Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )
4.03.2013 - 19:25
Сообщение
#1
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 17 Регистрация: 3.02.2013 Пользователь №: 24599 |
Всем добрый день!
Такая ситуация: есть экспрессия некоего гена, оцененная ИГХ в баллах от 1 до 5. Строим таблицу для клинического фактора Z - первая и вторая степени, условно. Получаем таблицу сопряженности 5x2: Э Z1 Z2 1 2 1 2 2 8 3 6 3 4 3 1 5 0 3 Расчет точного критерия Фишера (в SPSS) дает 0,065 (допустим, нас интересуют случаи < 0,1). Но как при попытках свести это к любой таблице 2x2, так и при попытках попарных сравнений (довольно беспомощных, потому что на самом деле я не очень понимаю, как делать post hoc попарные сравнения в таком случае) ничего осмысленного не выходит. Вопрос: можно ли, как думают уважаемые форумчане, дальше пытаться что-то из этого выжать, или при таком объеме данных все это не имеет физического смысла? Андрей АКА Camel1000 Сообщение отредактировал Camel1000 - 4.03.2013 - 19:28 |
|
|
![]() |
![]() |
![]() |
4.03.2013 - 20:41
Сообщение
#2
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 381 Регистрация: 18.08.2008 Из: Москва Златоглавая Пользователь №: 5224 |
можно ли, как думают уважаемые форумчане, дальше пытаться что-то из этого выжать? Выжать дополнительную информацию не только можно, но я бы даже сказал нужно! Для этого необходимо воспользоваться волшебной программой "Электронная таблица" на моем сайте. Способ, который группирует качественные факторы по степени риска описан на том же сайте в разделе "Технологии". Из вывода программы (см.приложенный к тексту рисунок) видно все уровни экспрессии группируются в два кластера в зависимости от риска попадания в состояния Z1 или Z2. Уровни Э5 и Э2 (кластер 1) характерны для клинической фазы Z2, остальные Э1,Э3,Э4 (кластер 2) - для фазы Z1. Отношение шансов (Odds ratio) в последней таблице=12,1 . Это значит, что если у больного уровень экспрессии попал в кластер 1, то шанс нахождения больного в клиническом состоянии Z2 в 12,1 раз, больше, чем в состоянии Z1. Грубо говоря, на уровне значимости p=0,065 (вероятность точного критерия Фишера исходной таблицы, которая чуть-чуть не дотянула до желаемого стандарта p=0,05) уровень экспрессии гена является отличным (OR=12,1) маркером клинической фазы болезни.
Сообщение отредактировал DoctorStat - 5.03.2013 - 10:08 ![]() Просто включи мозги => http://doctorstat.narod.ru
|
|
|
![]() |
![]() |
Camel1000 Критерий Фишера для таблиц NxM при малых выборках 4.03.2013 - 19:25
nokh Цитата(Camel1000 @ 4.03.2013 - 22:25... 11.03.2013 - 21:25
Camel1000 Цитата(nokh @ 11.03.2013 - 22:25) 1.... 22.03.2013 - 14:07
Choledochus Программист спрашивает: в каких пределах изменяетс... 25.05.2020 - 13:36![]() ![]() |