Определение чувствительности и специфичности комбинации маркеров Опции

[Zaycho]

Здравствуйте!

Есть задача определить диагностическую ценность ряда маркеров (допустим, А, В и С) и их комбинаций в диагностике некоторого заболевания.
Я расчитал все параметры (чувствительность, специфичность, PPV, NPV, LR) и построил в SPSS ROC-кривые отдельно для А, В и С.
Как теперь сделать то же самое для комбинаций этих маркеров, допустим, А+В и В+С? Где копать?

Заранее огромное спасибо!

[TheThing]

Здравствуйте!

Есть задача определить диагностическую ценность ряда маркеров (допустим, А, В и С) и их комбинаций в диагностике некоторого заболевания.
Я расчитал все параметры (чувствительность, специфичность, PPV, NPV, LR) и построил в SPSS ROC-кривые отдельно для А, В и С.
Как теперь сделать то же самое для комбинаций этих маркеров, допустим, А+В и В+С? Где копать?

Заранее огромное спасибо!

Если Вы лучше знакомы с СПСС, постройте модель с помощью логистической регрессии. Заходите в Analyze-Regression-Binary. Факторы А,Б,С перемещаете в Covariates (independent variables), наличие/отсутсвие заболевания в Dependent variable. Закладка Categorical Вам не нужна, поскольку, как я понял, предикторы все у вас количественные. В закладке Save выбираете сохранить вероятности группы (group probabilities). В опциях 95% ДИ, тест Хосмера-Лемешова и все остальное по-желанию. Нажимаете ОК, строится модель, которая включает в себя набор всех предикторов А,Б,С, рассчитанные коэффициенты, р-значения, ДИ и т.д. ROC-кривая строится с помощью меню ROC-curve, где в Test-variable Вы закидываете рассчитанные групповые вероятности, а в State - указываете код, которым у Вас закодировано состояние больного человека (1 например).

Построенная логистическая модель может предсказывать аддитивный (суммационный) эффект всех факторов А,Б,С на риск развития заболевания. То есть, все факторы представлены главными эффектами (main effects) - не учитывается возможность взаимодействия фактора А например с фактором Б. Если Вас такое устраивает, можно на этом остановиться. А если Вам интересно посмотреть взаимодействует ли фактор А с фактором Б (присутствует ли синергетический эффект например), нужно построить модель, которая учитывала бы взаимодействие факторов (для этого используется кнопочка a*b в логистической регрессии). Интерпретировать результаты будет намного сложнее, могу посоветовать хорошую книгу на эту тему от Sage publishing - Interaction effects (terms) in logistic regression.

Если нравятся случайные леса, установите SPSS Clementine или используйте код, который привел p2004r

Сообщение отредактировал TheThing - 3.08.2012 - 08:56