Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

 
Добавить ответ в эту темуОткрыть тему
> Сравнения средних рангов для всех групп
metalmary
сообщение 10.02.2021 - 12:24
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 9
Регистрация: 7.03.2018
Пользователь №: 31072



Здравствуйте!

В программе STATISTICA при анализе данных с помощью критерия Краскела-Уоллиса есть опция Сравнения средних рангов для все групп, который при расчете выдает Z-значения для множественных сравнений и уровень значимости p для каждой группы. Подходит ли этот метод для сравнений нескольких групп между собой? Или лучше воспользоваться тестом Манна-Уитни для сравнения каждой группы с другими (например, все группы сравнить с контролем)? Размер выборок очень маленький (n=6)
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
nokh
сообщение 11.02.2021 - 19:24
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 1202
Регистрация: 13.01.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 4704



Цитата(metalmary @ 10.02.2021 - 14:24) *
В программе STATISTICA при анализе данных с помощью критерия Краскела-Уоллиса есть опция Сравнения средних рангов для все групп, который при расчете выдает Z-значения для множественных сравнений и уровень значимости p для каждой группы. Подходит ли этот метод для сравнений нескольких групп между собой? Или лучше воспользоваться тестом Манна-Уитни для сравнения каждой группы с другими (например, все группы сравнить с контролем)? Размер выборок очень маленький (n=6)

1. Почитайте помощь к пакету, чтобы знать, какой критерий используется в нём для непараметрических апостериорных сравнений.
2. Для попарных сравнений и для сравнения с контрольной группой используют разные критерии, иначе при сравнении с контролем будет потеря в мощности. Есть ранговый аналог критерия Данетта - критерий Стила (Steel test).
3. Критерий Манна - Уитни использовать нельзя: он для сравнения двух групп и не удержит ошибку семейства гипотез (FWER) на заданном уровне значимости без поправок. А поправки при таких объёмах выборок смерти подобны.
4. Пакет Statistica мало того, что не умеет Стила, так ещё и считает значимость путём аппроксимации непараметрической статистики стандартным нормальным распределением. Подозреваю, что для n=6 это вообще некорректно. Лучше пакеты PAST, где есть рандомизационные процедуры Монте-Карло и точные рандомизационные подходы (Exact permutation) или KyPlot, где есть и Стил и Стил - Двасс - аналог Тьюки (это если без R, где есть всё).

Сообщение отредактировал nokh - 11.02.2021 - 19:27
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
Anna_V
сообщение 11.03.2021 - 16:14
Сообщение #3





Группа: Пользователи
Сообщений: 11
Регистрация: 25.04.2019
Пользователь №: 33997



Цитата(nokh @ 11.02.2021 - 20:24) *
1. Почитайте помощь к пакету, чтобы знать, какой критерий используется в нём для непараметрических апостериорных сравнений.
2. Для попарных сравнений и для сравнения с контрольной группой используют разные критерии, иначе при сравнении с контролем будет потеря в мощности. Есть ранговый аналог критерия Данетта - критерий Стила (Steel test).
3. Критерий Манна - Уитни использовать нельзя: он для сравнения двух групп и не удержит ошибку семейства гипотез (FWER) на заданном уровне значимости без поправок. А поправки при таких объёмах выборок смерти подобны.
4. Пакет Statistica мало того, что не умеет Стила, так ещё и считает значимость путём аппроксимации непараметрической статистики стандартным нормальным распределением. Подозреваю, что для n=6 это вообще некорректно. Лучше пакеты PAST, где есть рандомизационные процедуры Монте-Карло и точные рандомизационные подходы (Exact permutation) или KyPlot, где есть и Стил и Стил - Двасс - аналог Тьюки (это если без R, где есть всё).

Вы не подскажете, где можно скачать PAST? При переустановки системы потерялся, а по той ссылке, где качала обычно, уже нет его.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
nokh
сообщение 11.03.2021 - 17:40
Сообщение #4





Группа: Пользователи
Сообщений: 1202
Регистрация: 13.01.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 4704



Цитата(Anna_V @ 11.03.2021 - 18:14) *
Вы не подскажете, где можно скачать PAST? При переустановки системы потерялся, а по той ссылке, где качала обычно, уже нет его.

PAST: https://www.nhm.uio.no/english/research/infrastructure/past/
KyPlot: https://www.kyenslab.com/en-us/about-kyplot-6/ (сетап японский, при установке нужно не пугаться спецсимволов, соглашаться по умолчанию, после установки - обычный англлоязычный пакет)

PS В оба пакета добавляют потихоньку модули работы с картами
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Добавить ответ в эту темуОткрыть тему