Софт для морфометрии Опции

[wardoc]

Здравствуйте, уважаемые.

Статистический софт на этом форуме удостоился обсуждения, а вот мнений про софт для морфометрии не нашел. Подскажите видел кто нибудь что нибудь на эту тему?
Находил в инете демо-версию программы Видео-тест морфометрия. Кто знает сколько стоит? И стоит ли пользоваться? И есть ли альтернативы?

[nokh]

С камерой не работал, сталкивался только с морфометрией фотоматериалов и сканированных листочков растений. Есть небольшая бесплатная - UTHSCSA ImageTool, не фонтан по удобству, но работать можно: http://ddsdx.uthscsa.edu/dig/itdesc.html (дипломники работали ). Измеряет углы, расстояния, площади. Есть какие-то фильтры, возможно нужные для анализа именно медицинских фото, т.к. созавалась медиками. Более широко известна Scion Image, проект существует очень давно. Тоже бесплатна, но требуется регистрация: http://www.scioncorp.com/pages/scion_image_windows.htm. Не знаю работают ли они с камерой. Насколько помню неплохая платная программка - Bersoft Image Measurement. Ведет протокол измерений. Пишут, что может измерять изображения from TWAIN scanners and digital cameras or from live video sources: http://bersoft.com/bimagem/index.htm
Чтобы сообщение не было офтопом в этом форуме сообщу также, что в сети можно найти книги по статистическому анализу морофометрических данных:
- Lele S.R & Richtsmeier J.T. (2001) An Invariant Approach to Statistical Analysis of Shapes. Chapman &. Hall/CRC. 308 p. (встречается в виде 4,8 Мб rar-архива pdf-документов).
- Geometric Morphometrics for Biologists : A Primer. (Hard cover book) ISBN:9780127784601
Zelditch, Miriam Leah /Swiderski, Donald L. /Sheets, David H. /Fink, W /Publisher:Academic Pr Published 2004/07 (14 Mб rar-архива pdf-документов)

[Игорь]

Найти искомое ПО несложно. Вот тут http://www.videotest.ru/.

Наши морфологи пользуются данной программой и довольны.

Насчет цены сказать трудно. Данное ПО близко к заказному. Продажи, судя по специфике, единичные. Поэтому цена определяется индивидуально. Свяжитесь с менеджером по электронной почте и обсудите.

Об аналогах. Насколько мне известно, ПО данного класса некоторые разрабатывают для себя самостоятельно (в тех исследовательских медучреждениях, в которых каким-то чудом еще сохранились программисты), т.к. емкость данного рынка ПО приближается к нулю. Мне встречалось приятное самодельное ПО для выполнения отдельных задач морфометрии, сделанное в виде дополнительных подключаемых модулей (plug-ins) для широко известной графической программы Adobe PhotoShop.

Интересно, что формат дополнительных модулей PhotoShop поддерживают многие графические пакеты, в том числе и бесплатные, как GIMP. Поэтому теоретически возможна реализация морфометрической системы на полностью бесплатном ПО.

[Константин]

Глубокоуважаемые коллеги! Неужели вы действительно этого не видели?
http://rsb.info.nih.gov/ij/
http://zmmu.msu.ru/personal/pavlinov/pavlinov.htm
http://en.wikipedia.org/wiki/Morphometric
http://life.bio.sunysb.edu/morph/
На нашем веселом постсоветском пространстве все ищут, что бы заплатить за бесплатное. А где денег взять?
Самые находчивые жмут из студентов. А коммунизм давно за бугор переехал. Все протоколы открыты. Реактивы, правда, действительно никто не подарит. Зарубежными методиками не только пользоваться нужно, но их активно обсуждать, чего и желаю. В программах этих, действительно не все идеально. Надо дописывать, дорабатывать. Коды - открытые.
Есть очень интересный КОМПАС-ГРАФИК. Он иногда даже удобнее. Но как в бесплатную версию картинку импортировать? Вот это спросите у инженеров и расскажите на сайте.
С пожеланием успехов

[Константин]

Могу немножко о самопальном морфометрическом и притом программном. Как вы докажите, что это может служить средством измерения? КОМПАС-ГРАФИК, например, сертифицирован, а самопальное пойдет на рецензирование ВАК. Будет повод пообщаться и с метрологами, и со статистиками!

[Константин]

P.S. Дописываю, поскольку боюсь напугать Кендалловыми пространствами и Прокрустовым преобразованием. Математика там иногда довольно своеобразная. Но геометрическая морфометрия нужна для разведочного анализа. Для ответа на вопрос: а действительно ли существенно изменилась форма? А затем снова нужно анализировать расстояния, углы, кривизны, сплайны. очень похоже на дисперсионный и регрессионный анализ.