Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )
14.11.2011 - 13:19
Сообщение
#1
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 42 Регистрация: 14.11.2011 Пользователь №: 23301 |
всем привет. очень нуждаюсь в помощи и советах.... кто то знаком с multifactor dimensionality reduction??? что можно почитать о том как работать в этой среде? для каких видов данных она предназначена??? а то мне все что встречалось касается генной информации. можно ли применять другие выборки? спасибо
|
|
|
![]() |
![]() |
![]() |
27.11.2011 - 00:10
Сообщение
#2
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 116 Регистрация: 20.02.2011 Пользователь №: 23251 |
Здравствуйте!
Довольно продолжительное время работаю с MDR, программа в основном предназначена для поиска ассоциаций полиморфизмов одиночных нуклеотидов (single nucleotide polymprphism, SNP) и риском развития мультифакторной патологии. Метод имеет определенные преимущества над логистической регрессией, хотя обычно их применяют в "пачке" Для того, чтобы понять принцип работы метода, начните с этого: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/12584123 (закачивайте полный текст статьи). Кроме этого, MDR уже реализован в R: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21846375 Также очень будет полезным почитать блог самого автора, если у Вас работа связана с изучением межгенных взаимодействий (эпистазис) - http://compgen.blogspot.com/ Если что-то будет не понятно - буду рад помочь! |
|
|
![]() |
![]() |
30.11.2011 - 12:32
Сообщение
#3
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 42 Регистрация: 14.11.2011 Пользователь №: 23301 |
TheThing, извините еще за глуппый вопрос. я алгоритм и статьи почитала... насколько поняла то этот MDR можно применять не только используя какие то гены для определения риска патологии или нахождения взаимосвязей но и в других отраслях.моя проблема в том что у меня не будет ни одного параметра по генам... а патологию нужно будет определять в зависимости от скажем инфаркта или сердечно сосудистой недостаточности. нету ли каких то ссылок с такого рода материалом??? я просмотрела и все статьи с основных сайтов и в паб меде прорылась. пока безрезультатно....или мне просто нужно будет те пераметры что есть у меня закодировать в файлик ноликами и единичками и дальше работать с ним? тогда что если не 2 значения а больше...
|
|
|
![]() |
![]() |
_alena_ multifactor dimensionality reduction 14.11.2011 - 13:19
p2004r Цитата(_alena_ @ 14.11.2011 - 12:19)... 14.11.2011 - 18:01
_alena_ есть данные по кардиологии. предоперационных набор... 14.11.2011 - 22:28
p2004r Цитата(_alena_ @ 14.11.2011 - 21:28)... 15.11.2011 - 21:55
9oclock Цитата(_alena_ @ 14.11.2011 - 23:28)... 21.11.2011 - 17:50

p2004r Цитата(9oclock @ 21.11.2011 - 17:50)... 21.11.2011 - 18:00

_alena_ Цитата(9oclock @ 21.11.2011 - 16:50)... 21.11.2011 - 18:10

p2004r Цитата(9oclock @ 21.11.2011 - 17:50)... 21.11.2011 - 19:01
Larina Tatjana Цитата(_alena_ @ 15.11.2011 - 04:58)... 5.03.2012 - 19:40
_alena_ Цитата(Larina Tatjana @ 5.03.2012 - 18... 18.03.2012 - 22:50
p2004r Цитата(_alena_ @ 18.03.2012 - 22:50)... 19.03.2012 - 11:29
_alena_ Цитата(p2004r @ 19.03.2012 - 10:29) ... 20.03.2012 - 11:43
_alena_ ого го... чувствую себя вообще стерильной.... наве... 16.11.2011 - 10:40
p2004r Цитата(_alena_ @ 16.11.2011 - 09:40)... 16.11.2011 - 11:45
_alena_ если я правильно поняла мне нужно начать с логрегр... 16.11.2011 - 10:43
p2004r Цитата(_alena_ @ 16.11.2011 - 09:43)... 16.11.2011 - 11:58
_alena_ Цитата(p2004r @ 16.11.2011 - 10:58) ... 16.11.2011 - 12:25
p2004r Цитата(_alena_ @ 16.11.2011 - 11:25)... 16.11.2011 - 15:12
_alena_ Цитата(p2004r @ 16.11.2011 - 14:12) ... 20.11.2011 - 20:35
_alena_ Цитата(_alena_ @ 20.11.2011 - 19:35)... 20.11.2011 - 20:41
_alena_ здравствуйте, решила попытаться сделать вот что. з... 20.11.2011 - 17:48
p2004r Цитата(_alena_ @ 20.11.2011 - 17:48)... 20.11.2011 - 18:11
_alena_ креплю 20.11.2011 - 18:58
p2004r Цитата(_alena_ @ 20.11.2011 - 18:58)... 21.11.2011 - 15:21
_alena_ Цитата(p2004r @ 21.11.2011 - 14:21) ... 21.11.2011 - 17:44
p2004r Цитата(_alena_ @ 21.11.2011 - 17:44)... 21.11.2011 - 18:16
_alena_ просто сама не могла толком сформулировать свои по... 21.11.2011 - 18:12
_alena_ Цитата(TheThing @ 26.11.2011 - 23:10... 30.11.2011 - 11:23
TheThing Цитата(_alena_ @ 30.11.2011 - 12:32)... 2.12.2011 - 16:28
_alena_ всем привет. буду благодарна за подсказки! ска... 11.02.2012 - 19:45
p2004r Цитата(_alena_ @ 11.02.2012 - 19:45)... 11.02.2012 - 23:04
Olga_ Цитата(_alena_ @ 11.02.2012 - 17:45)... 11.02.2012 - 23:48
_alena_ Цитата(Olga_ @ 11.02.2012 - 22:48) Е... 13.02.2012 - 09:18
Olga_ Цитата(_alena_ @ 13.02.2012 - 07:18)... 13.02.2012 - 14:54
TheThing Да выкладывайте уже, сможем-сможем 20.03.2012 - 14:00
_alena_ Цитата(TheThing @ 20.03.2012 - 13:00... 21.03.2012 - 09:19
YVR Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 11:19)... 21.03.2012 - 09:49
p2004r Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 09:19)... 21.03.2012 - 10:27
_alena_ Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 08:19)... 21.03.2012 - 12:32
p2004r Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:32)... 21.03.2012 - 12:46
p2004r Цитата(p2004r @ 21.03.2012 - 12:46) ... 21.03.2012 - 13:18
_alena_ мне сам принцип понять.... я просто взяла выборку ... 21.03.2012 - 10:18
YVR Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:18)... 21.03.2012 - 10:22
_alena_ извините, не думала что прям так важно все данные ... 21.03.2012 - 10:41
YVR Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:41)... 21.03.2012 - 10:49

_alena_ Цитата(YVR @ 21.03.2012 - 09:49) А п... 21.03.2012 - 10:57

YVR Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:57)... 21.03.2012 - 11:01
p2004r Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 10:41)... 21.03.2012 - 10:53
_alena_ Цитата(p2004r @ 21.03.2012 - 09:53) ... 21.03.2012 - 11:01
YVR Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 13:01)... 21.03.2012 - 11:05
p2004r Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 11:01)... 21.03.2012 - 11:52
p2004r Цитата(p2004r @ 21.03.2012 - 11:52) ... 21.03.2012 - 12:34
YVR Цитата(p2004r @ 21.03.2012 - 14:34) ... 21.03.2012 - 20:50
p2004r Цитата(YVR @ 21.03.2012 - 20:50) Что... 22.03.2012 - 01:17
p2004r Ну нелинейно так нелинейно
Итак randomForest, он... 23.03.2012 - 17:25
_alena_ файл 21.03.2012 - 11:21
YVR Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 13:21)... 21.03.2012 - 11:45
_alena_ ну все здорово...спасибо за ваш труд. но извините ... 21.03.2012 - 12:41
p2004r Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:41)... 21.03.2012 - 12:49
_alena_ Цитата(p2004r @ 21.03.2012 - 11:49) ... 21.03.2012 - 12:59
p2004r Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:59)... 21.03.2012 - 13:09
YVR Собрал экспертную систему в Excel файле. Вычисляет... 23.03.2012 - 09:37
_alena_ так а в MDR можно что то сделать???? если да то по... 23.03.2012 - 16:35![]() ![]() |