Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> multifactor dimensionality reduction
_alena_
сообщение 14.11.2011 - 13:19
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 42
Регистрация: 14.11.2011
Пользователь №: 23301



всем привет. очень нуждаюсь в помощи и советах.... кто то знаком с multifactor dimensionality reduction??? что можно почитать о том как работать в этой среде? для каких видов данных она предназначена??? а то мне все что встречалось касается генной информации. можно ли применять другие выборки? спасибо
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
_alena_
сообщение 11.02.2012 - 19:45
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 42
Регистрация: 14.11.2011
Пользователь №: 23301



всем привет. буду благодарна за подсказки! скажите в МDR как кодируются данные? я смотрела пример там 0,1,2 когда я попыталась ввести скажем еще 3 то уже не работало... и что кодируется нулем что 1 и 2? я о том что к примеру если да то 1, если нет то 0?
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
Olga_
сообщение 11.02.2012 - 23:48
Сообщение #3





Группа: Пользователи
Сообщений: 43
Регистрация: 4.01.2012
Пользователь №: 23400



Цитата(_alena_ @ 11.02.2012 - 17:45) *
всем привет. буду благодарна за подсказки! скажите в МDR как кодируются данные? я смотрела пример там 0,1,2 когда я попыталась ввести скажем еще 3 то уже не работало... и что кодируется нулем что 1 и 2? я о том что к примеру если да то 1, если нет то 0?


Если вы НЕ анализируете межгенные взаимодействия или же взаимодействие ген-окружающая среда, то зачем вам нужно использовать метод MDR??
MDR разрабатывался для анализа генетических данных.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
_alena_
сообщение 13.02.2012 - 09:18
Сообщение #4





Группа: Пользователи
Сообщений: 42
Регистрация: 14.11.2011
Пользователь №: 23301



Цитата(Olga_ @ 11.02.2012 - 22:48) *
Если вы НЕ анализируете межгенные взаимодействия или же взаимодействие ген-окружающая среда, то зачем вам нужно использовать метод MDR??
MDR разрабатывался для анализа генетических данных.

мне сказали что если правильно закодировать данные то не важно межгенные там взаимодействия или какие то другие
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
Olga_
сообщение 13.02.2012 - 14:54
Сообщение #5





Группа: Пользователи
Сообщений: 43
Регистрация: 4.01.2012
Пользователь №: 23400



Цитата(_alena_ @ 13.02.2012 - 07:18) *
мне сказали что если правильно закодировать данные то не важно межгенные там взаимодействия или какие то другие


Странный совет вам дали. 0, 1, 2 обычно кодируется генотип (АА, Аа, аа).
Используйте обычные статистические пакеты, т.к. не понимая ни основ статистики, ни генетического анализа, вы не сможете правильно закодировать данные и посчитать результат.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- _alena_   multifactor dimensionality reduction   14.11.2011 - 13:19
- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 14.11.2011 - 12:19)...   14.11.2011 - 18:01
- - _alena_   есть данные по кардиологии. предоперационных набор...   14.11.2011 - 22:28
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 14.11.2011 - 21:28)...   15.11.2011 - 21:55
|- - 9oclock   Цитата(_alena_ @ 14.11.2011 - 23:28)...   21.11.2011 - 17:50
||- - p2004r   Цитата(9oclock @ 21.11.2011 - 17:50)...   21.11.2011 - 18:00
||- - _alena_   Цитата(9oclock @ 21.11.2011 - 16:50)...   21.11.2011 - 18:10
||- - p2004r   Цитата(9oclock @ 21.11.2011 - 17:50)...   21.11.2011 - 19:01
|- - Larina Tatjana   Цитата(_alena_ @ 15.11.2011 - 04:58)...   5.03.2012 - 19:40
|- - _alena_   Цитата(Larina Tatjana @ 5.03.2012 - 18...   18.03.2012 - 22:50
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 18.03.2012 - 22:50)...   19.03.2012 - 11:29
|- - _alena_   Цитата(p2004r @ 19.03.2012 - 10:29) ...   20.03.2012 - 11:43
- - _alena_   ого го... чувствую себя вообще стерильной.... наве...   16.11.2011 - 10:40
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 16.11.2011 - 09:40)...   16.11.2011 - 11:45
- - _alena_   если я правильно поняла мне нужно начать с логрегр...   16.11.2011 - 10:43
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 16.11.2011 - 09:43)...   16.11.2011 - 11:58
|- - _alena_   Цитата(p2004r @ 16.11.2011 - 10:58) ...   16.11.2011 - 12:25
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 16.11.2011 - 11:25)...   16.11.2011 - 15:12
|- - _alena_   Цитата(p2004r @ 16.11.2011 - 14:12) ...   20.11.2011 - 20:35
|- - _alena_   Цитата(_alena_ @ 20.11.2011 - 19:35)...   20.11.2011 - 20:41
- - _alena_   здравствуйте, решила попытаться сделать вот что. з...   20.11.2011 - 17:48
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 20.11.2011 - 17:48)...   20.11.2011 - 18:11
- - _alena_   креплю   20.11.2011 - 18:58
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 20.11.2011 - 18:58)...   21.11.2011 - 15:21
|- - _alena_   Цитата(p2004r @ 21.11.2011 - 14:21) ...   21.11.2011 - 17:44
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 21.11.2011 - 17:44)...   21.11.2011 - 18:16
- - _alena_   просто сама не могла толком сформулировать свои по...   21.11.2011 - 18:12
- - TheThing   Здравствуйте! Довольно продолжительное время ...   27.11.2011 - 00:10
|- - _alena_   Цитата(TheThing @ 26.11.2011 - 23:10...   30.11.2011 - 11:23
|- - _alena_   TheThing, извините еще за глуппый вопрос. я алгори...   30.11.2011 - 12:32
|- - TheThing   Цитата(_alena_ @ 30.11.2011 - 12:32)...   2.12.2011 - 16:28
- - _alena_   всем привет. буду благодарна за подсказки! ска...   11.02.2012 - 19:45
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 11.02.2012 - 19:45)...   11.02.2012 - 23:04
|- - Olga_   Цитата(_alena_ @ 11.02.2012 - 17:45)...   11.02.2012 - 23:48
|- - _alena_   Цитата(Olga_ @ 11.02.2012 - 22:48) Е...   13.02.2012 - 09:18
|- - Olga_   Цитата(_alena_ @ 13.02.2012 - 07:18)...   13.02.2012 - 14:54
- - TheThing   Да выкладывайте уже, сможем-сможем   20.03.2012 - 14:00
|- - _alena_   Цитата(TheThing @ 20.03.2012 - 13:00...   21.03.2012 - 09:19
|- - YVR   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 11:19)...   21.03.2012 - 09:49
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 09:19)...   21.03.2012 - 10:27
|- - _alena_   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 08:19)...   21.03.2012 - 12:32
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:32)...   21.03.2012 - 12:46
|- - p2004r   Цитата(p2004r @ 21.03.2012 - 12:46) ...   21.03.2012 - 13:18
- - _alena_   мне сам принцип понять.... я просто взяла выборку ...   21.03.2012 - 10:18
|- - YVR   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:18)...   21.03.2012 - 10:22
- - _alena_   извините, не думала что прям так важно все данные ...   21.03.2012 - 10:41
|- - YVR   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:41)...   21.03.2012 - 10:49
||- - _alena_   Цитата(YVR @ 21.03.2012 - 09:49) А п...   21.03.2012 - 10:57
||- - YVR   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:57)...   21.03.2012 - 11:01
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 10:41)...   21.03.2012 - 10:53
|- - _alena_   Цитата(p2004r @ 21.03.2012 - 09:53) ...   21.03.2012 - 11:01
|- - YVR   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 13:01)...   21.03.2012 - 11:05
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 11:01)...   21.03.2012 - 11:52
|- - p2004r   Цитата(p2004r @ 21.03.2012 - 11:52) ...   21.03.2012 - 12:34
|- - YVR   Цитата(p2004r @ 21.03.2012 - 14:34) ...   21.03.2012 - 20:50
|- - p2004r   Цитата(YVR @ 21.03.2012 - 20:50) Что...   22.03.2012 - 01:17
|- - p2004r   Ну нелинейно так нелинейно Итак randomForest, он...   23.03.2012 - 17:25
- - _alena_   файл   21.03.2012 - 11:21
|- - YVR   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 13:21)...   21.03.2012 - 11:45
- - _alena_   ну все здорово...спасибо за ваш труд. но извините ...   21.03.2012 - 12:41
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:41)...   21.03.2012 - 12:49
|- - _alena_   Цитата(p2004r @ 21.03.2012 - 11:49) ...   21.03.2012 - 12:59
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:59)...   21.03.2012 - 13:09
- - YVR   Собрал экспертную систему в Excel файле. Вычисляет...   23.03.2012 - 09:37
- - _alena_   так а в MDR можно что то сделать???? если да то по...   23.03.2012 - 16:35


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему