Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )
6.09.2013 - 14:51
Сообщение
#1
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 17 Регистрация: 3.02.2013 Пользователь №: 24599 |
Всем добрый день!
Что-то никак не могу сообразить, как лучше подойти к вроде простой задаче. Грубо говоря, есть некоторые сайты в геноме человека, характеризующиеся определенной частотой встречаемости. Скажем, сайт А встречается в 20% геномов, сайт Б - в 50%, сайт С - в 10% и так далее. Внутри каждого из сайтов (состоящего из последовательности нескольких нуклеотидов) могут происходить замены, причем для каждого сайта есть определенная вероятность, что в нем эти замены (любые, неважно какие) случатся - для сайта А вероятность Р1, для Б - Р2 и т.д. Как можно оценить, есть ли корреляция между частотой встречаемости сайта в геноме и вероятностью замены в нем? Заранее спасибо! Сообщение отредактировал Camel1000 - 6.09.2013 - 14:52 |
|
|
![]() |
![]() |
![]() |
6.09.2013 - 16:22
Сообщение
#2
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 17 Регистрация: 3.02.2013 Пользователь №: 24599 |
Я, наверное, плохо объяснил. Про таблицы сопряженности и Фишера понятно, это уже делали, и там есть закономерность. Теперь хочется установить вид этой закономерности, то есть по какому типу (прямо пропорционально, обратно пропорционально) как связано изменение частоты встречаемости сайтов и частота мутаций (изменений) в сайтах. То есть, грубо говоря, если сайты встречаются реже в геноме, то есть ли положительная корреляция между этим и повышеннием частоты мутаций в самих сайтах?
Сообщение отредактировал Camel1000 - 6.09.2013 - 16:23 |
|
|
![]() |
![]() |
Camel1000 Корреляция частот 6.09.2013 - 14:51
anserovtv Да, можно оба показателя перевести в числовой форм... 6.09.2013 - 16:07
anserovtv В SPSS при генерации таблиц сопряженности выводятс... 6.09.2013 - 16:36
nokh Цитата(Camel1000 @ 6.09.2013 - 17:51... 13.09.2013 - 19:28![]() ![]() |