Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> Критерий Фишера для таблиц NxM при малых выборках
Camel1000
сообщение 4.03.2013 - 19:25
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 17
Регистрация: 3.02.2013
Пользователь №: 24599



Всем добрый день!

Такая ситуация: есть экспрессия некоего гена, оцененная ИГХ в баллах от 1 до 5. Строим таблицу для клинического фактора Z - первая и вторая степени, условно. Получаем таблицу сопряженности 5x2:

Э Z1 Z2
1 2 1
2 2 8
3 6 3
4 3 1
5 0 3

Расчет точного критерия Фишера (в SPSS) дает 0,065 (допустим, нас интересуют случаи < 0,1).
Но как при попытках свести это к любой таблице 2x2, так и при попытках попарных сравнений (довольно беспомощных, потому что на самом деле я не очень понимаю, как делать post hoc попарные сравнения в таком случае) ничего осмысленного не выходит.
Вопрос: можно ли, как думают уважаемые форумчане, дальше пытаться что-то из этого выжать, или при таком объеме данных все это не имеет физического смысла?

Андрей АКА Camel1000

Сообщение отредактировал Camel1000 - 4.03.2013 - 19:28
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
DoctorStat
сообщение 4.03.2013 - 20:41
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 381
Регистрация: 18.08.2008
Из: Москва Златоглавая
Пользователь №: 5224



Цитата(Camel1000 @ 4.03.2013 - 20:25) *
можно ли, как думают уважаемые форумчане, дальше пытаться что-то из этого выжать?
Выжать дополнительную информацию не только можно, но я бы даже сказал нужно! Для этого необходимо воспользоваться волшебной программой "Электронная таблица" на моем сайте. Способ, который группирует качественные факторы по степени риска описан на том же сайте в разделе "Технологии". Из вывода программы (см.приложенный к тексту рисунок) видно все уровни экспрессии группируются в два кластера в зависимости от риска попадания в состояния Z1 или Z2. Уровни Э5 и Э2 (кластер 1) характерны для клинической фазы Z2, остальные Э1,Э3,Э4 (кластер 2) - для фазы Z1. Отношение шансов (Odds ratio) в последней таблице=12,1 . Это значит, что если у больного уровень экспрессии попал в кластер 1, то шанс нахождения больного в клиническом состоянии Z2 в 12,1 раз, больше, чем в состоянии Z1. Грубо говоря, на уровне значимости p=0,065 (вероятность точного критерия Фишера исходной таблицы, которая чуть-чуть не дотянула до желаемого стандарта p=0,05) уровень экспрессии гена является отличным (OR=12,1) маркером клинической фазы болезни.

Сообщение отредактировал DoctorStat - 5.03.2013 - 10:08
Эскизы прикрепленных изображений
Прикрепленное изображение
 


Signature
Просто включи мозги => http://doctorstat.narod.ru
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему