Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> Статистика в иммунологии:, описательная статистика, сравнения, бутстреп
nokh
сообщение 12.02.2011 - 10:20
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 1202
Регистрация: 13.01.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 4704



Предлагаю участникам форума поделиться в этой ветке своим опытом анализа иммунологических данных. В последние месяцы намаялись с аспирантками иммунологами-иммуногенетиками с анализом их данных. Проблемы, которые хотелось бы обсудить:

(1) выраженные в % показатели иммунограммы после преобразования арксинуса или Фримана-Тьюки сохраняют асимметрию распределения. Пробовали Бокса-Кокса - получается; но ведь использование степенных преобразований для частот - чистейший эмпирический произвол?
(2) сложные асимметричные и, возможно, полимодальные распределения для одних показателей и ровненькие почти симметричные - для других. Получается, что даже интерлейкины не удаётся описать/сравнить единообразно.
(3) сложности с графическим представлением результатов дисперсионных анализов (ДА). Делали сложные ДА с перекрёстными и иерархическими эффектами после предварительного преобразования данных по Боксу-Коксу и получали таблицу значимости эффектов и их взаимодействий. Однако графики для непреобразованных или лог-преобразованных переменных совсем не совпадали с бокс-коксовскими. Получается, что значимые эффекты в сложной таблице результатов ДА не удаётся подкрепить графически, кроме как в никому непонятной шкале преобразования Бокса-Кокса.
(4) столь любимые иммунологами коробчатые графики (box-and-whiskers plot) не позволяют интерпретировать межгрупповые различия. А учитывая, что разные программы используют разные пороги для отнесения наблюдений к выбросам (причём для нормального распределения, что заведомо неверно) - вообще непонятно что на этих графиках изображается усами, а что выбросами. Причём авторитетных авторов статей это вообще никак не беспокоит. Вместе с тем логичные для таких данных графики с медианами и 95%-ными ДИ для медиан вообще не используются. Хотелось бы совместить на одном графике: медиану (линия), межквартильный размах (короб) и 95%-ные ДИ для медианы (усы), можно даже вручную, но не смог найти программу, где эти показатели для box-and-whiskers plot можно было бы задать вручную (мой любимый KyPlot не строит коробчатые графики:(( )

Позже выложу здесь 3 статьи по статистике в иммунологии (пока это только отвлечёт от описанных проблем), а также поделюсь нашими наработками по приведению иммунологической статистики к единообразному виду - пока на основе порядковых статистик, включая малоизвестные множественные сравнения в рамках непараметрических дисперсионных анализов Краскела-Уоллиса и Фридмана (могу с собранными формулами и примером). А позже хотелось бы обсудить ещё подход с бутстрепом.

Сообщение отредактировал nokh - 12.02.2011 - 10:21
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- nokh   Статистика в иммунологии:   12.02.2011 - 10:20
- - Yngi   Да в иммунологии можно пользоваться относительными...   14.02.2011 - 20:28
|- - nokh   Цитата(Yngi @ 14.02.2011 - 22:28) Да...   14.02.2011 - 22:57
- - DrgLena   Цитата(nokh @ 14.02.2011 - 22:57) А ...   15.02.2011 - 17:04
- - TheThing   Цитата(nokh @ 14.02.2011 - 22:57) Но...   21.02.2011 - 11:08
- - nokh   Цитата(TheThing @ 21.02.2011 - 13:08...   1.03.2011 - 05:46
- - nokh   3 статьи по статистике в иммунологии за 1992, 1997...   2.03.2011 - 12:23
|- - maxandron   Цитата(nokh @ 2.03.2011 - 12:23) 3 с...   24.09.2014 - 13:27
|- - nokh   Цитата(maxandron @ 24.09.2014 - 16:2...   24.09.2014 - 17:54
|- - maxandron   Цитата(nokh @ 24.09.2014 - 17:54) Хо...   26.09.2014 - 02:13
|- - bubnilkin   Цитата(nokh @ 24.09.2014 - 17:54) Хо...   13.09.2015 - 01:25
|- - nokh   Цитата(bubnilkin @ 13.09.2015 - 03:2...   14.09.2015 - 18:28
|- - p2004r   Цитата(nokh @ 14.09.2015 - 18:28) Ещ...   14.09.2015 - 20:54
|- - bubnilkin   Цитата(nokh @ 14.09.2015 - 18:28) .....   15.09.2015 - 16:35
|- - nokh   Цитата(bubnilkin @ 15.09.2015 - 18:3...   21.09.2015 - 09:35
- - bubnilkin   далеко от темы... http://onlinelibrary.wiley.com/...   9.09.2011 - 12:50
- - anserovtv   Считаю, что статистический анализ специфических да...   15.09.2015 - 21:28


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему