Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> Процентное содержание фракций, правильно обработать данные
Света K
сообщение 23.11.2017 - 16:13
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 19
Регистрация: 15.12.2011
Пользователь №: 23369



Имеются данные (процентное содержание фракций A, B и C (столбцы 2-4) и общее количество (столбец 1) определенных липидов в плазме), взятые у одного контрольного индивида (1) и полсотни испытуемых (2-48) после воздействия неким агентом. Как правильно статистически обработать эти данные, и какие и чем обоснованные выводы в результате можно сделать?
Прикрепленные файлы
Прикрепленный файл  Фракционный_состав.zip ( 646 байт ) Кол-во скачиваний: 252
 
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
nokh
сообщение 23.11.2017 - 22:46
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 1202
Регистрация: 13.01.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 4704



>p2004r
С обычным PCA здесь засада в виде композиционного характера данных. Где проходит граница допустимой степени "композиционности" не известно. Но традиционно для долей процентов (типа миллиграммы на литр или килограмм) ей пренебрегают и скорее всего обосновано. Но когда речь идёт о % и десятках процентов, композиции будут натягивать ложные корреляции. С 1990-х для многомерного анализа композиционных данных используют статистику Эйчисона, в т.ч. специальные предварительные преобразования "разворачивающие" constrained данные в как бы независимые. Разбирался давно и использовал ещё аддон к экселю "CoDaPack". Сейчас это есть в r, но пока не было подходящей задачи:
http://www.stat.boogaart.de/compositions/
https://cran.r-project.org/web/packages/rob...ions/index.html
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
p2004r
сообщение 24.11.2017 - 01:35
Сообщение #3





Группа: Пользователи
Сообщений: 1091
Регистрация: 26.08.2010
Пользователь №: 22699



Цитата(nokh @ 23.11.2017 - 22:46) *
>p2004r
С обычным PCA здесь засада в виде композиционного характера данных. Где проходит граница допустимой степени "композиционности" не известно. Но традиционно для долей процентов (типа миллиграммы на литр или килограмм) ей пренебрегают и скорее всего обосновано. Но когда речь идёт о % и десятках процентов, композиции будут натягивать ложные корреляции. С 1990-х для многомерного анализа композиционных данных используют статистику Эйчисона, в т.ч. специальные предварительные преобразования "разворачивающие" constrained данные в как бы независимые. Разбирался давно и использовал ещё аддон к экселю "CoDaPack". Сейчас это есть в r, но пока не было подходящей задачи:
http://www.stat.boogaart.de/compositions/
https://cran.r-project.org/web/packages/rob...ions/index.html



PCA прекрасно расправляет "смеси" в тернарные трафики, отжимая лишнюю размерность. Здесь просто крайне мал размах варьирования состава, вот и не видно результирующего "треугольника(пирамиды)".


Signature
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- Света K   Процентное содержание фракций   23.11.2017 - 16:13
- - p2004r   Цитата(Света K @ 23.11.2017 - 16:13)...   23.11.2017 - 19:49
|- - Света K   Цитата(p2004r @ 23.11.2017 - 20:49) ...   29.11.2017 - 01:09
|- - p2004r   Цитата(Света K @ 29.11.2017 - 01:09)...   29.11.2017 - 12:25
|- - Света K   Ответить раньше не было возможности, - другие идеи...   1.12.2017 - 15:47
- - passant   Ну у вас и примерчики. То выборки из четырех элмен...   23.11.2017 - 22:43
- - nokh   >p2004r С обычным PCA здесь засада в виде компо...   23.11.2017 - 22:46
|- - p2004r   Цитата(nokh @ 23.11.2017 - 22:46) ...   24.11.2017 - 01:35
||- - nokh   Цитата(p2004r @ 24.11.2017 - 03:35) ...   27.11.2017 - 06:51
|- - p2004r   Цитата(nokh @ 23.11.2017 - 22:46) ...   24.11.2017 - 08:56
- - Света K   Цитата(p2004r @ 23.11.2017 - 20:49) ...   24.11.2017 - 10:30
|- - p2004r   Цитата(Света K @ 24.11.2017 - 10:30)...   24.11.2017 - 11:06
|- - p2004r   Цитата(Света K @ 24.11.2017 - 10:30)...   24.11.2017 - 11:13
|- - passant   Цитата(Света K @ 24.11.2017 - 10:30)...   24.11.2017 - 14:38
- - Света K   Цитата(p2004r @ 23.11.2017 - 20:49) ...   24.11.2017 - 18:45
|- - p2004r   Цитата(Света K @ 24.11.2017 - 18:45)...   24.11.2017 - 21:55
||- - Света K   Цитата(p2004r @ 24.11.2017 - 22:55) ...   27.11.2017 - 14:51
||- - 100$   Цитата(Света K @ 27.11.2017 - 14:51)...   27.11.2017 - 17:59
|- - p2004r   Цитата(Света K @ 24.11.2017 - 18:45)...   25.11.2017 - 20:14
- - comisora   2 p2004r Добрый вечер. У Вас df.rand1 <- t(app...   25.11.2017 - 22:48
|- - p2004r   Цитата(comisora @ 25.11.2017 - 22:48...   26.11.2017 - 20:02
- - comisora   2 p2004r, nokh Спасибо за информацию. Оставлю то,...   28.11.2017 - 20:27
- - nokh   Я тут подумал и решил усомниться в исходно компози...   29.11.2017 - 00:25


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему