Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> Анализ медицинских данных в R и SAS
hot_assay
сообщение 26.03.2014 - 17:47
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 5
Регистрация: 26.03.2014
Пользователь №: 26244



Здравствуйте!
Буду благодарен за рекомендации по использованию R и SAS в анализе данных клинических исследований (хотя бы минимальные, общего характера, с учётом того, что пользователю, привыкшему к Graphical user interface, нужно въехать в специфику рассматриваемо ПО laugh.gif )) . Интересуют преимущества данных систем по сравнению с другими (например, Statsoft STATISTICA). Какие модули необходимо иметь для решения медицинских задач? Заменяют ли R и SAS друг друга в плане фукционала? Отдельное спасибо за ссылки с практическими примерами по рассматриваемому вопросу.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
hot_assay
сообщение 27.03.2014 - 05:34
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 5
Регистрация: 26.03.2014
Пользователь №: 26244



Цитата(p2004r @ 26.03.2014 - 19:56) *
Вы забыли описать что за медицинские задачи предполагается решать.

Спасибо за ссылки!
В том-то и дело, что не хотелось акцентировать внимание на каких-то частных задачах, меня интересует универсальность указанного выше ПО. Навскидку - стандартный набор инструментов (описательная статистика, таблицы сопряжённости, дисперсионный анализ, непараметрика и т.п.), многомерные методы, биоэквивалентность и фармакокинетическое моделирование (+графические возможности в плане построения кинетических кривых). И всё-таки: что лучше - R или SAS? (по совокупности критериев - универсальность, удобство работы и т.д.)
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
DoctorStat
сообщение 27.03.2014 - 09:59
Сообщение #3





Группа: Пользователи
Сообщений: 377
Регистрация: 18.08.2008
Из: Москва Златоглавая
Пользователь №: 5224



Цитата(hot_assay @ 27.03.2014 - 06:34) *
И всё-таки: что лучше - R или SAS? (по совокупности критериев - универсальность, удобство работы и т.д.)
SAS - всеми признанный пакет для статистических расчетов, а R - пакет программ, написанный студентами в перерыве между лекциями.


Signature
Просто включи мозги => http://doctorstat.narod.ru
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
TheThing
сообщение 27.03.2014 - 10:44
Сообщение #4





Группа: Пользователи
Сообщений: 116
Регистрация: 20.02.2011
Пользователь №: 23251




1) Первая и, наверное, самая главная причина, почему люди предпочитают SAS - это история, традиция и привычка. SAS работает начиная с 1970 года, R - значительно моложе. За эти годы в фармацевтических компаниях и банках было написано столько кода, что придется потратить десятилетия, чтобы переписать это на R. Никто этого делать не будет, поэтому все "серьезные" организации и конторы с историей работали и будут работать в SAS.

2) Качество литературы все таки на голову выше в SAS - про R в последние годы вышло довольно много хороших книг, однако в целом, еще не дотягивает до SAS - если в R отдельные книги хороши, то в SAS каждая книга - шедевр.

3) Функционал R поразительно возрастает с помощью пакетов, однако есть обалденные пакеты, а есть - откровенная лажа, поэтому Вам необходимо искать и хорошо искать, чтобы быть уверенным в корректном анализе. За качество функционала SAS отвечает SAS Institute - монстр с многолетней историей.

4) Для анализа данных за последние 15 лет, которые могут занимать несколько десятков гигабайт, в SAS можно обработать на машине с 4 Гб памяти, R - все данные хранит в ОЗУ, поэтому здесь могут возникнуть проблемы. И хотя есть обходные пути, которые позволяют обработать данные в R, которые занимают больше памяти, чем имеется на машине, над этим приходится шаманить, а в SAS все работает out-of-the-box.

5) Если в R что-то полетит или однажды он сойдет с ума у Вас на компе, разруливать эту ситуацию и форматировать жесткий диск будете Вы сами, а в SAS Вам всегда окажут техническую помощь в любое время суток SAS Institute.

6) SAS имеет несколько корявый синтаксис, но это дело привычки - за 30 лет пользования Вы этого не заметите.

7) Вы в курсе про стоимость SAS?

Не сочтите за рекламу SAS - сам пользуюсь и буду сидеть на R laugh.gif

Сообщение отредактировал TheThing - 27.03.2014 - 10:44
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
p2004r
сообщение 27.03.2014 - 10:53
Сообщение #5





Группа: Пользователи
Сообщений: 1091
Регистрация: 26.08.2010
Пользователь №: 22699



Цитата(TheThing @ 27.03.2014 - 10:44) *
1) Первая и, наверное, самая главная причина, почему люди предпочитают SAS - это история, традиция и привычка. SAS работает начиная с 1970 года, R - значительно моложе. За эти годы в фармацевтических компаниях и банках было написано столько кода, что придется потратить десятилетия, чтобы переписать это на R. Никто этого делать не будет, поэтому все "серьезные" организации и конторы с историей работали и будут работать в SAS.

2) Качество литературы все таки на голову выше в SAS - про R в последние годы вышло довольно много хороших книг, однако в целом, еще не дотягивает до SAS - если в R отдельные книги хороши, то в SAS каждая книга - шедевр.

3) Функционал R поразительно возрастает с помощью пакетов, однако есть обалденные пакеты, а есть - откровенная лажа, поэтому Вам необходимо искать и хорошо искать, чтобы быть уверенным в корректном анализе. За качество функционала SAS отвечает SAS Institute - монстр с многолетней историей.

4) Для анализа данных за последние 15 лет, которые могут занимать несколько десятков гигабайт, в SAS можно обработать на машине с 4 Гб памяти, R - все данные хранит в ОЗУ, поэтому здесь могут возникнуть проблемы. И хотя есть обходные пути, которые позволяют обработать данные в R, которые занимают больше памяти, чем имеется на машине, над этим приходится шаманить, а в SAS все работает out-of-the-box.

5) Если в R что-то полетит или однажды он сойдет с ума у Вас на компе, разруливать эту ситуацию и форматировать жесткий диск будете Вы сами, а в SAS Вам всегда окажут техническую помощь в любое время суток SAS Institute.

6) SAS имеет несколько корявый синтаксис, но это дело привычки - за 30 лет пользования Вы этого не заметите.

7) Вы в курсе про стоимость SAS?

Не сочтите за рекламу SAS - сам пользуюсь и буду сидеть на R laugh.gif


"Дед Мороз существует!" ТМ


Signature
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- hot_assay   Анализ медицинских данных в R и SAS   26.03.2014 - 17:47
- - p2004r   Цитата(hot_assay @ 26.03.2014 - 17:4...   26.03.2014 - 18:56
- - hot_assay   Цитата(p2004r @ 26.03.2014 - 19:56) ...   27.03.2014 - 05:34
|- - DoctorStat   Цитата(hot_assay @ 27.03.2014 - 06:3...   27.03.2014 - 09:59
||- - TheThing   1) Первая и, наверное, самая главная причина, поче...   27.03.2014 - 10:44
|||- - p2004r   Цитата(TheThing @ 27.03.2014 - 10:44...   27.03.2014 - 10:53
||||- - TheThing   Цитата(p2004r @ 27.03.2014 - 11:53) ...   27.03.2014 - 12:45
||||- - p2004r   Цитата(TheThing @ 27.03.2014 - 12:45...   27.03.2014 - 22:33
||||- - TheThing   Цитата(p2004r @ 27.03.2014 - 22:33) ...   28.03.2014 - 11:17
||||- - p2004r   Цитата(TheThing @ 28.03.2014 - 11:17...   29.03.2014 - 10:49
|||- - DoctorStat   Цитата(TheThing @ 27.03.2014 - 11:44...   27.03.2014 - 12:53
||- - p2004r   Цитата(DoctorStat @ 27.03.2014 - 09...   27.03.2014 - 10:52
||- - Вале а   Цитата(DoctorStat @ 27.03.2014 - 10...   11.10.2014 - 16:33
|- - p2004r   Цитата(hot_assay @ 27.03.2014 - 05:3...   27.03.2014 - 10:57
- - hot_assay   Всем большое спасибо за информацию! Возникает ...   27.03.2014 - 16:34
|- - p2004r   Цитата(hot_assay @ 27.03.2014 - 16:3...   27.03.2014 - 22:36
- - DrgLena   Ответ есть не только в сети, но и на этом форуме...   27.03.2014 - 18:04
- - TheThing   Не с целью продолжения холивара на тему языков про...   15.09.2014 - 13:59
|- - p2004r   Цитата(TheThing @ 15.09.2014 - 13:59...   13.10.2014 - 13:10
|- - TheThing   Цитата(p2004r @ 13.10.2014 - 13:10) ...   23.10.2014 - 07:09
|- - p2004r   Цитата(TheThing @ 23.10.2014 - 07:09...   23.10.2014 - 19:35
||- - TheThing   Цитата(p2004r @ 23.10.2014 - 19:35) ...   23.10.2014 - 21:07
||- - p2004r   Цитата(TheThing @ 23.10.2014 - 21:07...   23.10.2014 - 22:16
|- - p2004r   Цитата(TheThing @ 23.10.2014 - 07:09...   23.10.2014 - 20:49
|- - TheThing   Цитата(p2004r @ 23.10.2014 - 20:49) ...   23.10.2014 - 21:21
|- - p2004r   Цитата(TheThing @ 23.10.2014 - 21:21...   23.10.2014 - 22:03
|- - TheThing   Цитата(p2004r @ 23.10.2014 - 22:03) ...   23.10.2014 - 23:29
|- - p2004r   Цитата(TheThing @ 23.10.2014 - 23:29...   24.10.2014 - 11:33
|- - p2004r   Кодfunction (mat, vec, k) { b <- 1 ...   24.10.2014 - 19:48
- - Вале а   Вы смотрели научно-художественный боевик "R п...   24.10.2014 - 17:48


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему