Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> статистика в микробиологии, как правильно тут считать
psychologist
сообщение 15.08.2013 - 16:07
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 125
Регистрация: 2.04.2012
Пользователь №: 23616



Друзья, подскажите какой метод в таком исследовании нужно пременить( и уместен ли тут дисперсионный анализ что - то я сомневаюсь, нужна помощь профи )
Суть эксперимента: есть пробирка с питательной средой и с определенной концентрацией вредного вещества(ВВ) (контроль), есть пробирка, где плюсом еще определенный штаммов (это опыт). Дальше добавили реагент, получили цветную реакцию с ВВ, померили оптическую плотность на спектрофотометре, получили значения оптической плотности контроля и опытных проб. В опытных пробах концентрация снизилась.
Микроорганизмов 8 видов, повторностей около 7
прикреплю файл, может нагляднее будет.
OD - оптическая плотность. rhamn, ferment, plant, AT-41, AT-44, 887, adol, bif - это обозначение штаммов. "Контроль" - это питательная среда с "вредным веществом" (ВВ), "Опыт" - это питательная среда с ВВ и с добавление штамма. % редукции - процент понижения ВВ среде - формула внесена в соответствие с методикой:
%= 100 - ODопыт / ODконтр x 100%

Прикрепленные файлы
Прикрепленный файл  Результаты.zip ( 10,05 килобайт ) Кол-во скачиваний: 378
 
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
DrgLena
сообщение 19.08.2013 - 10:45
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 1325
Регистрация: 27.11.2007
Пользователь №: 4573



Да, в программе Statistica для проведения ANOVA для повторных измерений эти повторные измерения должны быть организованы в отдельных переменных (колонках, как пишет р2004r). Но, прежде чем начать считать, нужно внести ясность, ответив nokh насчет этих повторностей или чистых параллелях. Примеры организации данных для различных дизайнов ANOVA
http://www.statistica.ru/home/portal/DataSet/default.htm
Возможно, вам и не нужен ANOVA для повторных измерений. Я вижу два фактора:
1. бактерии ? 8 уровней
2. концентрация ВВ ? 8 уровней.
Данные показывают, что есть зависимость % редукции и от типа бактерий и от концентрации ВВ.
Но, из за больших пробелов в планировании эксперимента не для всех бактерий можно показать наличие различий в их работе в зависимости от концентрации ВВ.
Например, для rham имеются данные о редукции в трех концентрациях, причем максимальная редукция отмечена для наименьшей концентрации:
1. 3 в отсортированном ряду) - 34,2 (95%ДИ 32,2-36,2).
2. 5 -20,0 (95%ДИ17,9-22,2)
3. 7 26,0 (95% 23,9-28,2)
Эти ДИ получены в общем дисперсионном комплексе, но вы можете провести только запланированные сравнения, например, исследовать влияние среды для одного штамма, при этом будут другие значения ошибки и ДИ

Для второго штамма plant также для меньшей концентрации редукция больше.

Из своего опыта, столь большие значения экстинции (>1,0), на которых вы работаете, не дают точных оценок концентрации веществ в спектрофотометрических методах. У вас должны быть либо коэффициенты молярной экстинции либо графики зависимости концентрации от экстинции. Как правило, нужно добиться таких разведений, при которых значения экстинции будут в диапазоне 0,2 -0,4

Некоторые Бактерии могут не работать при высоких концентрациях ВВ или при очень низких. Также вы ничего не пишете о времени инкубации, повторности, как раз, могут появиться в связи с изучением времени инкубации.

Прикрепленные файлы
Прикрепленный файл  Unweighted_Means__shtamp.sta_.pdf ( 28,23 килобайт ) Кол-во скачиваний: 326
 
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- psychologist   статистика в микробиологии   15.08.2013 - 16:07
- - p2004r   Цитата(psychologist @ 15.08.2013 - 16...   15.08.2013 - 20:53
- - psychologist   тут чисто себя проверить: Уместен ли он или нет и ...   16.08.2013 - 09:11
|- - p2004r   Цитата(psychologist @ 16.08.2013 - 09...   16.08.2013 - 15:56
- - nokh   Цитата(psychologist @ 15.08.2013 - 19...   16.08.2013 - 21:34
- - psychologist   сразу видно человека с научным мышлением. Это пока...   17.08.2013 - 11:59
- - psychologist   Кстати, а как в программе статистика сделать Фи-пр...   17.08.2013 - 12:16
|- - p2004r   Цитата(psychologist @ 17.08.2013 - 12...   17.08.2013 - 21:32
|- - nokh   Цитата(psychologist @ 17.08.2013 - 15...   18.08.2013 - 17:29
- - psychologist   p2004r, вы имеете ввиду так? Если нет, то можно Ва...   18.08.2013 - 08:54
|- - p2004r   Цитата(psychologist @ 18.08.2013 - 08...   19.08.2013 - 21:13
- - psychologist   Вас понял. Сделаю преобразования. Пока тогда надею...   18.08.2013 - 21:20
- - DrgLena   Да, в программе Statistica для проведения ANOVA дл...   19.08.2013 - 10:45
- - psychologist   DrgLena, спасибо за помощь. Я это учту, но пока эт...   20.08.2013 - 09:05
- - DrgLena   В ваших переоформленных данных штаммы я просто для...   20.08.2013 - 15:45
- - psychologist   а можете,пожалуйста, скинуть этот файл в формате ...   20.08.2013 - 19:57
- - psychologist   я спрашиваю к тому что как получилось 8 уровней. Е...   20.08.2013 - 23:22
- - DrgLena   0,504 0,521 0,54 0,572 0,625 0,716 1,025 1,25 По ...   21.08.2013 - 00:04
- - DrgLena   .sta файлы не могут быть загружены на этом форуме,...   21.08.2013 - 00:41
- - psychologist   Вот теперь точно все уяснил. Да месяц отдыха мне ...   22.08.2013 - 18:14
- - psychologist   ещё такой вопрос, связан со статистикой. Решил про...   26.08.2013 - 22:13
- - DrgLena   Сделать легко двухфакторный дисперсионный анализ н...   27.08.2013 - 12:55
- - psychologist   Спасибо огромное . Я понял:)   30.08.2013 - 21:27


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему