 Логистическая регрессия или другое? Выбор оптимального метода |
Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )
 3.06.2013 - 17:56
Сообщение
#1
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 17 Регистрация: 3.02.2013 Пользователь №: 24599  |
Всем доброго времени суток!
Не помогут ли уважаемые джинны  в определении направления действий в такой ситуации?Имеется два значения для экспрессии некоего гена - 0 и 1 (низкая и высокая). В выборке из 70 больных для каждого из них известна экспрессия и некоторый набор клинических показателей, часть - ординальные, часть -номинальные, часть - непрерывные (все виды). Хочется узнать, есть ли связь между уровнем экспрессии гена и любым набором этих показателей? То есть есть ли связь между экспрессией и каждым параметром по отдельности? Или между экспрессией и совокупностью одного-двух-трех-... показателей? Как это лучше сделать и как вычленить такие наборы? Логистическая регрессия? Кластерный анализ? Тест для тренда Кохрана-Армитажа или разновидность хи-квадрата для трендов? В каком направлении копать? Заранее спасибо! |
 |
 
|
 |
|
 |
Ответов
|
5.06.2013 - 20:37
Сообщение
#2
|
|
 Группа: Пользователи Сообщений: 1091 Регистрация: 26.08.2010 Пользователь №: 22699 |
Цитата(Camel1000 @ 3.06.2013 - 17:56)  Всем доброго времени суток! Не помогут ли уважаемые джинны в определении направления действий в такой ситуации?Имеется два значения для экспрессии некоего гена - 0 и 1 (низкая и высокая). В выборке из 70 больных для каждого из них известна экспрессия и некоторый набор клинических показателей, часть - ординальные, часть -номинальные, часть - непрерывные (все виды). Хочется узнать, есть ли связь между уровнем экспрессии гена и любым набором этих показателей? То есть есть ли связь между экспрессией и каждым параметром по отдельности? Или между экспрессией и совокупностью одного-двух-трех-... показателей? Как это лучше сделать и как вычленить такие наборы? Логистическая регрессия? Кластерный анализ? Тест для тренда Кохрана-Армитажа или разновидность хи-квадрата для трендов? В каком направлении копать? Заранее спасибо! попытаться построить рандом форест который разделяет эти 0 и 1. и посмотреть вклад показателей. есть несколько методов поверх рандом форест которые могут оптимизировать набор показателей в направлении наилучшего разделения 0 и 1. например Boruta в R и еще один пакет по ROC смотрит оптимальные показатели того же рандом фореста.  |
|
|
|
|
|
Сообщений в этой теме
Camel1000 Логистическая регрессия или другое? Выбор оптимального метода 3.06.2013 - 17:56
nokh Цитата(Camel1000 @ 3.06.2013 - 20:56... 3.06.2013 - 23:00 anserovtv Если бы данных было чуть больше ,до 100. то я бы п... 4.06.2013 - 09:13 Camel1000 Всем спасибо за помощь, этого мне хватит разбирать... 6.06.2013 - 14:10
Енот Коллеги! Если есть возможность, поделитесь, по... 29.09.2013 - 21:18 |