Зависимость локализации поражения от породы |
Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )
Зависимость локализации поражения от породы |
6.05.2018 - 15:26
Сообщение
#1
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 13 Регистрация: 5.05.2018 Пользователь №: 31338 |
Здравствуйте. Я ветеринарный врач, увлечена клиническими исследованиями. Самоучка, так как в российской ветеринарной медицине этого направления пока нет. Поэтому прошу прощения за возможно глупые вопросы. Коллеги попросили помочь с исследованием: оценка породной предрасположенности к определенной локализации и характеру кожных поражений у собак. Есть 8 пород (в исследование включались породы, где было 3 и больше пациентов) - всего 77 собак, и в качестве контрольной группы собаки, которых было представлено только по 1-2 штуки из породы (всего 11). Локализаций поражений 24. Правильно ли я понимаю: 1.Это описательное исследование (зависимость локализации поражения от породы, нет вмешательства, нет исхода) и поэтому контрольная группа не нужна (но так посоветовал профессор из Германии..)? 2.Поскольку это независимые номинальные переменные (есть/нет поражения в этой области тела у этой породы), я должна провести анализ таблиц сопряженности для всех пар признаков? 3.Тот же профессор посоветовал использовать поправку Бонферрони, но я не уверена, что она тут к месту.. Буду благодарна за помощь и советы. |
|
29.08.2018 - 12:51
Сообщение
#2
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 13 Регистрация: 5.05.2018 Пользователь №: 31338 |
1.Дизайн исследования предполагает оценку взаимосвязи породы и типов воспаления, породы и локализаций, породы и типов воспаления в разных локализациях.
Мне не очень понятно, что значит "самому придумывать уровни факторов" и почему конструкция искусственная. Именно эти переменные (точнее, их взаимосвязь с породой) интересуют исследователей. С клинической точки зрения неверно комбинацию бактерии+грибы оценивать как простую сумму. Каждый из этих 3 типов воспаления (бактериальное, грибковое, комбинированное) - самостоятельный параметр. По крайней мере, дизайном исследования именно это подразумевается. То есть это примерно то же самое, как обозначить, например, наличие хеликобактера в желудке и гастрита за единицы, а язву желудка - как сумму двух единиц (пример корявый, да). 2.Так породы на дамми и разложены, нет? Принадлежность к интересуемой породе - 1, все остальные - 0. |
|
31.08.2018 - 22:48
Сообщение
#3
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 1091 Регистрация: 26.08.2010 Пользователь №: 22699 |
1.Дизайн исследования предполагает оценку взаимосвязи породы и типов воспаления, породы и локализаций, породы и типов воспаления в разных локализациях. Мне не очень понятно, что значит "самому придумывать уровни факторов" и почему конструкция искусственная. Именно эти переменные (точнее, их взаимосвязь с породой) интересуют исследователей. С клинической точки зрения неверно комбинацию бактерии+грибы оценивать как простую сумму. Каждый из этих 3 типов воспаления (бактериальное, грибковое, комбинированное) - самостоятельный параметр. По крайней мере, дизайном исследования именно это подразумевается. То есть это примерно то же самое, как обозначить, например, наличие хеликобактера в желудке и гастрита за единицы, а язву желудка - как сумму двух единиц (пример корявый, да). 2.Так породы на дамми и разложены, нет? Принадлежность к интересуемой породе - 1, все остальные - 0. 1. Не надо путать клиническую и математическую постановку. Все вот эти лишние столбики в суммарной статистике поражения благоглупости. Есть два независимых бинарных фактора -- "наличие грибка" и "наличие бактерий" без избыточности все описывающие, и никаких "грибок + бактерия" и "ничего нет" добавлятть не нужно. Что то такое дописывать в данные это и называется "самому придумывать уровни". Никаких степеней свободы в описание выборки эти взаимозависимые переменные не добавляют, а значит ни о каких "самостоятельных параметрах" фантазировать просто нет оснований. Ну не может например одновременно быть "наличие грибка" и "грибок+бактерия" в придуманной вами кодировке, а значит нет никакого "самостоятельного параметра" "грибок + бактерия". Перекодировать все эти введенные area_i_X во вменяемый вид (бинарные area_i_yearn и area_i_yeast) я простите не нанимался (это не интересная чисто техническая работа). Для общей статистики без локализации поражения данные трансформировал и озвучил результат в предыдущем посте. 2. Породы в таблице во втором столбце исходно как breed_i закодированы. Это никак не тянет на 0-1. |
|