Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> Сравнение по критериям в разных группах, Сравнение по критериям в разных группах
neveroyatnoe
сообщение 25.03.2014 - 21:18
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 8
Регистрация: 25.03.2014
Пользователь №: 26239



Здравствуйте, коллеги.

Я не врач-аспирант, а только студент 5 курса, но у меня есть к вам вопрос. Надеюсь вы мне сможете помочь, ибо времени совсем в обрез, а задание дали и сказали, чтобы "кровь износа" была в понедельник.
Ситуация следующая. Есть база данных на 332 ребенка в которой описывается информация о их лечении и состоянии (проводилась ли кардиотоническая терапия, была ли у ребенка гипербилирубинемия, тромбоцитопения и так далее.) Эти 332 ребенка разбиваются на две группы. Первая группа (85 человек) это группа в которой развилось заболевание "Х", вторая группа (247 детей) это группа контроля, т.е. там заболевание не развилось.
Нужно оценить каждую группу по критериям и определить долю частатоты встречаемости данного критерия в каждой из групп. И затем сравнить их для того, чтобы удостовериться, что в группе контроля, встречаемость критерия меньше, чем в группе, где есть заболевание.

Объясните пожалуйста методику данного рассчета и в каких программах это можно осуществить?
Спасите бедного студента, пожалуйста)
Заранее благодарю)
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
nokh
сообщение 27.03.2014 - 05:02
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 1219
Регистрация: 13.01.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 4704



К сожалению, не нашёл ничего простого + бесплатного. Где всё максимально удобно - слишком урезанные версии пакетов. В любом случае нужно сначала подготовить данные к анализу. Удобно в Excel.
1) В перой строке вбейте названия колонок и показателей.
2) Сделайте колонку для кодов групп ("Группа")и проставьте там цифры 1 и 2 для первой и второй групп.
3) В колонках с признаками (которые вы назвали критериями) проставьте "0" если признак отсутствовал или "1" если имелся.
Смысл теперь посчитать сколько "1" было в первой и второй группах и выразить это в % от чичла человек в группе.
Можно скачать программу MedCalc, демо-версия проработает 15 дней, вам этого хватит: http://www.medcalc.org/download.php
В неё скопируете подготовленную в Excel таблицу. Далее - анализ.
1) Путь: Statistics - Categorical Data - Frequency table...
2) В Codes X - выбираете признак, в Codes Y - Группа. ОК. Получаете окно результатов, их можно копировать и накидать в текстовый файл-черновик.
3) В таблице на % не обращайте внимания, смотрите сколько "1" в первой группе, сколько во второй и вручную считайте % от числа в каждой группе (строке).
4) Выпишите Chi-square, DF и Р.
Как оформить напишу вечером.

Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
neveroyatnoe
сообщение 27.03.2014 - 15:41
Сообщение #3





Группа: Пользователи
Сообщений: 8
Регистрация: 25.03.2014
Пользователь №: 26239



Цитата(nokh @ 27.03.2014 - 06:02) *
К сожалению, не нашёл ничего простого + бесплатного. Где всё максимально удобно - слишком урезанные версии пакетов. В любом случае нужно сначала подготовить данные к анализу. Удобно в Excel.
1) В перой строке вбейте названия колонок и показателей.
2) Сделайте колонку для кодов групп ("Группа")и проставьте там цифры 1 и 2 для первой и второй групп.
3) В колонках с признаками (которые вы назвали критериями) проставьте "0" если признак отсутствовал или "1" если имелся.
Смысл теперь посчитать сколько "1" было в первой и второй группах и выразить это в % от чичла человек в группе.
Можно скачать программу MedCalc, демо-версия проработает 15 дней, вам этого хватит: http://www.medcalc.org/download.php
В неё скопируете подготовленную в Excel таблицу. Далее - анализ.
1) Путь: Statistics - Categorical Data - Frequency table...
2) В Codes X - выбираете признак, в Codes Y - Группа. ОК. Получаете окно результатов, их можно копировать и накидать в текстовый файл-черновик.
3) В таблице на % не обращайте внимания, смотрите сколько "1" в первой группе, сколько во второй и вручную считайте % от числа в каждой группе (строке).
4) Выпишите Chi-square, DF и Р.
Как оформить напишу вечером.


Очень жду сообщения)
Благодарю вас)
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
nokh
сообщение 27.03.2014 - 18:37
Сообщение #4





Группа: Пользователи
Сообщений: 1219
Регистрация: 13.01.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 4704



Цитата(neveroyatnoe @ 27.03.2014 - 18:41) *
Очень жду сообщения)

Образец оформления подшил. Это - вариант для "успеть к понедельнику". Если бы времени было больше, обсчитать можно было бы серьёзнее. В частности, неплохо было бы снабдить относительные частоты 95%-ными доверительными интервалами. Также, если мы считаем, что на принадлежность к группе заболевания влиял способ лечения или их сочетания - корректнее было бы использовать логистическую или множественную логистическую регрессию (именно в MedCalc данный метод реализован на 5+).
При оформлении обращайте внимание на округление. Проценты - до десятых, а значит до десятых всегда: не 5, а 5,0. Хи-квадрат лучше до сотых, р - до тысячных. Если р=0,048 или р=0,001 так и пишите, если меньше - как у меня, т.е. не р=0,000035, а просто р<0,001 (всегда 3 знака). Буквы, обозначающие математические величины (n, хи, р) лучше - курсивом как у меня. Индекс в скобках после хи-квадрат - число степеней свободы (degree of freedom, DF). Если у вас все признаки бинарные (0 или 1), и 2 группы, df всегда будет 1. Тогда можно каждый раз хи и р не писать, а поделить последнюю колонку на 2 и написать только в шапке, а в колонках - только цифры. Читайте про критерий хи-квадрат, отношения шансов.
Цитата(DoctorStat @ 27.03.2014 - 19:10) *
Для сравнения частот встречаемости признака в группах Вам нужно использовать точный критерий Фишера (он точнее, чем популярный критерий хи-квадрат).

Во-первых, его не нужно использовать. Я уже устал это писать. Что точно нужно, так это читать хорошие учебники, как Биометрию Сокала и Рольфа, где это написано. Во-вторых, он не точнее хи-квадрата, он - "про другое". А вот точные методы, которые вы планируете включить в пакет (ну или хотя бы Монте-Карло) - действительно что нужно! Успехов!

PS. Пока писал появилось сообщение DrgLen'ы (что радует, значит и желание есть, и интернет работает smile.gif )- тоже всё справедливо насчёт OR. Их легко посчитать по табличкам частот, в которые кросстабулирует исходные данные MedCalc и выдаёт над хи-квадратом. Например здесь: http://www.medcalc.org/calc/odds_ratio.php Можно эту статистику дать вместо хи-квадрата. Метод уступает хи-квадрату в известности, но с переходом на "доказательную медицину" стал очень популярен.

Сообщение отредактировал nokh - 27.03.2014 - 20:05
Эскизы прикрепленных изображений
Прикрепленное изображение
 
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- neveroyatnoe   Сравнение по критериям в разных группах   25.03.2014 - 21:18
- - 100$   Цитата(neveroyatnoe @ 25.03.2014 - 22...   25.03.2014 - 23:01
- - nokh   Цитата(neveroyatnoe @ 26.03.2014 - 00...   26.03.2014 - 00:23
- - nokh   К сожалению, не нашёл ничего простого + бесплатног...   27.03.2014 - 05:02
|- - neveroyatnoe   Цитата(nokh @ 27.03.2014 - 06:02) К ...   27.03.2014 - 15:41
|- - nokh   Цитата(neveroyatnoe @ 27.03.2014 - 18...   27.03.2014 - 18:37
|- - neveroyatnoe   Цитата(nokh @ 27.03.2014 - 19:37) Об...   28.03.2014 - 22:20
- - DoctorStat   Цитата(neveroyatnoe @ 25.03.2014 - 22...   27.03.2014 - 16:10
|- - 100$   Нетленный образчик качественного пиара: ЦитатаКри...   27.03.2014 - 16:50
|- - DoctorStat   Цитата(100$ @ 27.03.2014 - 17:5...   27.03.2014 - 17:05
|- - 100$   Цитата(DoctorStat @ 27.03.2014 - 18...   27.03.2014 - 17:20
- - DrgLena   Студенту 5 курса! ?кровь износа? должна быть ...   27.03.2014 - 18:01
|- - neveroyatnoe   Цитата(DrgLena @ 27.03.2014 - 19:01)...   29.03.2014 - 19:14
- - neveroyatnoe   Я для эксперимента пересчитал данные вашей таблицы...   28.03.2014 - 22:13
- - DrgLena   Вы посчитали Yates corrected Chi-square   28.03.2014 - 23:05
|- - neveroyatnoe   Цитата(DrgLena @ 29.03.2014 - 00:05)...   28.03.2014 - 23:44
|- - nokh   Цитата(neveroyatnoe @ 29.03.2014 - 02...   29.03.2014 - 01:45
|- - neveroyatnoe   Цитата(nokh @ 29.03.2014 - 02:45) По...   29.03.2014 - 08:57
|- - nokh   Цитата(neveroyatnoe @ 29.03.2014 - 11...   1.04.2014 - 17:38
- - DrgLena   Значит, нужно начать обучение не с форумов, а с уч...   29.03.2014 - 20:52
- - neveroyatnoe   Цитата(DrgLena @ 29.03.2014 - 21:52)...   29.03.2014 - 21:03


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему