Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> Вопрос по MDR, Multifactor Dimensionality Reductin
don
сообщение 7.11.2014 - 07:25
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 24
Регистрация: 11.06.2014
Пользователь №: 26460



Добрый день, коллеги.
Прошу помощи в понимании результатов анализа с помощью MDR, а также ссылок на работы, где проводился подобный анализ.
Конкретно интересует как понимать графики энтропии:

Прикрепленное изображение

Прикрепленное изображение


Также, если кто встречался, подскажите где посмотреть что то вроде руководства к программе MDR.

Благодарю вас!

Сообщение отредактировал don - 7.11.2014 - 08:04
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
don
сообщение 12.11.2014 - 11:49
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 24
Регистрация: 11.06.2014
Пользователь №: 26460



Коллеги, подскажите пожалуйста, каким образом вычислить значение р на основе известного значения Т-статистики в quantitative MDR?
В литературе [Gui и др., 2013] встречается следующая формулировка:

We use the training score to determine the best K-order interaction model and use the maximum testing score to identify the best overall model. When there is no SNP effect, QMDR attributes from the testing set are equivalent to ones randomly assigned to the high or low level group. Therefore we expect that the null distribution of the testing score follows a normal distribution with mean 0. We can then use an empirical null distribution to estimate the p-value of the chosen model.

Иными словами:
Если SNP не связан с анализируемым показателем, значения атрибутов QMDR в тестовой выборке эквивалентны таковым случайно отнесенным к группе с высоким или низким уровнем анализируемого показателя. Поэтому ожидается, что нулевое распределение "оценки тестирования" соответствует нормальному распределению со средним = 0. Поэтому можно использовать эмпирическое нулевое распределение, чтобы оценить значение р выбранной модели.

Сообщение отредактировал don - 12.11.2014 - 11:54
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- don   Вопрос по MDR   7.11.2014 - 07:25
- - don   Отвечаю сам на свой вопрос http://compgen.blogspo...   7.11.2014 - 13:12
- - don   Коллеги, подскажите пожалуйста, каким образом вычи...   12.11.2014 - 11:49
- - anserovtv   Вы не сформулировали нулевую гипотезу, ведь t-стат...   12.11.2014 - 18:37
- - don   Прошу прощения, но в MDR я ничего, позволяющего вы...   13.11.2014 - 12:45
|- - nokh   Цитата(don @ 13.11.2014 - 15:45) Про...   15.11.2014 - 18:12
|- - don   Цитата(nokh @ 15.11.2014 - 21:12) PS...   17.11.2014 - 12:06
|- - nokh   Цитата(don @ 17.11.2014 - 15:06) В к...   21.11.2014 - 13:13
|- - don   Цитата(nokh @ 21.11.2014 - 16:13) А ...   24.11.2014 - 09:45
|- - p2004r   Цитатапочему в пакете на реализована рандомизацион...   24.11.2014 - 10:22
|- - don   Цитата(p2004r @ 24.11.2014 - 13:22) ...   24.11.2014 - 11:05
|- - nokh   Цитата(p2004r @ 24.11.2014 - 13:22) ...   24.11.2014 - 13:57
|- - p2004r   Цитата(nokh @ 24.11.2014 - 13:57) И ...   25.11.2014 - 11:35
- - anserovtv   Я установил MDR версии 3.0.2. В этой версии в комм...   14.11.2014 - 09:59
|- - don   Цитата(anserovtv @ 14.11.2014 - 12:5...   15.11.2014 - 19:40
- - don   Задал вопрос Jiang Gui: In qMDR, when we get a tes...   18.11.2014 - 09:31
- - anserovtv   Цитатаdon Почему вычисляется одно единственное зна...   29.12.2014 - 22:40


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему