Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )
2.08.2012 - 14:20
Сообщение
#1
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 10 Регистрация: 2.08.2012 Пользователь №: 24035 |
Здравствуйте!
Есть задача определить диагностическую ценность ряда маркеров (допустим, А, В и С) и их комбинаций в диагностике некоторого заболевания. Я расчитал все параметры (чувствительность, специфичность, PPV, NPV, LR) и построил в SPSS ROC-кривые отдельно для А, В и С. Как теперь сделать то же самое для комбинаций этих маркеров, допустим, А+В и В+С? Где копать? Заранее огромное спасибо! |
|
|
![]() |
![]() |
![]() |
3.08.2012 - 20:07
Сообщение
#2
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 116 Регистрация: 20.02.2011 Пользователь №: 23251 |
Согласно моим расчетам лишь фактор С (тяжесть состояния больного) статистически значимо ассоциирован с риском смерти (повышенный риск). Первый столбец цифр - групповые вероятности факторов А+Б+С, второй столбец - вероятности А+Б, третий столбец - А+С, четвертый - Б+С.
0,34015 0,40888 0,34989 0,39730 0,49263 0,50523 0,38566 0,55469 0,42836 0,26548 0,39794 0,62781 0,59121 0,36225 0,60615 0,70132 0,25785 0,31131 0,25945 0,36786 0,43051 0,43519 0,44927 0,47932 0,57229 0,30174 0,58240 0,72457 0,25236 0,38984 0,23751 0,31511 0,48796 0,40442 0,50717 0,56495 0,28626 0,39493 0,29287 0,34319 0,49658 0,37706 0,51123 0,59569 0,37246 0,31495 0,38091 0,50680 0,12237 0,25227 0,11330 0,21316 0,12748 0,31118 0,10785 0,19567 0,53328 0,46286 0,54719 0,57564 0,52075 0,45196 0,49164 0,58775 0,49832 0,42483 0,47445 0,58010 0,36305 0,40782 0,37485 0,42414 0,45776 0,43172 0,47040 0,51505 0,36475 0,42263 0,34469 0,43039 0,57694 0,45255 0,59446 0,62775 0,76129 0,46953 0,75743 0,81078 0,14571 0,39503 0,14859 0,16921 0,13010 0,47251 0,11741 0,13051 0,18435 0,41960 0,15968 0,21998 0,11134 0,39310 0,10980 0,12896 0,86965 0,82693 0,66838 0,83274 0,72274 0,61052 0,74657 0,68379 0,88778 0,82411 0,75763 0,84437 0,86492 0,79245 0,63566 0,81702 0,75099 0,74476 0,35380 0,73615 0,40006 0,19948 0,83108 0,69577 0,83671 0,77659 0,73978 0,64728 0,77173 0,67595 0,67489 0,61222 0,70833 0,62232 0,79319 0,67501 0,82141 0,72640 0,69415 0,70943 0,72958 0,57129 0,70840 0,70052 0,74604 0,59504 0,73655 0,79736 0,77758 0,54065 0,58925 0,63310 0,62808 0,50647 0,55043 0,71285 0,58524 0,40279 0,69639 0,67085 0,71908 0,61115 0,88188 0,67862 0,89790 0,84678 0,46330 0,67591 0,50338 0,33916 0,49648 0,53330 0,52366 0,48054 0,74687 0,58398 0,77340 0,72615 0,47468 0,57482 0,49834 0,42908 0,54642 0,51868 0,56019 0,55171 0,34062 0,60430 0,36285 0,27085 0,73011 0,55340 0,75691 0,72478 0,76456 0,50137 0,78571 0,78991 0,60758 0,46409 0,63096 0,64996 0,66616 0,59398 0,69391 0,62750 0,76595 0,57299 0,74402 0,77482 0,53226 0,56143 0,52938 0,51339 0,65210 0,57569 0,68407 0,62190 0,55687 0,54630 0,58823 0,53632 0,82779 0,56820 0,84837 0,82598 0,63646 0,52353 0,63253 0,65455 0,25158 0,48530 0,26149 0,24793 0,76566 0,53693 0,78297 0,77582 0,66544 0,55563 0,69248 0,65225 0,35473 0,50851 0,36883 0,34657 0,47536 0,54117 0,50240 0,45183 0,68043 0,58309 0,71167 0,64929 0,32747 0,47152 0,34773 0,33673 0,12440 0,56551 0,13399 0,09099 0,74684 0,58395 0,77340 0,72612 0,47667 0,58016 0,50408 0,42592 0,32795 0,59106 0,35756 0,26315 0,56675 0,64000 0,45425 0,54231 Коэффициент конкордации около 65%, что в принципе совпадает с классификационной способностью модели, полученной с помощью случайного леса (100 - OOB error = 100 - 31,43 = 68,57%). Сообщение отредактировал TheThing - 3.08.2012 - 20:12 |
|
|
![]() |
![]() |
Zaycho Определение чувствительности и специфичности комбинации маркеров 2.08.2012 - 14:20
p2004r Цитата(Zaycho @ 2.08.2012 - 14:20) З... 2.08.2012 - 14:24
Zaycho Цитата(p2004r @ 2.08.2012 - 15:24) м... 2.08.2012 - 14:37
p2004r Цитата(Zaycho @ 2.08.2012 - 14:37) B... 2.08.2012 - 19:38
Zaycho А можно я все-таки покажу исходные данные?
А, В и ... 2.08.2012 - 21:55
p2004r Цитата(Zaycho @ 2.08.2012 - 21:55) А... 3.08.2012 - 12:04
Zaycho Огромное спасибо за разъяснения! А можете тепе... 3.08.2012 - 14:27
p2004r Цитата(Zaycho @ 3.08.2012 - 14:27) О... 3.08.2012 - 14:59
Zaycho Глубокоуважаемый p2004r, правильно ли я понял, что... 3.08.2012 - 16:05
p2004r Цитата(Zaycho @ 3.08.2012 - 16:05) Г... 3.08.2012 - 16:30
Zaycho Я вконец запутался. А,В и С - это параметры, не вл... 3.08.2012 - 16:38
p2004r Цитата(Zaycho @ 3.08.2012 - 16:38) Я... 3.08.2012 - 19:29
TheThing Цитата(Zaycho @ 2.08.2012 - 14:20) З... 3.08.2012 - 08:55
p2004r Цитата(TheThing @ 3.08.2012 - 20:07)... 3.08.2012 - 21:12
TheThing значит логистическая регрессия и рэндом форест даю... 3.08.2012 - 21:22
p2004r Цитата(TheThing @ 3.08.2012 - 21:22)... 3.08.2012 - 21:48
DrgLena А если не лес строить, а одно дерево, то при одном... 3.08.2012 - 23:56
p2004r Цитата(DrgLena @ 3.08.2012 - 23:56) ... 4.08.2012 - 10:42
p2004r собственно да, svm получше выделяет
Код> mode... 4.08.2012 - 11:18
p2004r линеаризирующее преобразование (!после отрезан... 4.08.2012 - 11:41
Zaycho Коллеги, а если вернуться к посту #14, то как опре... 5.08.2012 - 11:23
p2004r Цитата(Zaycho @ 5.08.2012 - 11:23) К... 5.08.2012 - 12:55
Zaycho Да, я и не предполагал, что задача окажется не так... 4.08.2012 - 09:39
TheThing Решил сделать рэндом форест, а также построить про... 5.08.2012 - 15:37
p2004r и все таки, после применения правила С>25, оста... 5.08.2012 - 15:56
TheThing Кстати, вот хорошая статья, где проводился сравнит... 5.08.2012 - 16:40
p2004r Цитата(TheThing @ 5.08.2012 - 16:40)... 5.08.2012 - 19:05
Диана Раз зашла речь про ROC-анализ в программе SPSS под... 16.08.2012 - 09:25
TheThing Цитата(Диана @ 16.08.2012 - 09:25) Р... 16.08.2012 - 15:38
Диана Цитата(TheThing @ 16.08.2012 - 16:38... 16.08.2012 - 20:10
p2004r Цитата(Диана @ 16.08.2012 - 20:10) С... 16.08.2012 - 21:53
TheThing Цитата(Диана @ 16.08.2012 - 20:10) С... 16.08.2012 - 22:34
Диана КФР-контролируемый фактор риска, НФР-неконтролируе... 17.08.2012 - 09:02
p2004r Цитата(Диана @ 17.08.2012 - 09:02) К... 17.08.2012 - 15:28
Диана я немножко сократила таблицу, убрала малоинтересую... 17.08.2012 - 18:05
p2004r Цитата(Диана @ 17.08.2012 - 18:05) я... 17.08.2012 - 22:26
Диана Факторы риска:
2
3
5 ... 18.08.2012 - 08:58
p2004r Цитата(Диана @ 18.08.2012 - 08:58) Ф... 18.08.2012 - 13:18
Диана спасибо за помощь. колонки 44-46 не имеют влияние... 18.08.2012 - 20:57
p2004r Цитата(Диана @ 18.08.2012 - 20:57) с... 18.08.2012 - 22:37
Диана колонки 44А 45А 46А были перекодированные колонки ... 19.08.2012 - 09:21
Диана Подскажите кто знает: возможно ли удалить выложенн... 26.08.2012 - 08:57
Диана ничего не получается, от проводимого лечения нет д... 26.08.2012 - 08:59
p2004r Цитата(Диана @ 26.08.2012 - 08:59) н... 27.08.2012 - 15:12
Диана Цитата(p2004r @ 27.08.2012 - 16:12) ... 27.08.2012 - 16:58
p2004r Цитата(Диана @ 27.08.2012 - 16:58) з... 27.08.2012 - 17:14
Диана 2) "влияет ли тип операции на снижение частот... 27.08.2012 - 17:42
Диана Хорошо, 13 колонка делит пациентов на 3 группы. Ле... 27.08.2012 - 17:25
Диана 1) влияет ли снижение ЧСС до операции на снижение ... 27.08.2012 - 17:29
p2004r Цитата(Диана @ 27.08.2012 - 17:29) 1... 27.08.2012 - 22:24
Диана супер, в мозаичных графиках данные очень наглядно ... 28.08.2012 - 09:02
p2004r Цитата(Диана @ 28.08.2012 - 09:02) с... 28.08.2012 - 12:07
Диана у меня есть данные факторного анализа, но, как сей... 28.08.2012 - 13:46
p2004r Цитата(Диана @ 28.08.2012 - 13:46) у... 28.08.2012 - 19:54
Диана RE: Определение чувствительности и специфичности комбинации маркеров 28.08.2012 - 21:10
p2004r Цитата(Диана @ 28.08.2012 - 21:10)
... 31.08.2012 - 16:49
Диана фактически группы две - 1 и 3, вторая размазана ме... 1.09.2012 - 22:22
Диана не могу разобраться с 3 графиком, какой то он слож... 1.09.2012 - 22:26
p2004r Цитата(Диана @ 1.09.2012 - 22:26) н... 3.09.2012 - 18:18
p2004r Для новых данных надо заново номера переменных соб... 7.09.2012 - 20:00
p2004r Цитата(p2004r @ 7.09.2012 - 20:00) Д... 10.09.2012 - 11:33
Диана ГБ : int 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 .... 10.09.2012 - 21:47![]() ![]() |