Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> Корреляция частот
Camel1000
сообщение 6.09.2013 - 14:51
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 17
Регистрация: 3.02.2013
Пользователь №: 24599



Всем добрый день!
Что-то никак не могу сообразить, как лучше подойти к вроде простой задаче. Грубо говоря, есть некоторые сайты в геноме человека, характеризующиеся определенной частотой встречаемости. Скажем, сайт А встречается в 20% геномов, сайт Б - в 50%, сайт С - в 10% и так далее. Внутри каждого из сайтов (состоящего из последовательности нескольких нуклеотидов) могут происходить замены, причем для каждого сайта есть определенная вероятность, что в нем эти замены (любые, неважно какие) случатся - для сайта А вероятность Р1, для Б - Р2 и т.д.

Как можно оценить, есть ли корреляция между частотой встречаемости сайта в геноме и вероятностью замены в нем?

Заранее спасибо!

Сообщение отредактировал Camel1000 - 6.09.2013 - 14:52
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
Camel1000
сообщение 6.09.2013 - 16:22
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 17
Регистрация: 3.02.2013
Пользователь №: 24599



Я, наверное, плохо объяснил. Про таблицы сопряженности и Фишера понятно, это уже делали, и там есть закономерность. Теперь хочется установить вид этой закономерности, то есть по какому типу (прямо пропорционально, обратно пропорционально) как связано изменение частоты встречаемости сайтов и частота мутаций (изменений) в сайтах. То есть, грубо говоря, если сайты встречаются реже в геноме, то есть ли положительная корреляция между этим и повышеннием частоты мутаций в самих сайтах?

Сообщение отредактировал Camel1000 - 6.09.2013 - 16:23
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему