. И решать задачу является ли она смесью. И если да, то как каждый случай наблюдения включает в себя компоненты этой смеси. |
|
16.03.2012 - 13:37
Сообщение
#4
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 902 Регистрация: 23.08.2010 Пользователь №: 22694 |
Цитата А смысл? А про смысл человек не спрашивал |
|
16.03.2012 - 22:23
Сообщение
#5
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 3 Регистрация: 15.03.2012 Пользователь №: 23567 |
А смысл? Код > zzz <-replicate(10, rnorm(100, mean = 10, sd = 2)) # 10 случайных выборок из общей генсовокупности > colMeans(zzz) # Средние выборок [1] 10.477161 9.741375 9.858446 10.071031 10.254527 9.861759 10.038437 [8] 9.749043 10.010075 9.755980 > mean(colMeans(zzz)) # Средние средних выборок [1] 9.981783 > mean(as.numeric(zzz)) # просто среднее по числам составляющим все выборки [1] 9.981783 > Тут по моему надо посмотреть глазами на распределение в генсовокупности морфологического параметра. И решать задачу является ли она смесью. И если да, то как каждый случай наблюдения включает в себя компоненты этой смеси. Если не сложно, прошу пояснить, какие возможны варианты включения компонентов смеси в конкретные случаи, и что тот или иной вариант будет означать, и каким образом, все таки, следует выводить стандартное отклонение. |
|
17.03.2012 - 10:11
Сообщение
#6
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 1202 Регистрация: 13.01.2008 Из: Челябинск Пользователь №: 4704 |
Раз анализ проводился на 100 клеток, значит ваши данные представляют собой доли, их удобно выражать в %. Проценты не подчиняются нормальному распределению, хотя многие этого не знают или игнорируют. О том как считать писал здесь (Den_N, пост ?5):
http://molbiol.ru/forums/index.php?showtopic=469888 |
|
17.03.2012 - 12:15
Сообщение
#7
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 1091 Регистрация: 26.08.2010 Пользователь №: 22699 |
Если не сложно, прошу пояснить, какие возможны варианты включения компонентов смеси в конкретные случаи, и что тот или иной вариант будет означать, и каким образом, все таки, следует выводить стандартное отклонение. 1 У каждого из животных ?случайно? отобраны по 100 клеток. Крайне сомнительно что морфологические параметры этих клеток дают унимодальное распределение. В любом случае факт унимодальности надо доказать. 2 Характеризовать не унимодальное распределение средним и стандартным отклонением не правильно. Смесь распределений характеризуют характеристики компонентов смеси. 3 Животные у Вас одного вида. Значит возможные варианты развития гепатоцитов у всех особей общие. Скорее всего выявленные компоненты составляющие распределение морфологии клеток будут общие для всей совокупности. А каждое конкретное животное будет характеризоваться какие из допустимых вариантов морфологии гепатоцитов реализованы у него. |
|