Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> Логистическая регрессия?
mamalita
сообщение 9.11.2011 - 11:07
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 49
Регистрация: 7.04.2010
Пользователь №: 15366



Добрый день! Прошу помощи в анализе данных. Мы имеем 100 человека больных с метастазами в печени, лечили их хирургическим путем и наблюдали их в течение 6 лет и диагностировали у них новые метастазы и рецидивы. Суть работы заключается в том, чтобы доказать, что реже всего на 1 и 2 годах наблюдения новые МТС возникают у пациентов с количеством МТС 2-3 (у нас были варианты количества от 2-6), и размер их должен быть 2-3 см. То есть кривая частоты прогресии имеет форму колокола обращенного вершиной вниз - 1 см - часто возникает прогрессия, больше 3 - тоже. Наиболее оптимальным является размер очага для хирургического лечения 2-3 см. Вопрос как представить эти данные и их анализировать: средний и суммарный размер не учитывают разницы: то ли у больного было 3 очага по 2 см то ли 1 и 6 см что совсем не благоприятно. Если брать каждый метастаз как отдельную переменную то у разных людей будет разное количество переменных (от 2 до 6штук), но этот вариант наиболее приемлем в соответствии с поставленной задачей. Теперь вопрос каким методом воспользоваться, чтобы доказать что идеальным для лечения является количество МТС 2-3 при размере 2-3см. Еще момент : размер МТС имеет мини манимальное округление до 0, 5 разброс от 1 до 6 см (т.е. всего 12 значений). Может быть их можно как-то объединить и логически видоизменить? Я уже просто голову сломала. Очень нужен свежий взгляд. Спасибо
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
DrgLena
сообщение 16.11.2011 - 19:22
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 1325
Регистрация: 27.11.2007
Пользователь №: 4573



Цитата(p2004r @ 16.11.2011 - 15:04) *
Топикстартер жалуется на проблему "как засунуть в регрессию переменное число показателей". По моему мнению мой способ работает.

Важно ведь не как засунуть, а что будет на выходе.
Покажите, пожалуйста как работает ваш способ, например, на тех же больных, которых привела я под номером 25 и 35. Покажите, 1) чему равна вероятность рецидива до года, 2) приведите рассчетное время рецидивирования в мес. А потом перейдем к кокс регрессии.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
p2004r
сообщение 16.11.2011 - 20:08
Сообщение #3





Группа: Пользователи
Сообщений: 1091
Регистрация: 26.08.2010
Пользователь №: 22699



Цитата(DrgLena @ 16.11.2011 - 18:22) *
Важно ведь не как засунуть, а что будет на выходе.
Покажите, пожалуйста как работает ваш способ, например, на тех же больных, которых привела я под номером 25 и 35. Покажите, 1) чему равна вероятность рецидива до года, 2) приведите рассчетное время рецидивирования в мес. А потом перейдем к кокс регрессии.


Сначала хотелось бы заметить что точность подгонки модели для данных участвовавших в оной крайне подозрительный показатель. Модель выбрана мной по критерию AIC а не минимуму вариации не объясняемой моделью. Только такая модель имеет прогностическую силу.

Как Вы наверное заметили у меня посчитана модель варианта 1

для первоначального разбиения на интервалы группировки результат вот такой

Код
> data.frame(predict(model, type="response"),data$рецидив.до.года)
   predict.model..type....response.. data.рецидив.до.года
1                          0.9753424                    1
2                          0.9753424                    1
3                          0.9471832                    1
4                          0.8419639                    1
5                          0.8419639                    1
6                          0.9471832                    1
7                          0.9471832                    1
8                          0.9753424                    1
9                          0.9215760                    1
10                         0.9753424                    1
11                         0.9837041                    1
12                         0.9837041                    1
13                         0.9471832                    1
14                         0.7773354                    1
15                         0.9753424                    1
16                         0.8419639                    1
17                         0.9471832                    1
18                         0.8419639                    1
19                         0.8419639                    1
20                         0.7773354                    1
21                         0.9215760                    1
22                         0.7773354                    1
23                         0.7773354                    1
24                         0.9837041                    0
25                         0.5091129                    1
26                         0.9753424                    1
27                         0.8419639                    1
28                         0.7773354                    1
29                         0.5091129                    1
30                         0.9837041                    1
31                         0.9215760                    1
32                         0.9837041                    1
33                         0.2355390                    1
34                         0.5091129                    1
35                         0.8419639                    1
36                         0.5091129                    1
37                         0.5091129                    1
38                         0.5091129                    1
39                         0.7773354                    1
40                         0.9837041                    1
41                         0.9753424                    1
42                         0.8419639                    1
43                         0.8419639                    1
44                         0.8419639                    1
45                         0.9471832                    1
46                         0.7773354                    1
47                         0.9471832                    1
48                         0.9471832                    1
49                         0.9471832                    1
50                         0.7773354                    1
51                         0.7773354                    1
52                         0.8419639                    1
53                         0.8419639                    1
54                         0.8419639                    1
55                         0.8419639                    1
56                         0.5091129                    1
57                         0.7773354                    1
58                         0.9471832                    1
59                         0.7773354                    1
60                         0.5091129                    1
61                         0.5091129                    1
62                         0.5091129                    1
63                         0.5091129                    1
64                         0.5091129                    1
65                         0.7773354                    1
66                         0.5091129                    1
67                         0.7773354                    1
68                         0.6128158                    0
69                         0.6128158                    0
70                         0.5091129                    0
71                         0.7773354                    0
72                         0.7773354                    0
73                         0.7773354                    0
74                         0.9215760                    0
75                         0.6128158                    0
76                         0.7773354                    0
77                         0.7773354                    0
78                         0.7773354                    0
79                         0.5091129                    0
80                         0.2355390                    0
81                         0.2355390                    0
82                         0.5091129                    0
83                         0.5091129                    0
84                         0.2355390                    0
85                         0.2355390                    0
86                         0.2355390                    0
87                         0.2355390                    0
88                         0.2355390                    0
89                         0.2355390                    0
90                         0.2355390                    0
91                         0.2355390                    0
92                         0.2355390                    0
93                         0.2355390                    0


PS вот как связана переменная "срок" с предсказанной вероятностью рецидива (присоединяю еще один рисунок)

Сообщение отредактировал p2004r - 16.11.2011 - 20:56
Эскизы прикрепленных изображений
Прикрепленное изображение
Прикрепленное изображение
Прикрепленное изображение
 


Signature
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- mamalita   Логистическая регрессия?   9.11.2011 - 11:07
- - p2004r   Цитата(mamalita @ 9.11.2011 - 10:07)...   9.11.2011 - 11:55
- - mamalita   Познания у меня не очень глубокие, поэтому не совс...   10.11.2011 - 12:35
|- - p2004r   Цитата(mamalita @ 10.11.2011 - 11:35...   10.11.2011 - 22:56
- - Игорь   Цитата(mamalita @ 9.11.2011 - 11:07)...   10.11.2011 - 15:50
- - mamalita   В том то и проблема - какой размер брать. Когда у ...   10.11.2011 - 20:40
- - DrgLena   Трудность понятна, есть не просто число, но и разм...   10.11.2011 - 22:49
- - mamalita   Цитата(DrgLena @ 10.11.2011 - 23:49)...   13.11.2011 - 11:29
|- - p2004r   Цитата(mamalita @ 13.11.2011 - 10:29...   13.11.2011 - 11:42
- - mamalita   приложенные данные   13.11.2011 - 11:34
|- - p2004r   Цитата(mamalita @ 13.11.2011 - 10:34...   13.11.2011 - 11:56
|- - p2004r   часть 2 Выбираем интервал группировки Нас интерес...   13.11.2011 - 13:16
|- - p2004r   часть 3 Применяем интервал группировки Допустим ч...   13.11.2011 - 14:14
|- - p2004r   Проведем разведочный анализ лично я предпочитаю с...   13.11.2011 - 15:21
|- - p2004r   Построим полную модель различий Код> summary...   13.11.2011 - 16:31
|- - p2004r   Посмотрим что увидела оптимальная модель Кодmosaic...   13.11.2011 - 17:04
|- - p2004r   Поскольку у крупных опухолей всего два уровня (ест...   13.11.2011 - 18:05
- - p2004r   нет ли опечатки? Код> table(data$сро...   13.11.2011 - 18:27
|- - mamalita   Спасибо за быстрый подробный ответ и помощь. Ноя к...   16.11.2011 - 08:58
|- - p2004r   Цитата(mamalita @ 16.11.2011 - 07:58...   16.11.2011 - 11:24
- - DrgLena   Поскольку дискуссия с автором поста пока не получа...   15.11.2011 - 00:37
|- - mamalita   Поскольку дискуссия с автором поста пока не получа...   16.11.2011 - 08:44
- - DrgLena   Нет, вы поняли не правильно. Хотя я много чего н...   16.11.2011 - 10:53
- - DrgLena   Цитата(p2004r @ 16.11.2011 - 12:24) ...   16.11.2011 - 13:29
|- - p2004r   Цитата(DrgLena @ 16.11.2011 - 12:29)...   16.11.2011 - 14:04
- - DrgLena   Цитата(p2004r @ 16.11.2011 - 11:24) ...   16.11.2011 - 13:37
|- - p2004r   Цитата(DrgLena @ 16.11.2011 - 12:37)...   16.11.2011 - 14:14
- - DrgLena   Больной, имеющий 0,5 имеет и 4 (вторая строчка)   16.11.2011 - 14:12
|- - p2004r   Цитата(DrgLena @ 16.11.2011 - 13:12)...   16.11.2011 - 14:20
- - mamalita   Цитата(p2004r @ 16.11.2011 - 15:20) ...   16.11.2011 - 18:06
|- - p2004r   да правильно, просто включать нельзя по тому что п...   16.11.2011 - 18:34
- - DrgLena   Цитата(p2004r @ 16.11.2011 - 15:04) ...   16.11.2011 - 19:22
|- - p2004r   Цитата(DrgLena @ 16.11.2011 - 18:22)...   16.11.2011 - 20:08
- - DrgLena   Спасибо, я тоже посчитала вероятности по вашим коэ...   16.11.2011 - 20:55
|- - p2004r   Цитата(DrgLena @ 16.11.2011 - 19:55)...   16.11.2011 - 21:07
|- - p2004r   Цитата(DrgLena @ 16.11.2011 - 19:55)...   16.11.2011 - 21:19
- - DrgLena   Спасибо, я уже перевела и скопировала ваши вероятн...   16.11.2011 - 21:40
|- - p2004r   Цитата(DrgLena @ 16.11.2011 - 20:40)...   16.11.2011 - 21:53
|- - p2004r   Цитата(DrgLena @ 16.11.2011 - 21:40)...   18.12.2011 - 17:16
- - DrgLena   Спасибо, р2004r, я поняла, для меня это новая мысл...   16.11.2011 - 22:41
- - DrgLena   Что то, все же, настораживает в этом подходе. Как ...   17.11.2011 - 19:46
|- - p2004r   Цитата(DrgLena @ 17.11.2011 - 18:46)...   17.11.2011 - 20:45
|- - p2004r   Цитата(DrgLena @ 17.11.2011 - 18:46)...   17.11.2011 - 20:52
|- - p2004r   Цитата(DrgLena @ 17.11.2011 - 18:46)...   17.11.2011 - 21:38
|- - DrgLena   Да, но ведь анализ данных для того и делается, что...   18.11.2011 - 00:58
|- - p2004r   Цитата(DrgLena @ 18.11.2011 - 00:58)...   18.11.2011 - 10:53
- - DrgLena   p2004r, вы продемонстрировали, что моделирование -...   18.11.2011 - 11:56
- - mamalita   Медленно но верно тем самым и занимаюсь. Мне нужно...   25.11.2011 - 11:16
- - mamalita   Начала с самого начала и сразу проблема: при откры...   5.12.2011 - 12:47
|- - p2004r   Цитата(mamalita @ 5.12.2011 - 12:47)...   5.12.2011 - 13:21
- - mamalita   Все делаю как написано программа отвечает : не мог...   6.12.2011 - 13:38
|- - p2004r   Цитата(mamalita @ 6.12.2011 - 13:38)...   6.12.2011 - 14:30
- - mamalita   [quote name='p2004r' date='6.12.2011 -...   8.12.2011 - 19:58
|- - p2004r   Цитата(mamalita @ 8.12.2011 - 19:58)...   8.12.2011 - 21:35
- - mamalita   > data <- read.csv2("кол-во-размер-реци...   11.12.2011 - 21:22
|- - p2004r   Цитата(mamalita @ 11.12.2011 - 21:22...   12.12.2011 - 00:42
- - mamalita   Спасибо, данные ввелись. Вопрос 1. вместо имен пер...   13.12.2011 - 10:34
- - p2004r   Цитата(mamalita @ 13.12.2011 - 10:34...   13.12.2011 - 10:50


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему