Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> IC50, Софт, Софт
grergi
сообщение 16.12.2017 - 16:36
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 43
Регистрация: 12.04.2014
Пользователь №: 26319



Уважаемые коллеги! Подскажите бесплатную программу для расчета IC50 (нелинейная регрессия). Заранее благодарен за любую помощь!
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
nokh
сообщение 18.12.2017 - 21:59
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 1202
Регистрация: 13.01.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 4704



Цитата(grergi @ 16.12.2017 - 18:36) *
Уважаемые коллеги! Подскажите бесплатную программу для расчета IC50 (нелинейная регрессия). Заранее благодарен за любую помощь!

Есть онлайновые калькуляторы - и считают, и графики (простенькие) строят:
https://www.aatbio.com/tools/ic50-calculator/
http://www.ic50.tk/index.html
Я раньше KyPlot для большинства регрессий и задач интерполяции использовал - прикипел я к нему smile.gif. Есть бесплатная старая версия - 2 beta 15. Скриншот прикрепил. Могу выложить, но только это всё в прошлое уходит. Из R пробовал пакет nplr - настройки по умолчанию не понравились, но зато сразу с 95% доверительными границами. В принципе вам подойдёт любой пакет, который считает четырёхпараметрическую логистическую регерссию (4PL regression). В последнее время она так всем полюбилась, что теперь отдыхают и Михаэлис - Ментен, и Берталанфи и другие...

Сообщение отредактировал nokh - 18.12.2017 - 22:20
Эскизы прикрепленных изображений
Прикрепленное изображение
 
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
grergi
сообщение 18.12.2017 - 22:50
Сообщение #3





Группа: Пользователи
Сообщений: 43
Регистрация: 12.04.2014
Пользователь №: 26319



Цитата(nokh @ 18.12.2017 - 21:59) *
Есть онлайновые калькуляторы - и считают, и графики (простенькие) строят:
https://www.aatbio.com/tools/ic50-calculator/
http://www.ic50.tk/index.html
Я раньше KyPlot для большинства регрессий и задач интерполяции использовал - прикипел я к нему smile.gif. Есть бесплатная старая версия - 2 beta 15. Скриншот прикрепил. Могу выложить, но только это всё в прошлое уходит. Из R пробовал пакет nplr - настройки по умолчанию не понравились, но зато сразу с 95% доверительными границами. В принципе вам подойдёт любой пакет, который считает четырёхпараметрическую логистическую регерссию (4PL regression). В последнее время она так всем полюбилась, что теперь отдыхают и Михаэлис - Ментен, и Берталанфи и другие...


nokh, большое спасибо, постараюсь разобраться в R. Онлайн калькуляторы и KyPlot предложенные Вами обязательно посмотрю! Если R не освою, попытаюсь в них разобраться. Спасибо!

Сообщение отредактировал grergi - 18.12.2017 - 22:57
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему