Зависимость локализации поражения от породы Опции

[Елена Гогуа]

Здравствуйте. Я ветеринарный врач, увлечена клиническими исследованиями. Самоучка, так как в российской ветеринарной медицине этого направления пока нет. Поэтому прошу прощения за возможно глупые вопросы.

Коллеги попросили помочь с исследованием: оценка породной предрасположенности к определенной локализации и характеру кожных поражений у собак. Есть 8 пород (в исследование включались породы, где было 3 и больше пациентов) - всего 77 собак, и в качестве контрольной группы собаки, которых было представлено только по 1-2 штуки из породы (всего 11). Локализаций поражений 24.

Правильно ли я понимаю:
1.Это описательное исследование (зависимость локализации поражения от породы, нет вмешательства, нет исхода) и поэтому контрольная группа не нужна (но так посоветовал профессор из Германии..)?
2.Поскольку это независимые номинальные переменные (есть/нет поражения в этой области тела у этой породы), я должна провести анализ таблиц сопряженности для всех пар признаков?
3.Тот же профессор посоветовал использовать поправку Бонферрони, но я не уверена, что она тут к месту..

Буду благодарна за помощь и советы.

[Елена Гогуа]

Я прошу прощения, что так надолго пропала.

Напишу подробнее, что происходит.
Российские ветеринарные врачи сформулировали гипотезу, что локализация кожных поражений у собак и тип инфекции (бактериальная, грибковая, смешанная) взаимосвязаны с породой. Исследование проспективное, собак набирали около года по протоколу. Все это исследование проходит при участии профессора из Германии. Это именно участие и помощь, он не статистик и не должен анализировать данные. Он помогает советами, так как имеет больший опыт.

Я прикрепила таблицу с данными.

Всего 88 собак, породные группы формировались, если собак этой породы было 3 и более. Получилось 8 породных групп плюс 11 собак разных пород.
Локализаций поражений всего 8 (лапы, уши, морда, живот, спина и т.д.). У одной собаки может быть несколько пораженных областей. В свою очередь, каждое поражение может быть бактериальное ИЛИ грибковое ИЛИ смешанное. Исходя из этого получилось 8*3 = 24 переменные (зона_1_бакт, зона_1_грибк, зона_1_смеш, зона_2_бакт, и т.д.). Кроме того, рассматривали типы инфекции (бакт, грибк, смеш) без учета локализации. Например, у одной породы почти все поражения были грибковыми, у другой смешанными, у третьей - вообще не было инфекций (да, есть породы, у которых зуд и подтвержденный диагноз есть, но вторичной инфекции нет). Всего получилось 8 + 24 + 4 = 36 переменных (в таблице, мне кажется, понятней).

Так вот. Я по каждой паре порода*переменная проводила анализ таблиц сопряженности. Статистически значимые результаты совпадали с клиническими наблюдениями дерматологов (ну это к слову).

Немецкий профессор вчера написал, что при множественных сравнениях одних и тех же данных есть вероятность значимых результатов просто случайная, и необходимо использовать коррекцию Бонферрони (которая, конечно, все эти значимости сводит на нет).

Мне вся эта задачка очень интересна, но не хватает знаний и опыта


Буду очень благодарна за ваши мнения.

Сообщение отредактировал Елена Гогуа - 26.08.2018 - 20:25

Прикрепленные файлы

 breed_localization.xlsx ( 20,37 килобайт ) Кол-во скачиваний: 215