Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> Корреляция частот
Camel1000
сообщение 6.09.2013 - 14:51
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 17
Регистрация: 3.02.2013
Пользователь №: 24599



Всем добрый день!
Что-то никак не могу сообразить, как лучше подойти к вроде простой задаче. Грубо говоря, есть некоторые сайты в геноме человека, характеризующиеся определенной частотой встречаемости. Скажем, сайт А встречается в 20% геномов, сайт Б - в 50%, сайт С - в 10% и так далее. Внутри каждого из сайтов (состоящего из последовательности нескольких нуклеотидов) могут происходить замены, причем для каждого сайта есть определенная вероятность, что в нем эти замены (любые, неважно какие) случатся - для сайта А вероятность Р1, для Б - Р2 и т.д.

Как можно оценить, есть ли корреляция между частотой встречаемости сайта в геноме и вероятностью замены в нем?

Заранее спасибо!

Сообщение отредактировал Camel1000 - 6.09.2013 - 14:52
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
anserovtv
сообщение 6.09.2013 - 16:36
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 219
Регистрация: 4.06.2013
Из: Тверь
Пользователь №: 24927



В SPSS при генерации таблиц сопряженности выводятся и кластеризованные столбиковые диаграммы, которые позволяют установить вид зависимости.
Также в меню Ячейки следует установить флажки
Сравнить пропорции столбцов.
Вычислить ожидаемые частоты.

Возможно, вам могут потребоваться и специальные случаи анализа последовательности на случайность./Критерий серий

Сообщение отредактировал anserovtv - 6.09.2013 - 20:56
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему