ROC-анализ, определение чувствительности и специфичности метода |
Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )
ROC-анализ, определение чувствительности и специфичности метода |
20.04.2015 - 12:42
Сообщение
#46
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 1091 Регистрация: 26.08.2010 Пользователь №: 22699 |
Спасибо. Подскажите пожалуйста еще, принят ли какой-нибудь диапазон значений индекса Юдена для поиска порога, или чем он больше тем лучше? А как вы себе представляете "диапазон" вот в такой статистике? Это просто набор значений рассчитанный для каждой точки ROC. |
|
20.04.2015 - 13:55
Сообщение
#47
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 94 Регистрация: 18.06.2014 Пользователь №: 26469 |
Большое спасибо
|
|
20.04.2015 - 14:16
Сообщение
#48
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 94 Регистрация: 18.06.2014 Пользователь №: 26469 |
Подскажите еще пожалуйста. Где-то нашёл формулу Юдена в следующем виде: Se+Sp-1. Она применима? И что значит "max" в предложенной Вами формуле?
|
|
20.04.2015 - 15:08
Сообщение
#49
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 1091 Регистрация: 26.08.2010 Пользователь №: 22699 |
Подскажите еще пожалуйста. Где-то нашёл формулу Юдена в следующем виде: Se+Sp-1. Она применима? И что значит "max" в предложенной Вами формуле? Это есть операция получения максимального значения, она может вернуть несколько одинаковых значений (или вообще все если все точки ROC "лягут" на диагональ). Важно понимать, что это просто сортирует точки ROC кривой по убыванию этого индекса, и решение это сама точка отсечения, а не этот несчастный индекс. Все точки ROC одинаково значимы если вы ничего не знаете о ситуации в которой собрались применять рассчитанную модель. Крайне рекомендую пользоваться вариантом расчета индекса с весами, а "просто эффективность" описывать интегральными характеристиками ROC. |
|
8.12.2019 - 22:32
Сообщение
#50
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 7 Регистрация: 7.12.2019 Пользователь №: 37140 |
Подскажите пожалуйста, где можно почитать про выбор оптимальной точки отсечения?
Когда мне на пальцах объясняли эту тему, у меня отложилось, что точка отсечения - это где Sp=Se,то есть их пересечение. Но оказалось, что есть ещё десяток методов... в.т.ч критерий Юдена. Есть ли какой-то критерий для сравнения данных данных подходов? |
|
9.12.2019 - 00:30
Сообщение
#51
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 1202 Регистрация: 13.01.2008 Из: Челябинск Пользователь №: 4704 |
Подскажите пожалуйста, где можно почитать про выбор оптимальной точки отсечения? Когда мне на пальцах объясняли эту тему, у меня отложилось, что точка отсечения - это где Sp=Se,то есть их пересечение. Но оказалось, что есть ещё десяток методов... в.т.ч критерий Юдена. Есть ли какой-то критерий для сравнения данных данных подходов? С Юденом как раз всё просто, прочитать немного можно здесь со стр. 201 и далее: https://yadi.sk/d/g50i73pt3J6pAa Сложнее обоснованно отклоняться в сторону увеличения Ч или Сп. Там преимущественно нужно считать экономические показатели. Например,если заболевание редкое (низкий преваленс), а Сп не 100%-ная, то можно просто разориться на проведённых впустую обследованиях здоровых... Но может кто-нибудь на форуме и имеет опыт подобных расчётов. Сообщение отредактировал nokh - 9.12.2019 - 00:46 |
|
9.12.2019 - 18:49
Сообщение
#52
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 1091 Регистрация: 26.08.2010 Пользователь №: 22699 |
Подскажите пожалуйста, где можно почитать про выбор оптимальной точки отсечения? Когда мне на пальцах объясняли эту тему, у меня отложилось, что точка отсечения - это где Sp=Se,то есть их пересечение. Но оказалось, что есть ещё десяток методов... в.т.ч критерий Юдена. Есть ли какой-то критерий для сравнения данных данных подходов? Если известна ожидаемая частота детектируемых методом случаев и соотношение цены ошибок первого и второго рода, то решение просто получается по формуле Youden в модификации Perkins и Schisterman. В том числе и предельные случаи: "детектировать все подряд" и "ни на что не реагировать, дешевле будет". |
|
9.12.2019 - 19:20
Сообщение
#53
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 7 Регистрация: 7.12.2019 Пользователь №: 37140 |
На самом деле я пытаюсь применить данную методику не совсем по назначению, а для поиска точки отсечения количественного предиктора в модели бинарной логистической регрессии.
Ведь практическая значимость результата выше при выделении точки отсечения. Например, "исходный уровень тромбоцитов перед операцией увеличивает шанс развития тромбоза чего-нибудь (ОШ, 95% ДИ, p=)", лучше выразить для практики как "исходный уровень тромбоцитов более 333 увеличивает шанс развития тромбоза чего-нибудь (ОШ, 95% ДИ, p=)". И вот для перевода количественного предиктора в качественный я и пытаюсь применить поиск точки отсечения в ROC-анализе. Заранее извиняюсь, если где=то какие-то глупости... пока пытаюсь разобраться в основах.. |
|
11.12.2019 - 14:11
Сообщение
#54
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 1114 Регистрация: 10.04.2007 Пользователь №: 4040 |
На самом деле я пытаюсь применить данную методику не совсем по назначению, а для поиска точки отсечения количественного предиктора в модели бинарной логистической регрессии. Ведь практическая значимость результата выше при выделении точки отсечения. Например, "исходный уровень тромбоцитов перед операцией увеличивает шанс развития тромбоза чего-нибудь (ОШ, 95% ДИ, p=)", лучше выразить для практики как "исходный уровень тромбоцитов более 333 увеличивает шанс развития тромбоза чего-нибудь (ОШ, 95% ДИ, p=)". И вот для перевода количественного предиктора в качественный я и пытаюсь применить поиск точки отсечения в ROC-анализе. Заранее извиняюсь, если где=то какие-то глупости... пока пытаюсь разобраться в основах.. Строгое обоснование https://cyberleninka.ru/article/n/otsenka-k...ikatorov/viewer (в т.ч. раздел о значимости весовых коэффициентов) и ссылки на странице в разделе "похожие статьи" Сообщение отредактировал Игорь - 11.12.2019 - 14:26 Ebsignasnan prei wissant Deiws ainat! As gijwans! Sta ast stas arwis!
|
|
28.02.2020 - 22:16
Сообщение
#55
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 5 Регистрация: 15.05.2016 Пользователь №: 28268 |
Спасибо большое. Хотя в библиотеках она имеется, электронным вариантом пользоваться предпочтительнее. Качество, действительно, неважное. Первые 2 главы - один лист на скан, остальные - 2 листа на скан. Нет также предисловия и [нормального] оглавления. Пользоваться трудно. Раз уж автор разрешил, отсканировал недостающее из печатной книги, да собрал в 2 файла PDF (если в один - много работы с разделением "сиамских близнецов" из 3-6 глав). Книга, действительно, стоящая. Понятно, информативно. Попробуйте ещё во эту книгу. Очень хорошо тут описано https://core.ac.uk/download/pdf/80150469.pdf |
|
10.04.2020 - 21:04
Сообщение
#56
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 9 Регистрация: 13.02.2019 Пользователь №: 32925 |
Многие исследователи желают применять ROC-анализ в своей работе. Поэтому, если можно, укажите, пожалуйста, ссылки на источники. Да, ROC-анализы действительно весьма продуктивны. Однако при этом они определяются не для одного лишь уравнения. А оптимально использовать это как раз для нескольких уравнений. И тогда можно выбирать самые лучшие уравнения. Вот почему я своим студентам как раз и предлагаю читать эти описания по адресам http://www.biometrica.tomsk.ru/ROC-analysis.pdf и http://www.biometrica.tomsk.ru/logit_4.htm . Рекомендую и Вам почитать эти статьи. Также ценно для использования таких ROC-кривых и тех уравнений, в которых более одного предиктора. И при этом можно сделать такие ROC-кривые как для всего уравнения со многими предикторами, так и раздельно ROC-кривые по каждому предиктору. |
|
24.04.2020 - 23:37
Сообщение
#57
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 4 Регистрация: 22.04.2020 Пользователь №: 38661 |
Добрый вечер, применим ли ROC-анализ для определения прогностической ценности порядковых или качественных переменных в диагностике какого-либо исхода? Или только для количественных данных?
|
|
26.04.2020 - 06:53
Сообщение
#58
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 1202 Регистрация: 13.01.2008 Из: Челябинск Пользователь №: 4704 |
Добрый вечер, применим ли ROC-анализ для определения прогностической ценности порядковых или качественных переменных в диагностике какого-либо исхода? Или только для количественных данных? Для порядковых - да, для качественных - только дихотомических (альтернативных, бинарных). Но в последнем случае при построении площади будет использоваться только одна точка над диагональю (или на диагонали), т.к. имеется только одна пара значений чувствительности и специфичности. Поэтому самостоятельной ценности такая штука не представляет, её имеет смысл использовать только для сопоставления диагностической эффективности разных показателей в разных шкалах (количественных, порядковых, качественных дихотомических), чтобы выразить их в одинаковых единицах - площадью под ROC-кривой. Сообщение отредактировал nokh - 26.04.2020 - 06:54 |
|