Корреляция частот Опции

[Camel1000]

Всем добрый день!
Что-то никак не могу сообразить, как лучше подойти к вроде простой задаче. Грубо говоря, есть некоторые сайты в геноме человека, характеризующиеся определенной частотой встречаемости. Скажем, сайт А встречается в 20% геномов, сайт Б - в 50%, сайт С - в 10% и так далее. Внутри каждого из сайтов (состоящего из последовательности нескольких нуклеотидов) могут происходить замены, причем для каждого сайта есть определенная вероятность, что в нем эти замены (любые, неважно какие) случатся - для сайта А вероятность Р1, для Б - Р2 и т.д.

Как можно оценить, есть ли корреляция между частотой встречаемости сайта в геноме и вероятностью замены в нем?

Заранее спасибо!

Сообщение отредактировал Camel1000 - 6.09.2013 - 14:52

[anserovtv]

Да, можно оба показателя перевести в числовой формат и найти коэффициент корреляции Спирмена или Пирсона/ если типов сайтов достаточно много.
Не очень хорошо понимаю , а зачем это нужно делать?
Вопрос: а как нашли частоты и вероятности?
Если экспериментальным путем , то лучше взять первоначальные данные и представить их в виде таблицы сопряженности тип сайта произошло изменение или нет и
проверить сопряженность признаков по критерию хи-квадрат или Фишера. При этом выводы, полагаю, будут гораздо содержательнее , нежели вы хотите.
Я не очень хорошо понимаю суть и тонкости вашего исследования , но такое впечатление , что ваши методы анализа слишком грубы для такой задачи.
Есть специальные методы корреляции , на форуме есть специалист.