Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> Параметрические или непараметрические методы
Alex_Z
сообщение 4.01.2012 - 12:31
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 59
Регистрация: 23.12.2011
Пользователь №: 23383



Не могу найти ответ на вопрос.
(
У меня есть показатели (дискретные значения) - индексы по шкале, измеренные в трех временных точках (1,2 и 3) у двух сравниваемых групп.
Нужно сравнить средние значения в каждой временной точке. Но вот проблема: распределения то отличаются от нормального, то нет.
Нормальность смотрел критерием Колмогорова-Смирнова.
Группа 1:
1 точка - р-0,017
2 точка - р-0,033
3 точка - р-0,7.

Группа 2:
1 точка - р-0,241
2 точка - р-0,01
3 точка - р-0,000.

Т.е. точки 2 у двух групп можно сравнить критерием Манн-Уитни, т.к. выборки не подчиняются нормальному закону. А какой метод использовать для точек 1 и 3, когда распределения разные? Параметрический или нет?

И как описывать средние в отчете? В литературе рекомендуется при нормальном распределении описывать как среднее и СО (или 95% ДИ). При ненормальном - как медиану и интерквартильный размах.

Будет ли правильно написать так:
1 измерение:
1 гр. среднее (СО) ---- 2 гр. медиана (интерквартильный размах), р<0,0.... Правильно это? Или тогда обе группы описывать одинаковым способом вне зависимости от распределения?

P.S. Странно, я думал, что параметрические критерии более чувствительны к тому, чтобы уловить различия между группами. Посчитал по Стьюденту, Манн-Уитни и Колмогорову-Смирнову по SPSS.

Так, Стьюдент:
Точка 1 р-1,000
Точка 2 р-0,294
Точка 3 р-0,163.

Манн-Уитни:
Точка 1 р-0,81
Точка 2 р-0,068
Точка 3 р-0,037.

По Колмогорову-Смирнову еще интереснее:
Точка 1 р-0,74
Точка 2 р-0,011
Точка 3 р-0,000.

Т.е. получается - по Стьюденту, различий между группами нет ни в одной временной точке. По М-У - только в 3, а по К-С во 2 и 3.
Запутался.... Подскажите, пожалуйста.

Сообщение отредактировал Alex_Z - 4.01.2012 - 13:32
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
Alex_Z
сообщение 7.01.2012 - 21:30
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 59
Регистрация: 23.12.2011
Пользователь №: 23383



"Если омнибусный тест не показывает межгрупповых различий - нечего дальше и ковыряться. Если показывает - тогда далее разбираемся за счёт каких групп или их сочетаний в ходе апостериорных сравнений специальными тестами."

Какими например (если можно, то применительно к SPSS)? Шеффе, Тьюки?

И, если позволите, еще пару вопросов. 1. Если Краскел-Уоллис (или Фридман) не нашел различий, а ДА нашел (или наоборот) что делать, кому верить? 2. Однофакторный ДА применим, когда сравниваются 3-4 связанные выборки?

Сообщение отредактировал Alex_Z - 7.01.2012 - 21:33
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
100$
сообщение 7.01.2012 - 22:16
Сообщение #3





Группа: Пользователи
Сообщений: 902
Регистрация: 23.08.2010
Пользователь №: 22694



-> Nokh, а у Вас совершенно случайно нет ссылочки на тест Неменьи (63 г) с таблицей критических значений при N>25? А то что-то попадаются только до 25 включительно.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
nokh
сообщение 9.01.2012 - 12:16
Сообщение #4





Группа: Пользователи
Сообщений: 1219
Регистрация: 13.01.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 4704



Цитата(100$ @ 8.01.2012 - 00:16) *
-> Nokh, а у Вас совершенно случайно нет ссылочки на тест Неменьи (63 г) с таблицей критических значений при N>25? А то что-то попадаются только до 25 включительно.

Если вы имеете в виду тот же, что и я - ранговый аналог критерия Шеффе для post-hoc анализа, то его не рекомендуют использовать ввиду высокой консервативности. Самым либеральным и простым для апостериорных сравнений внутри Краскелла-Уоллиса является критерий Коновера-Инмана - ранговый аналог Fisher's LCD), самым строгим - критерий Стила-Двасса (Steel-Dwass) - ранговый аналог Tukey's HSD. Чтобы не рыскать по таблицам, я сделал в Excel расчётную таблицу, в которую ввожу суммы рангов для групп, полученные в анализе Краскела-Уоллиса и автоматически получаю значения р для тестов Коновера-Инмана, Данна и Неменьи. Там простые формулы. Для Неменьи при больших выборках используют распределение хи-квадрат (см. ниже). Наверное выложу файл на форум когда перепроверю и справку допишу. Для расчёта Стила-Двасса нужны оригинальные данные, т.к. там используется не совместная ранжировка, а попарная. Поэтому его считаю в пакете KyPlot (v.2 beta 15).

Кусочек из Hochberg, Tamhane (1987) Multiple Comparison Procedures:

Сообщение отредактировал nokh - 9.01.2012 - 12:20
Эскизы прикрепленных изображений
Прикрепленное изображение
 
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
100$
сообщение 9.01.2012 - 14:11
Сообщение #5





Группа: Пользователи
Сообщений: 902
Регистрация: 23.08.2010
Пользователь №: 22694



Цитата(nokh @ 9.01.2012 - 12:16) *
Если вы имеете в виду тот же, что и я - ранговый аналог критерия Шеффе для post-hoc анализа, то его не рекомендуют использовать ввиду высокой консервативности. Самым либеральным и простым для апостериорных сравнений внутри Краскелла-Уоллиса является критерий Коновера-Инмана - ранговый аналог Fisher's LCD), самым строгим - критерий Стила-Двасса (Steel-Dwass) - ранговый аналог Tukey's HSD. Чтобы не рыскать по таблицам, я сделал в Excel расчётную таблицу, в которую ввожу суммы рангов для групп, полученные в анализе Краскела-Уоллиса и автоматически получаю значения р для тестов Коновера-Инмана, Данна и Неменьи. Там простые формулы. Для Неменьи при больших выборках используют распределение хи-квадрат (см. ниже). Наверное выложу файл на форум когда перепроверю и справку допишу. Для расчёта Стила-Двасса нужны оригинальные данные, т.к. там используется не совместная ранжировка, а попарная. Поэтому его считаю в пакете KyPlot (v.2 beta 15).

Кусочек из Hochberg, Tamhane (1987) Multiple Comparison Procedures:


> Nokh, спасибо, если пожелаете выложить файл на форуме, это будет очень кстати. И, если позволите, несколько вопросов:

1. Компания AddInSoft в своем довеске к Excel по названием XLStat использует Неменью в качестве пост-хока внутри Фридмана. Хохберг и Тамхейн, судя по картинке, лепят его в Краскела-Уоллиса. Формула критерия, правда, отличается. Кобзарь дает версию Неменьи для случая выборок равного объема (как при ДА со связанными выборками). Что, существуют две его версии: для "связанного" ДА и для "независимого"?
2. Hochberg, Tamhane (1987) Multiple Comparison Procedures: есть в сети?
3. Чисто филологический вопрос: Иман из словосочетания "Иман-Давенпорт" и Инман из словосочетания "Коновер-Инман" - это разные люди или один и тот же человек?


Заранее спасибо.

Сообщение отредактировал 100$ - 9.01.2012 - 22:45
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
nokh
сообщение 29.01.2012 - 08:03
Сообщение #6





Группа: Пользователи
Сообщений: 1219
Регистрация: 13.01.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 4704



> Olga_

Цитата(Olga_ @ 9.01.2012 - 16:05) *
Уважаемый nokh,
Тест Краскелла-Уоллиса предназначен для сравнения независимых выборок. А у топикстартера зависимые выборки, и игнорирование этого факта уже ошибка.

В посте #42 топикстартер писал: "И, если позволите, еще пару вопросов. 1. Если Краскел-Уоллис (или Фридман) не нашел различий, а ДА нашел (или наоборот) что делать, кому верить? 2. Однофакторный ДА применим, когда сравниваются 3-4 связанные выборки?"
Чтобы делать как можно меньше ошибок и не путать читателей форума впредь не разрешайте топикстартерам задавать вопросы, не имеющие прямого отношения к вопросу, вынесенному им в тему ветки. А то одни спрашивают всё подряд, другие пытаются на это отвечать... Бардак какой-то!

> 100$

Цитата(100$ @ 9.01.2012 - 16:11) *
1. Компания AddInSoft в своем довеске к Excel по названием XLStat использует Неменью в качестве пост-хока внутри Фридмана. Хохберг и Тамхейн, судя по картинке, лепят его в Краскела-Уоллиса. Формула критерия, правда, отличается. Кобзарь дает версию Неменьи для случая выборок равного объема (как при ДА со связанными выборками). Что, существуют две его версии: для "связанного" ДА и для "независимого"?
2. Hochberg, Tamhane (1987) Multiple Comparison Procedures: есть в сети?
3. Чисто филологический вопрос: Иман из словосочетания "Иман-Давенпорт" и Инман из словосочетания "Коновер-Инман" - это разные люди или один и тот же человек?


1. По поводу Фридмана я уже где-то писал Вам, что он - непараметрический аналог двухфакторного дисперсионного анализа (ДА) с рандомизированными блоками, а под это попадает и дизайн с зависимыми группами. Ну вот, например, такой дизайн:
(1) 5 доноров и 5 способов консервации крови. Это - классический пример дизайна с зависимыми выборками, доноры - связанные выборки, а рандамизированные блоки не упоминаются вообще.
(2) Урожайность 5 сортов культуры на 5 участках - классический пример ДА с рандомизированными блоками, хотя раз участки одни и те же - нужно говорить о зависимых выборках.
(3) Прочность бетона при 5 температурах и 5 давлениях. Здесь связанных групп вроде как и нет или обе взаимосвязаны.

Во всех трёх примерах имеем таблицу 5 х 5 = 25 ячеек и обрабатываем её параметрикой по схеме ДА с рандомизированными блоками, а непараметрикой - по Фридману, хотя он и не позволяет разложить всё одновременно как ДА. По Фридману в примере (1) мы можем сравнить 5 способов консервации при усреднении данных по донорам, а в примере (3) можем сравнить 5 вариантов давления при усреднении данных по температуре. Но если нас в примере (1) интересуют не столько способы консервации, сколько индивидуальная изменчивость - мы можем сравнить 5 доноров при усреднении способов. Аналогично в примере (3) сравним 5 вариантов температур при усреднении давления. Если такой омнибусный тест обнаруживает различия, до далее имеет смысл разбираться за счёт чего. Для этого и используем Неменьи. Получается что не нужно двух версий Неменьи для зависимых и независимых выборок, т.к. во Фридмане у нас могут быть как те, так и другие.

Я недавно думал, что есть другие 2 версии Неменьи: для однофакторного Краскела-Уоллиса и для двухфакторного Фридмана. Сейчас получается, что это - один и тот же тест. Он используется во Фридмане, но не рекомендуется для К-У ввиду высокой консервативности. А в книгах, которые вы назвали и которые сам посмотрел противоречий нет. Там формулы другие, т.к. авторы дают какие-то вспомогательные таблицы и формулы "завязывают" на эти свои таблицы.

2. Есть. Я находил в pdf, 8 Мб.

3. Скорее всего один и тот же, но не проверял

Сообщение отредактировал nokh - 29.01.2012 - 08:27
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- Alex_Z   Параметрические или непараметрические методы   4.01.2012 - 12:31
- - 100$   Если вы отдаете себе отчет в том, что Цитата... ...   4.01.2012 - 18:07
- - Alex_Z   То есть применять только непараметрические критери...   4.01.2012 - 18:24
|- - 100$   Цитата(Alex_Z @ 4.01.2012 - 18:24) Т...   4.01.2012 - 18:35
- - Olga_   Цитата(Alex_Z @ 4.01.2012 - 10:31) У...   4.01.2012 - 18:47
- - Alex_Z   Да, вы правы, шкала именно такая. Пока рылся - на...   4.01.2012 - 18:51
- - Alex_Z   2 Ольга Индексы по шкалам APACHE II и SOFA до ле...   4.01.2012 - 18:53
|- - Olga_   Цитата(Alex_Z @ 4.01.2012 - 16:53) 2...   4.01.2012 - 19:23
|- - p2004r   Цитата(Alex_Z @ 4.01.2012 - 18:53) 2...   4.01.2012 - 19:23
- - Alex_Z   Изучается эффективность одного метода лечения сепс...   4.01.2012 - 19:39
|- - Olga_   Цитата(Alex_Z @ 4.01.2012 - 17:39) И...   4.01.2012 - 20:26
|- - p2004r   Цитата(Olga_ @ 4.01.2012 - 20:26) ht...   4.01.2012 - 20:52
|- - Olga_   Цитата(p2004r @ 4.01.2012 - 18:52) Б...   4.01.2012 - 20:55
|- - p2004r   Цитата(Olga_ @ 4.01.2012 - 20:55) Вы...   4.01.2012 - 20:57
|- - Olga_   Цитата(p2004r @ 4.01.2012 - 18:57) и...   4.01.2012 - 21:07
|- - p2004r   Цитата(Olga_ @ 4.01.2012 - 21:07) Пе...   4.01.2012 - 21:37
|- - Olga_   Цитата(p2004r @ 4.01.2012 - 19:37) В...   4.01.2012 - 22:10
|- - p2004r   Цитата(Olga_ @ 4.01.2012 - 22:10) ПС...   5.01.2012 - 00:13
- - Alex_Z   2 p2004r Спасибо. Тааак... Полез читать.   4.01.2012 - 19:40
- - Alex_Z   Ну....наверное мои изыскания можно назвать и клини...   4.01.2012 - 22:09
|- - Olga_   Цитата(Alex_Z @ 4.01.2012 - 20:09) Н...   4.01.2012 - 22:21
- - Alex_Z   Так.... По первому вопросу - все понятно. Спасибо...   4.01.2012 - 22:31
|- - Olga_   Цитата(Alex_Z @ 4.01.2012 - 20:31) Т...   4.01.2012 - 22:48
- - Alex_Z   В шкале СОФА данные тоже только дискретные. Однако...   4.01.2012 - 23:00
|- - Olga_   Цитата(Alex_Z @ 4.01.2012 - 21:00) В...   4.01.2012 - 23:23
- - Alex_Z   Нет-нет, поверьте, я не сомневаюсь, что их существ...   4.01.2012 - 23:43
|- - Olga_   Цитата(Alex_Z @ 4.01.2012 - 21:43) Н...   5.01.2012 - 00:15
- - Alex_Z   Но в этой же статье они оценивают не только баллы ...   5.01.2012 - 00:22
|- - Olga_   Цитата(Alex_Z @ 4.01.2012 - 22:22) Н...   5.01.2012 - 00:39
- - Alex_Z   Спасибо, Ольга! Буду изучать. Чем дальше в лес...   5.01.2012 - 00:46
- - Olga_   П.С. Статьи приведенные в качестве примера не ...   5.01.2012 - 01:37
- - Olga_   Вам уже дали хорошие рекомендации http://forum.di...   5.01.2012 - 13:12
- - Alex_Z   Да, ключевое значение, разумеется имеет именно выж...   5.01.2012 - 17:20
- - Olga_   Вынудили меня все таки прочитать про СОФА, будет п...   5.01.2012 - 20:22
- - Alex_Z   У меня русский 17 SPSS. В разделе непараметрически...   5.01.2012 - 20:47
|- - Olga_   Цитата(Alex_Z @ 5.01.2012 - 18:47) У...   5.01.2012 - 23:33
- - Olga_   Если будете сравнивать только среднее значение без...   6.01.2012 - 12:02
- - Alex_Z   Я так понимаю это хи-квадрат тест Фридмана - непар...   7.01.2012 - 18:04
|- - Olga_   Цитата(Alex_Z @ 7.01.2012 - 16:04) Я...   7.01.2012 - 20:04
- - Alex_Z   "The Friedman test was used to determine diff...   7.01.2012 - 20:18
|- - nokh   Цитата(Alex_Z @ 7.01.2012 - 22:18) С...   7.01.2012 - 21:17
|- - Olga_   Цитата(nokh @ 7.01.2012 - 19:17) Рас...   7.01.2012 - 22:05
|- - Olga_   Цитата(Olga_ @ 7.01.2012 - 20:05) ...   8.01.2012 - 01:30
|- - p2004r   Я иногда заглядывал в википедию (на редкость вменя...   8.01.2012 - 12:43
|- - Olga_   Цитата(p2004r @ 8.01.2012 - 10:43) Я...   8.01.2012 - 16:30
|- - p2004r   Цитата(Olga_ @ 8.01.2012 - 16:30) Я ...   8.01.2012 - 21:21
|- - p2004r   Цитата(Olga_ @ 8.01.2012 - 16:30) То...   8.01.2012 - 21:38
- - Alex_Z   "Если омнибусный тест не показывает межгруппо...   7.01.2012 - 21:30
|- - 100$   -> Nokh, а у Вас совершенно случайно нет ссылоч...   7.01.2012 - 22:16
||- - nokh   Цитата(100$ @ 8.01.2012 - 00:16...   9.01.2012 - 12:16
||- - 100$   Цитата(nokh @ 9.01.2012 - 12:16) Есл...   9.01.2012 - 14:11
||- - nokh   > Olga_ Цитата(Olga_ @ 9.01.2012 - 1...   29.01.2012 - 08:03
|- - nokh   Цитата(Alex_Z @ 7.01.2012 - 23:30) ...   9.01.2012 - 11:49
- - Olga_   Уважаемый nokh, Тест Краскелла-Уоллиса предназнач...   9.01.2012 - 14:05
- - Alex_Z   Спасибо большое за помощь. Что-то начало вырисовыв...   9.01.2012 - 22:35
- - 100$   Nokh, Вас понял, спасибо.   29.01.2012 - 13:53


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему