Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> multifactor dimensionality reduction
_alena_
сообщение 14.11.2011 - 13:19
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 42
Регистрация: 14.11.2011
Пользователь №: 23301



всем привет. очень нуждаюсь в помощи и советах.... кто то знаком с multifactor dimensionality reduction??? что можно почитать о том как работать в этой среде? для каких видов данных она предназначена??? а то мне все что встречалось касается генной информации. можно ли применять другие выборки? спасибо
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
_alena_
сообщение 20.11.2011 - 18:58
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 42
Регистрация: 14.11.2011
Пользователь №: 23301



креплю
Прикрепленные файлы
Прикрепленный файл  файл_с_данными.rar ( 4,09 килобайт ) Кол-во скачиваний: 417
 
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
p2004r
сообщение 21.11.2011 - 15:21
Сообщение #3





Группа: Пользователи
Сообщений: 1091
Регистрация: 26.08.2010
Пользователь №: 22699



Цитата(_alena_ @ 20.11.2011 - 18:58) *
креплю


так время операции в качестве чего будет использоваться?


Signature
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
_alena_
сообщение 21.11.2011 - 17:44
Сообщение #4





Группа: Пользователи
Сообщений: 42
Регистрация: 14.11.2011
Пользователь №: 23301



Цитата(p2004r @ 21.11.2011 - 14:21) *
так время операции в качестве чего будет использоваться?


скорее всего оно бы использовалось не для анализа, а просто для общих сведений, как айдишка. а вообще задача немного поменялась.... сказали из базы проанализировать 4 столбца. к примеру инфаркт миокарда. и найти какие то зависящие факторы. из этого сделать выборку и посмотреть будет ли достаточное количество данных.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
p2004r
сообщение 21.11.2011 - 18:16
Сообщение #5





Группа: Пользователи
Сообщений: 1091
Регистрация: 26.08.2010
Пользователь №: 22699



Цитата(_alena_ @ 21.11.2011 - 17:44) *
скорее всего оно бы использовалось не для анализа, а просто для общих сведений, как айдишка. а вообще задача немного поменялась.... сказали из базы проанализировать 4 столбца. к примеру инфаркт миокарда. и найти какие то зависящие факторы. из этого сделать выборку и посмотреть будет ли достаточное количество данных.


просто по литературе (запомнилось) обычно встречаешь что учитывают день недели и сезон года, это как я понимаю считается вполне влияющим фактором на исход операции. еще бывает ситуация повторных операций, но здесь ситуация другая.

просто так запихивать в glm() (generalized linear models) предикторы явно не стоит. сейчас понятно что имеет место зависимая бинарная --- выжил-нет.

как я понял мы ищем что связано с этой переменной? (и её в самом файле с примером данных нет?)

тогда нам надо подготовить предикторы,
Код
> read.csv2("файл с данными.csv")
    ID  Familia Vozrast Data_operatsii     Pol
1   13 Абдула?в      72     24.06.2010 Мужской
2  506   Бунчук      57     17.12.2010 Мужской
3  862  Гладчук      85     01.06.2010 Мужской
4  951 Горбенко      60     11.05.2010 Мужской
5 2163     Крoт      56     15.12.2010 Мужской
                               HronichZabol_Legkih Nevrolgiya PerenOperatsii
1                                              нет        нет             да
2                                   лёгкой степени        нет            нет
3 тяжёлые (требующие ингаляционную гормонотерапию)        нет             да
4                                  средней степени         да             да
5 тяжёлые (требующие ингаляционную гормонотерапию)        нет             да
      Stenokardiya Vremya_posle_posled_IM Gipertrof_L_ZH  IM
1 напряжения+покоя                    нет      умеренная нет
2       напряжения                    нет      умеренная нет
3 напряжения+покоя                    нет      умеренная нет
4       напряжения                    нет      умеренная нет
5              нет                    нет      умеренная нет


например словесно записана степень проявления HronichZabol_Legkih. если это степень проявления и все уровни нарастают от нет, то надо её преобразовать в ранговую величину. "нет" - 0, "легкая" - 1 и т.д. (при этом если гормонотерапия приписывается к разным уровням, то это выносится в отдельный бинарный признак).

аналогично преобразуется Gipertrof_L_ZH, тоже в ранговую величину.

если это все уровни у стенокардии то её тоже в ранговую

наиболее трудно с Vremya_posle_posled_IM. "нет" и время очень даже различные вещи что бы быть в одной переменной. тут надо думать как это представить.


Signature
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- _alena_   multifactor dimensionality reduction   14.11.2011 - 13:19
- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 14.11.2011 - 12:19)...   14.11.2011 - 18:01
- - _alena_   есть данные по кардиологии. предоперационных набор...   14.11.2011 - 22:28
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 14.11.2011 - 21:28)...   15.11.2011 - 21:55
|- - 9oclock   Цитата(_alena_ @ 14.11.2011 - 23:28)...   21.11.2011 - 17:50
||- - p2004r   Цитата(9oclock @ 21.11.2011 - 17:50)...   21.11.2011 - 18:00
||- - _alena_   Цитата(9oclock @ 21.11.2011 - 16:50)...   21.11.2011 - 18:10
||- - p2004r   Цитата(9oclock @ 21.11.2011 - 17:50)...   21.11.2011 - 19:01
|- - Larina Tatjana   Цитата(_alena_ @ 15.11.2011 - 04:58)...   5.03.2012 - 19:40
|- - _alena_   Цитата(Larina Tatjana @ 5.03.2012 - 18...   18.03.2012 - 22:50
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 18.03.2012 - 22:50)...   19.03.2012 - 11:29
|- - _alena_   Цитата(p2004r @ 19.03.2012 - 10:29) ...   20.03.2012 - 11:43
- - _alena_   ого го... чувствую себя вообще стерильной.... наве...   16.11.2011 - 10:40
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 16.11.2011 - 09:40)...   16.11.2011 - 11:45
- - _alena_   если я правильно поняла мне нужно начать с логрегр...   16.11.2011 - 10:43
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 16.11.2011 - 09:43)...   16.11.2011 - 11:58
|- - _alena_   Цитата(p2004r @ 16.11.2011 - 10:58) ...   16.11.2011 - 12:25
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 16.11.2011 - 11:25)...   16.11.2011 - 15:12
|- - _alena_   Цитата(p2004r @ 16.11.2011 - 14:12) ...   20.11.2011 - 20:35
|- - _alena_   Цитата(_alena_ @ 20.11.2011 - 19:35)...   20.11.2011 - 20:41
- - _alena_   здравствуйте, решила попытаться сделать вот что. з...   20.11.2011 - 17:48
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 20.11.2011 - 17:48)...   20.11.2011 - 18:11
- - _alena_   креплю   20.11.2011 - 18:58
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 20.11.2011 - 18:58)...   21.11.2011 - 15:21
|- - _alena_   Цитата(p2004r @ 21.11.2011 - 14:21) ...   21.11.2011 - 17:44
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 21.11.2011 - 17:44)...   21.11.2011 - 18:16
- - _alena_   просто сама не могла толком сформулировать свои по...   21.11.2011 - 18:12
- - TheThing   Здравствуйте! Довольно продолжительное время ...   27.11.2011 - 00:10
|- - _alena_   Цитата(TheThing @ 26.11.2011 - 23:10...   30.11.2011 - 11:23
|- - _alena_   TheThing, извините еще за глуппый вопрос. я алгори...   30.11.2011 - 12:32
|- - TheThing   Цитата(_alena_ @ 30.11.2011 - 12:32)...   2.12.2011 - 16:28
- - _alena_   всем привет. буду благодарна за подсказки! ска...   11.02.2012 - 19:45
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 11.02.2012 - 19:45)...   11.02.2012 - 23:04
|- - Olga_   Цитата(_alena_ @ 11.02.2012 - 17:45)...   11.02.2012 - 23:48
|- - _alena_   Цитата(Olga_ @ 11.02.2012 - 22:48) Е...   13.02.2012 - 09:18
|- - Olga_   Цитата(_alena_ @ 13.02.2012 - 07:18)...   13.02.2012 - 14:54
- - TheThing   Да выкладывайте уже, сможем-сможем   20.03.2012 - 14:00
|- - _alena_   Цитата(TheThing @ 20.03.2012 - 13:00...   21.03.2012 - 09:19
|- - YVR   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 11:19)...   21.03.2012 - 09:49
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 09:19)...   21.03.2012 - 10:27
|- - _alena_   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 08:19)...   21.03.2012 - 12:32
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:32)...   21.03.2012 - 12:46
|- - p2004r   Цитата(p2004r @ 21.03.2012 - 12:46) ...   21.03.2012 - 13:18
- - _alena_   мне сам принцип понять.... я просто взяла выборку ...   21.03.2012 - 10:18
|- - YVR   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:18)...   21.03.2012 - 10:22
- - _alena_   извините, не думала что прям так важно все данные ...   21.03.2012 - 10:41
|- - YVR   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:41)...   21.03.2012 - 10:49
||- - _alena_   Цитата(YVR @ 21.03.2012 - 09:49) А п...   21.03.2012 - 10:57
||- - YVR   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:57)...   21.03.2012 - 11:01
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 10:41)...   21.03.2012 - 10:53
|- - _alena_   Цитата(p2004r @ 21.03.2012 - 09:53) ...   21.03.2012 - 11:01
|- - YVR   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 13:01)...   21.03.2012 - 11:05
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 11:01)...   21.03.2012 - 11:52
|- - p2004r   Цитата(p2004r @ 21.03.2012 - 11:52) ...   21.03.2012 - 12:34
|- - YVR   Цитата(p2004r @ 21.03.2012 - 14:34) ...   21.03.2012 - 20:50
|- - p2004r   Цитата(YVR @ 21.03.2012 - 20:50) Что...   22.03.2012 - 01:17
|- - p2004r   Ну нелинейно так нелинейно Итак randomForest, он...   23.03.2012 - 17:25
- - _alena_   файл   21.03.2012 - 11:21
|- - YVR   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 13:21)...   21.03.2012 - 11:45
- - _alena_   ну все здорово...спасибо за ваш труд. но извините ...   21.03.2012 - 12:41
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:41)...   21.03.2012 - 12:49
|- - _alena_   Цитата(p2004r @ 21.03.2012 - 11:49) ...   21.03.2012 - 12:59
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:59)...   21.03.2012 - 13:09
- - YVR   Собрал экспертную систему в Excel файле. Вычисляет...   23.03.2012 - 09:37
- - _alena_   так а в MDR можно что то сделать???? если да то по...   23.03.2012 - 16:35


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему