Дисперсионный анализ для отслеживания ошибок в результатах PGD |
Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )
Дисперсионный анализ для отслеживания ошибок в результатах PGD |
26.06.2018 - 09:33
Сообщение
#1
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 14 Регистрация: 25.06.2018 Пользователь №: 31577 |
Всем доброго утра! Я клинический эмбриолог, и в нашей клинике мы так же работаем с генетическим анализом эмбрионов. Сущность этого анализа заключается в том что мы отщепляем часть клеток эмбриона, кладем биоптат в буфер и отправляем на генетический анализ в сотрудничающую с нами генетическую фирму. Большая часть биоптата успешно проходит анализ, но некоторая часть всегда нечитабельна (ошибки при транспортировке). Биоптат который не прошел анализ идем за индексом FA (потеря сигнала).
У меня вопрос - недавно мы сменили курьера, который использует другие условия доставки материала, и у меня ощущение что число эмбрионов с FA резко выросло. Я имею точные данные о числе отправленых эмбрионов по месяцам и точные данные о числе FA. Дата смены курьера у меня так же имеется так что группы можно разделить по времени. Как вы считаете, уважаемые участники форума, мог бы я использовать дисперсионный анализ (с неравномерной численностью групп) в качестве способа выявить различия между тем, сколько FA было у одной транспортной компании, и сколько у другой? Условия 1) Нулевая гипотеза - раличия по FA между разными курьерами не существенны 2) анализируется только один фактор - число FA 3) анализ двух групп (старый курьер и новый курьер) за равный интервал времени но с разным числом пациентов (неравномерная численность групп) Для применения дисперсионного анализа необходимо 4 условия 1) совокупность нормально распределена (скорее всего это так, но надо проверить по среднему, медиане и 25 и 75 процентилям) 2) каждая выборка случайно извлечена из исследуемой совокупности (выполнено) 3) каждая выборка независима от остальных выборок (выполнена) 4) дисперсии всех выборок равны или отличаются не сильно (надо рассчитать) - вопрос насколько допустимы различия между дисперсиями? Какие подводные камни, можно или нет применять дисперсионный анализ - в общем жду мнений, спасибо! |
|
26.06.2018 - 12:05
Сообщение
#2
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 1091 Регистрация: 26.08.2010 Пользователь №: 22699 |
Это временной ряд, про стационарность которого мы ничего не знаем. Поэтому весь этот энтузиазм в треде мне не понятен. Надо видеть данные. |
|
26.06.2018 - 12:31
Сообщение
#3
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 231 Регистрация: 27.04.2016 Пользователь №: 28223 |
Это временной ряд, про стационарность которого мы ничего не знаем. Поэтому весь этот энтузиазм в треде мне не понятен. Надо видеть данные. При всем уважении, а какую трудность в анализе Вы заметили? Временной ряд? Возможно рассматривать и с этой позиции. Но! Нам точно известна change point. Да, можно проанализировать ряд "до", посмотреть, есть-ли тренд и/или сезонность, потом - если есть - сделать предсказание и сравнить с рядом "после". В общем-то то-же классическая задача. Если же тренда вообще нет - то задача вообще становиться тривиальной. Впрочем, допускаю, что я что-то сугубо "медицинское" упустил. Буду рад за уточнения. |
|