Генотип, ко-факторы, исход, как анализировать? |
Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )
Генотип, ко-факторы, исход, как анализировать? |
15.06.2014 - 14:09
Сообщение
#1
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 24 Регистрация: 11.06.2014 Пользователь №: 26460 |
Здравствуйте, коллеги! Прошу помощи в анализе данных.
Задача исследования - оценить связь между генотипом (15 SNP), "промежуточным фенотипом" (параметры биохимии, иммунологии и др.), исходом (ЗНО есть/нет). Существующий сервис "SNPstats" (http://bioinfo.iconcologia.net/SNPstats_web) выдает отношения шансов, "adjustet by фактор1+фактор2+...", используется при этом "logistic regression models" (то есть, логит-регрессию?). Хотелось бы поточнее узнать, что значит "adjusted by". Кроме того, в данной програме остается "за кадром", какой из факторов является ведущим. Возможно, есть какие то альтернативные методы анализа, позволяющие оценить вклад конкретных факторов? Посоветуйте, пожалуйста. Заранее благодарен. И есть ещё один вопрос: По разным SNP имеется разное количество генотипированных, как и разное количество известных значений по каждому из "промежуточных фенотипов" и исходов. То есть, грубо говоря, выборки по каждому из SNP перекрываются только отчасти. Нужно ли в этом случае рассматривать проблему множественных сравнений? Спасибо! |
|