Версия для печати темы

Нажмите сюда для просмотра этой темы в обычном формате

Форум врачей-аспирантов _ Медицинская статистика _ power anaylysis для ановы со средними и сигмами

Автор: nastushka 16.11.2017 - 16:49

Подскажите, пожалуйста, как мне рассчитать мощность для ановы с тремя группами, имея только средние и стандартные отклонения?
пример
М=40, S=4
M2=35 S=10
M3=45 S=8
Как мне мощность рассчитать в R

Автор: p2004r 16.11.2017 - 16:58

Цитата(nastushka @ 16.11.2017 - 16:49) *
Подскажите, пожалуйста, как мне рассчитать мощность для ановы с тремя группами, имея только средние и стандартные отклонения?
пример
М=40, S=4
M2=35 S=10
M3=45 S=8
Как мне мощность рассчитать в R


https://cran.r-project.org/web/packages/pwr2/pwr2.pdf

Автор: nastushka 16.11.2017 - 17:02

Код
Description
Calculate power for one-way ANOVA models.
Usage
pwr.1way(k=k, n=n, alpha=alpha, f=NULL, delta=delta, sigma=sigma)
Arguments
k
Number of groups
n
Sample size per group
f
Effect size
alpha
Significant level (Type I error probability)
delta
The smallest difference among k groups
sigma
Standard deviation, i.e. square root of variance


И где в этих аргументах вводить среднее и сигмы, у меня три группы и все имеют разные средние и сигмы)) а тут дана только одна сигма

Автор: p2004r 16.11.2017 - 22:02

Цитата(nastushka @ 16.11.2017 - 17:02) *
Код
Description
Calculate power for one-way ANOVA models.
Usage
pwr.1way(k=k, n=n, alpha=alpha, f=NULL, delta=delta, sigma=sigma)
Arguments
k
Number of groups
n
Sample size per group
f
Effect size
alpha
Significant level (Type I error probability)
delta
The smallest difference among k groups
sigma
Standard deviation, i.e. square root of variance


И где в этих аргументах вводить среднее и сигмы, у меня три группы и все имеют разные средние и сигмы)) а тут дана только одна сигма



Ну так посчитайте-оцените размер эффекта https://cran.r-project.org/web/packages/pwr/vignettes/pwr-vignette.html

Автор: nastushka 17.11.2017 - 15:33

p2004r, там в любом случае надо вводить сигму, но только одну,а у меня их три)
Прям как в том анекдоте про блондинке в машине, ножек 2, а педалек 3))

Автор: nokh 17.11.2017 - 22:19

Во-первых, классический дисперсионный анализ (как и классический t-критерий) требует равенства (однородности) дисперсий в группах. Это прописано во всех учебниках. Неправильно требовать от пакетов решений для неклассических задач. То, что на практике это требование может нарушаться и придуманы какие-то манёвры для его обхода - из другой области. Хотя можно попытаться использовать что-то из этих наработок для вашего случая. Например, модифицировать (уменьшить) степени свободы для F-критерия, т.е. попробовать посчитать мощность для Welch ANOVA. Но пока не очень себе представляю получится ли сделать это в рамках готовых пакетов типа рекомендованного pwr2.

Во-вторых, вы не указали количества наблюдений в группах. Без этого не понятно, отличаются ли дисперсии в группах (квадраты стандартных отклонений) статистически значимо или это может быть случайными выборочными вариациями одной и той же дисперсии. Если не отличаются - всё проще: нужно специальным образом усреднить ст. отклонения и считать мощность как для обычного случая. Всё-таки, приведите ещё и n - вдруг руки дойдут...

Автор: nastushka 18.11.2017 - 12:42

nokh, спасибо Вам, в каждой группе 25 чел. А как усреднить стандартные отклонения?

Автор: nokh 18.11.2017 - 19:27

Цитата(nastushka @ 18.11.2017 - 14:42) *
nokh, спасибо Вам, в каждой группе 25 чел. А как усреднить стандартные отклонения?

Нужно гуглить, формулы видел. Также у Урбаха (Биометрические методы) есть на стр. 118 для дисперсий. Но теперь стало понятно, что вам это не подойдёт, т.к. ваши дисперисии сильно отличаются, например, для крайних вариантов 4 и 10, (т.е. дисперсий 16 и 100) F(24; 24)=100/16=6,25; P=0,000014. Т.о. усреднять ст. отклонения нельзя. Но столь сильные различия дисперсий наводят на мысль о ненормальном, возможно, сильно асимметричном распределении ошибки модели anova. Вы проверяли остатки на нормальность, использовали нормализующие преобразования в дисперсионном анализе?

Автор: nastushka 20.11.2017 - 15:18

nokh, все в порядке. Тут правда остатки распределены не нормально, а значит и не надо парится с анализом мощности, под эти данные, он не подходит.

Форум Invision Power Board (http://www.invisionboard.com)
© Invision Power Services (http://www.invisionpower.com)