Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> multifactor dimensionality reduction
_alena_
сообщение 14.11.2011 - 13:19
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 42
Регистрация: 14.11.2011
Пользователь №: 23301



всем привет. очень нуждаюсь в помощи и советах.... кто то знаком с multifactor dimensionality reduction??? что можно почитать о том как работать в этой среде? для каких видов данных она предназначена??? а то мне все что встречалось касается генной информации. можно ли применять другие выборки? спасибо
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
_alena_
сообщение 14.11.2011 - 22:28
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 42
Регистрация: 14.11.2011
Пользователь №: 23301



есть данные по кардиологии. предоперационных набор параметров и постоперационных.планирую применить логистическую регрессиюю для определения риска того или иного вмешатальства и ислледования влияния пороков. посоветовали воспользоваться multifactor dimensionality reduction и permutation test.пока понятия не имею с чего начать и к чему приступить
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
Larina Tatjana
сообщение 5.03.2012 - 19:40
Сообщение #3





Группа: Пользователи
Сообщений: 49
Регистрация: 3.03.2012
Из: USA
Пользователь №: 23536



Цитата(_alena_ @ 15.11.2011 - 04:58) *
есть данные по кардиологии. предоперационных набор параметров и постоперационных.планирую применить логистическую регрессиюю для определения риска того или иного вмешатальства и ислледования влияния пороков. посоветовали воспользоваться multifactor dimensionality reduction и permutation test.пока понятия не имею с чего начать и к чему приступить


Привет, _alena_ !
Хочу напомнить, что термин "Reduction" означает свёртку, уменьшение, снижение (в контексте письма) размерности пространства признаков. Т.е. это не 1 какой-то конкретный метод, а целый набор различных методов. Многие из этих методов описаны в книгах по многомерной статистике, и не только в книгах. Можете найти на Ютюбе "Канал пользователя biostat1911", где некоторые из этих методов кратко описаны в видео-формате. Это означает, что неправильно ориентироваться на выбор 1 единственного метода. Все методы этой группы взаимно дополняют друг друга. В принципе я согласна с "p2004r" в том, что логит-регрессия в данном случае более предпочтительна. Однако для того чтобы выбрать лучшие уравнения логистической регрессии, и далее верно интерпретировать эти уравнения, нужны результаты и по другим методам. А сделать корректно это под силу лишь профессиональным биостатистикам. Это ведь не вычисление дисперсии или коэффициентов корреляции. У меня тоже в своё время были аналогичные данные и задачи. И я сама кое-что наковыряла. Но когда познакомилась с результатами лог-регрессии у своего научного руководителя, которому считал профессионал, поняла, что мои результаты не имеют никакой ценности. И далее списалась с профи. В результате из сотни с лишним уравнений, полученных для разных подгрупп больных, выбрала около десятка самых ценных и удобных. Вообще надо понимать, на что лучше с большей пользой потратить время: на самоделки в сложной статистике, или на осмысление результатов, полученных профи. Я лично за второй вариант. Кстати, у америкосов в журналах прямо об этом говорится. Потому у них среди соавторов статей так много профессиональных биостатистиков.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
_alena_
сообщение 18.03.2012 - 22:50
Сообщение #4





Группа: Пользователи
Сообщений: 42
Регистрация: 14.11.2011
Пользователь №: 23301



Цитата(Larina Tatjana @ 5.03.2012 - 18:40) *
Вообще надо понимать, на что лучше с большей пользой потратить время: на самоделки в сложной статистике, или на осмысление результатов, полученных профи.

Здравствуйте, Татьяна!

Я понимаю, но особо противоречить научруку не могу....сказал посмотреть что этим методом получится вот и пытаюсь как то разобраться и в логрегрессии и дискриминантном анализе и в MDR....

(((

уж совсем отчаялась....
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
p2004r
сообщение 19.03.2012 - 11:29
Сообщение #5





Группа: Пользователи
Сообщений: 1091
Регистрация: 26.08.2010
Пользователь №: 22699



Цитата(_alena_ @ 18.03.2012 - 22:50) *
Здравствуйте, Татьяна!

Я понимаю, но особо противоречить научруку не могу....сказал посмотреть что этим методом получится вот и пытаюсь как то разобраться и в логрегрессии и дискриминантном анализе и в MDR....

(((

уж совсем отчаялась....


так данные загрузите в форум в формате csv (если они не секретные конечно), с небольшим пояснением что из показателей выход, а что вход классификации. давайте вместе посмотрим что в них видно.


Signature
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- _alena_   multifactor dimensionality reduction   14.11.2011 - 13:19
- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 14.11.2011 - 12:19)...   14.11.2011 - 18:01
- - _alena_   есть данные по кардиологии. предоперационных набор...   14.11.2011 - 22:28
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 14.11.2011 - 21:28)...   15.11.2011 - 21:55
|- - 9oclock   Цитата(_alena_ @ 14.11.2011 - 23:28)...   21.11.2011 - 17:50
||- - p2004r   Цитата(9oclock @ 21.11.2011 - 17:50)...   21.11.2011 - 18:00
||- - _alena_   Цитата(9oclock @ 21.11.2011 - 16:50)...   21.11.2011 - 18:10
||- - p2004r   Цитата(9oclock @ 21.11.2011 - 17:50)...   21.11.2011 - 19:01
|- - Larina Tatjana   Цитата(_alena_ @ 15.11.2011 - 04:58)...   5.03.2012 - 19:40
|- - _alena_   Цитата(Larina Tatjana @ 5.03.2012 - 18...   18.03.2012 - 22:50
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 18.03.2012 - 22:50)...   19.03.2012 - 11:29
|- - _alena_   Цитата(p2004r @ 19.03.2012 - 10:29) ...   20.03.2012 - 11:43
- - _alena_   ого го... чувствую себя вообще стерильной.... наве...   16.11.2011 - 10:40
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 16.11.2011 - 09:40)...   16.11.2011 - 11:45
- - _alena_   если я правильно поняла мне нужно начать с логрегр...   16.11.2011 - 10:43
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 16.11.2011 - 09:43)...   16.11.2011 - 11:58
|- - _alena_   Цитата(p2004r @ 16.11.2011 - 10:58) ...   16.11.2011 - 12:25
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 16.11.2011 - 11:25)...   16.11.2011 - 15:12
|- - _alena_   Цитата(p2004r @ 16.11.2011 - 14:12) ...   20.11.2011 - 20:35
|- - _alena_   Цитата(_alena_ @ 20.11.2011 - 19:35)...   20.11.2011 - 20:41
- - _alena_   здравствуйте, решила попытаться сделать вот что. з...   20.11.2011 - 17:48
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 20.11.2011 - 17:48)...   20.11.2011 - 18:11
- - _alena_   креплю   20.11.2011 - 18:58
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 20.11.2011 - 18:58)...   21.11.2011 - 15:21
|- - _alena_   Цитата(p2004r @ 21.11.2011 - 14:21) ...   21.11.2011 - 17:44
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 21.11.2011 - 17:44)...   21.11.2011 - 18:16
- - _alena_   просто сама не могла толком сформулировать свои по...   21.11.2011 - 18:12
- - TheThing   Здравствуйте! Довольно продолжительное время ...   27.11.2011 - 00:10
|- - _alena_   Цитата(TheThing @ 26.11.2011 - 23:10...   30.11.2011 - 11:23
|- - _alena_   TheThing, извините еще за глуппый вопрос. я алгори...   30.11.2011 - 12:32
|- - TheThing   Цитата(_alena_ @ 30.11.2011 - 12:32)...   2.12.2011 - 16:28
- - _alena_   всем привет. буду благодарна за подсказки! ска...   11.02.2012 - 19:45
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 11.02.2012 - 19:45)...   11.02.2012 - 23:04
|- - Olga_   Цитата(_alena_ @ 11.02.2012 - 17:45)...   11.02.2012 - 23:48
|- - _alena_   Цитата(Olga_ @ 11.02.2012 - 22:48) Е...   13.02.2012 - 09:18
|- - Olga_   Цитата(_alena_ @ 13.02.2012 - 07:18)...   13.02.2012 - 14:54
- - TheThing   Да выкладывайте уже, сможем-сможем   20.03.2012 - 14:00
|- - _alena_   Цитата(TheThing @ 20.03.2012 - 13:00...   21.03.2012 - 09:19
|- - YVR   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 11:19)...   21.03.2012 - 09:49
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 09:19)...   21.03.2012 - 10:27
|- - _alena_   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 08:19)...   21.03.2012 - 12:32
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:32)...   21.03.2012 - 12:46
|- - p2004r   Цитата(p2004r @ 21.03.2012 - 12:46) ...   21.03.2012 - 13:18
- - _alena_   мне сам принцип понять.... я просто взяла выборку ...   21.03.2012 - 10:18
|- - YVR   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:18)...   21.03.2012 - 10:22
- - _alena_   извините, не думала что прям так важно все данные ...   21.03.2012 - 10:41
|- - YVR   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:41)...   21.03.2012 - 10:49
||- - _alena_   Цитата(YVR @ 21.03.2012 - 09:49) А п...   21.03.2012 - 10:57
||- - YVR   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:57)...   21.03.2012 - 11:01
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 10:41)...   21.03.2012 - 10:53
|- - _alena_   Цитата(p2004r @ 21.03.2012 - 09:53) ...   21.03.2012 - 11:01
|- - YVR   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 13:01)...   21.03.2012 - 11:05
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 11:01)...   21.03.2012 - 11:52
|- - p2004r   Цитата(p2004r @ 21.03.2012 - 11:52) ...   21.03.2012 - 12:34
|- - YVR   Цитата(p2004r @ 21.03.2012 - 14:34) ...   21.03.2012 - 20:50
|- - p2004r   Цитата(YVR @ 21.03.2012 - 20:50) Что...   22.03.2012 - 01:17
|- - p2004r   Ну нелинейно так нелинейно Итак randomForest, он...   23.03.2012 - 17:25
- - _alena_   файл   21.03.2012 - 11:21
|- - YVR   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 13:21)...   21.03.2012 - 11:45
- - _alena_   ну все здорово...спасибо за ваш труд. но извините ...   21.03.2012 - 12:41
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:41)...   21.03.2012 - 12:49
|- - _alena_   Цитата(p2004r @ 21.03.2012 - 11:49) ...   21.03.2012 - 12:59
|- - p2004r   Цитата(_alena_ @ 21.03.2012 - 12:59)...   21.03.2012 - 13:09
- - YVR   Собрал экспертную систему в Excel файле. Вычисляет...   23.03.2012 - 09:37
- - _alena_   так а в MDR можно что то сделать???? если да то по...   23.03.2012 - 16:35


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему