Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )
15.08.2013 - 16:07
Сообщение
#1
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 125 Регистрация: 2.04.2012 Пользователь №: 23616 |
Друзья, подскажите какой метод в таком исследовании нужно пременить( и уместен ли тут дисперсионный анализ что - то я сомневаюсь, нужна помощь профи )
Суть эксперимента: есть пробирка с питательной средой и с определенной концентрацией вредного вещества(ВВ) (контроль), есть пробирка, где плюсом еще определенный штаммов (это опыт). Дальше добавили реагент, получили цветную реакцию с ВВ, померили оптическую плотность на спектрофотометре, получили значения оптической плотности контроля и опытных проб. В опытных пробах концентрация снизилась. Микроорганизмов 8 видов, повторностей около 7 прикреплю файл, может нагляднее будет. OD - оптическая плотность. rhamn, ferment, plant, AT-41, AT-44, 887, adol, bif - это обозначение штаммов. "Контроль" - это питательная среда с "вредным веществом" (ВВ), "Опыт" - это питательная среда с ВВ и с добавление штамма. % редукции - процент понижения ВВ среде - формула внесена в соответствие с методикой: %= 100 - ODопыт / ODконтр x 100%
Прикрепленные файлы
|
|
|
![]() |
![]() |
![]() |
16.08.2013 - 21:34
Сообщение
#2
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 1219 Регистрация: 13.01.2008 Из: Челябинск Пользователь №: 4704 |
Друзья, подскажите какой метод в таком исследовании нужно пременить( и уместен ли тут дисперсионный анализ что - то я сомневаюсь, нужна помощь профи ) Суть эксперимента: есть пробирка с питательной средой и с определенной концентрацией вредного вещества(ВВ) (контроль), есть пробирка, где плюсом еще определенный штаммов (это опыт). Дальше добавили реагент, получили цветную реакцию с ВВ, померили оптическую плотность на спектрофотометре, получили значения оптической плотности контроля и опытных проб. В опытных пробах концентрация снизилась. Микроорганизмов 8 видов, повторностей около 7 прикреплю файл, может нагляднее будет. OD - оптическая плотность. rhamn, ferment, plant, AT-41, AT-44, 887, adol, bif - это обозначение штаммов. "Контроль" - это питательная среда с "вредным веществом" (ВВ), "Опыт" - это питательная среда с ВВ и с добавление штамма. % редукции - процент понижения ВВ среде - формула внесена в соответствие с методикой: %= 100 - ODопыт / ODконтр x 100% Мне не до конца понятна схема и цель эксперимента. Скажем для ACT-44 есть 3 набора: из 10, 3 и 4 пар значений. Что это - истинные повторности, а значения внутри блока - повторные измерения внутри данной повторности? Какова цель: доказать снижение концентрации или сравнить активности МО. Если второе, то эксперимент спланирован плохо; об этом же говорят сильные различия в числе проб для разных штаммов. Статистика, конечно, выручит, но вообще такие данные сгодятся для натурных исследованйи, но не для научного экперимента. Нужно было питательную среду с известной концентрацией ВВ разделить на несколько пробирок: скажем, 3 контрольных и по 3 засеянных каждым из интересующих штаммов. Не 2 в одном случае и 10 - в другом, а везде по 3. Вторую (а может и третью) реализацию эксперимента можно было провести аналогично, но на другой исходной концентрации ВВ. Получился бы маленький, но хороший эксперимент, который позволил бы ответить и на ваши вопросы и на вопрос об угнетении/активации деструкции ВВ при разных их концентрациях в среде. В вашем же случае исходные концентрации ВВ для разных штаммом уже частично отличаются, а если продолжать собирать материал по другим штаммам аналогично - будут отличаться ещё сильнее. Теоретически это очень плохо, так как о степени редукции ВВ для разных штаммов вы пытаетесь судить по разным исходным концентрациям, т.е. грубо говоря, условия оценки степени редукции для разных штаммов различны и вы не контролируете этот фактор. Если бы я увидел такой материал на студенческой конференции, то просто бы сразу поставил все выводы докладчика (кроме вывода о самом факте редукции) под сомнение и ещё спросил бы чем докладчик руководствовался когда в одной повторности брал 2 пробирки, а в другой - 10. Если вы только в самом начале пути, то я бы на вашем месте отнёсся к полученным данным как к пилотным, написал бы по ним небольшую статейку и начал бы собирать материал заново и грамотно. К полученным данным дисперсионный анализ применить можно, только он не самый простой будет: с факторами "Штаммы" и "Повторности внутри Штаммов". Проценты предварительно нужно преобразовать угловым преобразованием, например фи-преобразованием (через арксинус), т.к. % распредлены априори ненормально. |
|
|
![]() |
![]() |
psychologist статистика в микробиологии 15.08.2013 - 16:07
p2004r Цитата(psychologist @ 15.08.2013 - 16... 15.08.2013 - 20:53
psychologist тут чисто себя проверить: Уместен ли он или нет и ... 16.08.2013 - 09:11
p2004r Цитата(psychologist @ 16.08.2013 - 09... 16.08.2013 - 15:56
psychologist сразу видно человека с научным мышлением. Это пока... 17.08.2013 - 11:59
psychologist Кстати, а как в программе статистика сделать Фи-пр... 17.08.2013 - 12:16
p2004r Цитата(psychologist @ 17.08.2013 - 12... 17.08.2013 - 21:32
nokh Цитата(psychologist @ 17.08.2013 - 15... 18.08.2013 - 17:29
psychologist p2004r, вы имеете ввиду так? Если нет, то можно Ва... 18.08.2013 - 08:54
p2004r Цитата(psychologist @ 18.08.2013 - 08... 19.08.2013 - 21:13
psychologist Вас понял. Сделаю преобразования. Пока тогда надею... 18.08.2013 - 21:20
DrgLena Да, в программе Statistica для проведения ANOVA дл... 19.08.2013 - 10:45
psychologist DrgLena, спасибо за помощь. Я это учту, но пока эт... 20.08.2013 - 09:05
DrgLena В ваших переоформленных данных штаммы я просто для... 20.08.2013 - 15:45
psychologist а можете,пожалуйста, скинуть этот файл в формате ... 20.08.2013 - 19:57
psychologist я спрашиваю к тому что как получилось 8 уровней. Е... 20.08.2013 - 23:22
DrgLena 0,504
0,521
0,54
0,572
0,625
0,716
1,025
1,25
По ... 21.08.2013 - 00:04
DrgLena .sta файлы не могут быть загружены на этом форуме,... 21.08.2013 - 00:41
psychologist Вот теперь точно все уяснил. Да месяц отдыха мне ... 22.08.2013 - 18:14
psychologist ещё такой вопрос, связан со статистикой. Решил про... 26.08.2013 - 22:13
DrgLena Сделать легко двухфакторный дисперсионный анализ н... 27.08.2013 - 12:55
psychologist Спасибо огромное . Я понял:) 30.08.2013 - 21:27![]() ![]() |