Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> PCA для временной серии
nokh
сообщение 11.05.2019 - 22:05
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 1202
Регистрация: 13.01.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 4704



Насколько корректно применять анализ главных компонент к временным рядам? Полазил по зарубежным форумам и увидел разные мнения. То, что так считают и есть много публикаций - факт, однако PCA основан на корреляциях, для которых требование независимости наблюдений в выборке нарушена. Хочу применить к медицинским данным: динамика изменения 5-7 показателей (температура, ЧСС, АД и др.) у отельного пациента в течение 30 дней после операции.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
nokh
сообщение 12.05.2019 - 11:09
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 1202
Регистрация: 13.01.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 4704



Большое спасибо, читал и подобное (и даже сам учил студентов:)). Но вот задумал интересную штуку и закрались сомнения, т.к. нужно чтобы было максимально корректно...
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
p2004r
сообщение 12.05.2019 - 22:10
Сообщение #3





Группа: Пользователи
Сообщений: 1091
Регистрация: 26.08.2010
Пользователь №: 22699



Цитата(nokh @ 12.05.2019 - 11:09) *
Большое спасибо, читал и подобное (и даже сам учил студентов:)). Но вот задумал интересную штуку и закрались сомнения, т.к. нужно чтобы было максимально корректно...


1) Если "читали и учили", то странные вопросы задаете. Но впрочем с удовольствием обсужу восстановление матриц описывающих динамическую систему со знающим человеком. smile.gif

"30 дней" это как? Сколько "замеров в день"? Если 1 и 1 пациент, то можно забыть о затее.

2) Что касается pdf с извращениями "здесь мы средние извлекаем и нормируем, а здесь как есть оставляем и все очень быстро в реалтайме делаем", то это увы "не о чём"ТМ. Скользящее среднее получается естественным образом из первых членов разложения матрицы Генкеля построенной по временному ряду (эти я баловался еще в 90е smile.gif, а оказывается "прозой говорил"(С) ). Не удивлюсь если одно через другое выразить можно.

Ну а варианты разложений PCA для тензоров "естественным образом" позволяют обрабатывать многомерные временные ряды.

Сообщение отредактировал p2004r - 12.05.2019 - 22:13


Signature
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
nokh
сообщение 14.05.2019 - 15:55
Сообщение #4





Группа: Пользователи
Сообщений: 1202
Регистрация: 13.01.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 4704



Цитата(p2004r @ 13.05.2019 - 00:10) *
1) Если "читали и учили", то странные вопросы задаете. Но впрочем с удовольствием обсужу восстановление матриц описывающих динамическую систему со знающим человеком. smile.gif
"30 дней" это как? Сколько "замеров в день"? Если 1 и 1 пациент, то можно забыть о затее.

Когда 3 работы, а круг интересов ещё шире, то всегда что-то недочитаешь unknw.gif . И только углубившись в какую-то тему начинаешь понимать как много недочитано...
По поводу данных: с ними всё нормально. Это пациенты из реанимации гнойной хирургии крупной больницы, т.е. места, куда свозят самых тяжёлых пациентов со всех отделений и где летальность ещё несколько лет назад доходила до 30%. Их состояние мониторится по ряду показателей ежедневно, по ряду - как-то периодически, но их хватает, чтобы считать шкалы Ranson, Apache II, SOFA и др. не по разу. Т.е. матрица данных получается именно такая: для каждого пациента несколько показателей ежедневно и на протяжении всего срока пребывания в реанимации или до смерти. Один человек - одна матрица. Думаю потенциал анализа подобных данных для медицины большой, но меня сейчас интересуют другие вещи. Т.е. вопрос о восстановлении матриц не стоит. Я возможно даже интерпретировать компоненты не буду, т.к. не уверен, что справлюсь с интерпретацией, а брать соавторов в эту работу не хочу. Получится - выложу сюда готовую статью с кодом R.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему