Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> А работает ли аппарат?, ... или изгнание бесов при помощи статистики
Insaniens
сообщение 12.12.2014 - 12:25
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 10
Регистрация: 12.12.2014
Пользователь №: 26886



Прошу помощи в статистической обработке материала.

Почему в подзаголовок попали "бесы": есть аппарат, который имеет признаки "лженауки". Итак, исходные данные. Имеется аппарат, который неизвестным науке способом (по заявлению производителей на основании "информативности температуры в определенных точках тела") определяет "131 параметр жизнедеятельности организма человека". В том числе, данное чудо научной (лженаучной?) мысли "показывает" параметры, которые определяются рутинными лабораторными методами.

Быть может, мой ироничный настрой ошибочен и мы имеем научный прорыв, либо данный агрегат годится только для наукообразного "шаманства".

Задача: подтвердить или опровергнуть работоспособность аппарата.

Исходные данные: имеются результаты полученные при помощи аппарата и рутинными лабораторными методиками. У каждого пациента выбранный параметр определялся как в лаборатории, так и на аппарате. "На глаз" видно, что показатели полученные в лаборатории и при помощи "чудо-агрегата" заметно отличаются, как в сторону завышенных, так и заниженных данных (если за эталон взять лабораторию). Для примера фрагмент с данными по гемоглобину (ниже). Первая колонка - показатель гемоглобина, определенный в лаборатории, вторая колонка - у тех же пациентов на "чудо-аппарате".

Вопрос: как статистически подтвердить (или опровергнуть) наличие существенных отклонений в показателях?



Гемоглобин_лаб Гемоглобин
116---------------------139,2
146---------------------160
149---------------------136
121---------------------132
115---------------------153,79
121---------------------135,35
131---------------------125,48
142---------------------77,74
131---------------------155,15
127---------------------143,38
155---------------------136,21
163---------------------149,47
130---------------------100,12
134---------------------133,47


Сообщение отредактировал Insaniens - 12.12.2014 - 12:32
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
p2004r
сообщение 12.12.2014 - 13:34
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 1091
Регистрация: 26.08.2010
Пользователь №: 22699



Учебные задачки надо самому решать вообщето.

А так вот например --- рандомизацией получаем перцентили необходимые для отбрасывания "нулевой гипотезы" о отсутствии связи. Критерий не достигает реальное значение --- значит связь не может быть доказана.

Отстутвие связи доказать значительно сложнее, так как она может быть очень незначительная и потребуется значительно большая группа (её размер вы думаю посчитаете сами?)

Код
> quantile(replicate(10000, cor(gembn$Гемоглобин, sample(gembn$Гемоглобин_лаб))), probs=c(0.025,0.5,0.975))
       2.5%         50%       97.5%
-0.55839229  0.01049748  0.50118705
> quantile(replicate(100000, cor(gembn$Гемоглобин, sample(gembn$Гемоглобин_лаб))), probs=c(0.025,0.5,0.975))
       2.5%         50%       97.5%
-0.56194921  0.01313884  0.49301626
> quantile(replicate(100000, cor(gembn$Гемоглобин, sample(gembn$Гемоглобин_лаб))), probs=c(0.025,0.5,0.975))
       2.5%         50%       97.5%
-0.56014658  0.01265719  0.49350855
> quantile(replicate(1000000, cor(gembn$Гемоглобин, sample(gembn$Гемоглобин_лаб))), probs=c(0.025,0.5,0.975))
       2.5%         50%       97.5%
-0.55927770  0.01301754  0.49402244


Ладно, вот так можно определеить объем выборки для "доказательсва значимости" такого небольшого по ожидаемой величине эффекта (естетственно что и сам эффект будет меняться и ещё как smile.gif

Код
> quantile(replicate(10000, cor(c(gembn$Гемоглобин, gembn$Гемоглобин), sample(c(gembn$Гемоглобин_лаб, gembn$Гемоглобин_лаб)))), probs=c(0.025,0.5,0.975))
         2.5%           50%         97.5%
-0.3871983241 -0.0001393141  0.3637828166
> quantile(replicate(10000, cor(c(gembn$Гемоглобин, gembn$Гемоглобин), sample(c(gembn$Гемоглобин_лаб, gembn$Гемоглобин_лаб)))), probs=c(0.025,0.5,0.975))
        2.5%          50%        97.5%
-0.384000417  0.006484305  0.362028738
> quantile(replicate(10000, cor(c(gembn$Гемоглобин, gembn$Гемоглобин, gembn$Гемоглобин), sample(c(gembn$Гемоглобин_лаб, gembn$Гемоглобин_лаб, gembn$Гемоглобин_лаб)))), probs=c(0.025,0.5,0.975))
        2.5%          50%        97.5%
-0.308052837  0.004971756  0.300314873


Signature
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
Insaniens
сообщение 13.12.2014 - 15:55
Сообщение #3





Группа: Пользователи
Сообщений: 10
Регистрация: 12.12.2014
Пользователь №: 26886



Цитата(p2004r @ 12.12.2014 - 13:34) *
Учебные задачки надо самому решать вообщето.

Проблема в том, что я из тех, кто по меткому выражению одного коллеги "пошел в медицину по причине того, что не дружил с математикой"
Мне кажется, что каждый должен заниматься своим делом: врач - лечить, статист - заниматься обработкой материала, научный работник - планировать (вместе со статистом) и проводить исследование.
В нашей стране сложилось, что врач/исследователь/статист - порой одно лицо. Полностью согласен, что качество многих работ в медицине в плане статистики удручает. С одной стороны - дефект образования, с другой - дефицит статистов. В скромном городе, где я живу не знаю ни одного человека, который мог бы назвать себя специалистом в области медицинской статистики... Посоветоваться не с кем. Учиться не у кого. Поехать в Мск? Контора не финансирует, своих средств не хватает. Приходится выкручиваться...

Это вступление.

По теме. Подсказку я ожидал примерно такую. Возьмите данные, программу "Статистика" и сравните при помощи такого-то критерия. Размер группы, несомненно, больше, чем я привел и может быть увеличен...
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
p2004r
сообщение 13.12.2014 - 17:33
Сообщение #4





Группа: Пользователи
Сообщений: 1091
Регистрация: 26.08.2010
Пользователь №: 22699



Преамбула:
Ну вот редкий из "медистов" спросит что то полезное у "статистов"

Амбула:
Если что, то приведенные вами циферки и были посчитатны. В вашей контрофактной стаитсике написанное исполнимо, посколку R туда уже давно встроен.
Исходная постановка вопроса неразрешима принципиально. Но величина связи между измерениями крайне близкая 0 говорит, что методы дают практически не связанные результаты.

Постскриптум:
А бедные вы оттого, что воруете всякую гадость, типа "статистики".



Signature
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
Insaniens
сообщение 13.12.2014 - 20:19
Сообщение #5





Группа: Пользователи
Сообщений: 10
Регистрация: 12.12.2014
Пользователь №: 26886



Цитата(p2004r @ 13.12.2014 - 17:33) *
Преамбула:
Ну вот редкий из "медистов" спросит что то полезное у "статистов"

Я бы не стал обобщать. Люди разные. Если бы в доступе был специалист по статистике (понял мягкий намек на неологизм/жаргонизм rolleyes.gif ) я бы с великим удовольствием советовался/сотрудничал. Не раз слышал от врачей и преподавателей мед. ВУЗов, что статистика есть зло и ненужное мудрствование. Категорически не согласен.

Цитата(p2004r @ 13.12.2014 - 17:33) *
Амбула:
Если что, то приведенные вами циферки и были посчитатны.

Это я понял. Но циферок у меня больше, а как посчитать другие параметры из приведенной схемы не понял. Ибо "медист" insane.gif

Цитата(p2004r @ 13.12.2014 - 17:33) *
Постскриптум:
А бедные вы оттого, что воруете всякую гадость, типа "статистики".

В смысле? Программа "статистика"? Дак не ворую. Институт купил. То, что пользуюсь не совсем вникая в смысл... ну, да, есть такая проблема. Каюсь, виноват. Причина указана выше: обучаться негде.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- Insaniens   А работает ли аппарат?   12.12.2014 - 12:25
- - p2004r   Учебные задачки надо самому решать вообщето. А та...   12.12.2014 - 13:34
|- - Insaniens   Цитата(p2004r @ 12.12.2014 - 13:34) ...   13.12.2014 - 15:55
|- - p2004r   Преамбула: Ну вот редкий из "медистов" с...   13.12.2014 - 17:33
|- - Insaniens   Цитата(p2004r @ 13.12.2014 - 17:33) ...   13.12.2014 - 20:19
|- - p2004r   Цитата(Insaniens @ 13.12.2014 - 20:1...   13.12.2014 - 20:50
|- - Insaniens   Цитата(p2004r @ 13.12.2014 - 20:50) ...   14.12.2014 - 14:30
- - DoctorStat   Цитата(Insaniens @ 12.12.2014 - 12:2...   13.12.2014 - 13:31
|- - Insaniens   Цитата(DoctorStat @ 13.12.2014 - 13...   13.12.2014 - 15:56
|- - DoctorStat   Цитата(DoctorStat @ 13.12.2014 - 13...   4.01.2015 - 21:30
|- - p2004r   без разделения fixed и random эффекта этот расчет ...   4.01.2015 - 22:39
- - Диагностик   Цитата(Insaniens @ 12.12.2014 - 17:2...   27.12.2014 - 07:07
|- - 100$   Цитата(Диагностик @ 27.12.2014 - 08...   27.12.2014 - 13:27
||- - p2004r   Цитата(100$ @ 27.12.2014 - 13:2...   27.12.2014 - 16:19
|- - Диагностик   Цитата(Диагностик @ 27.12.2014 - 12...   1.01.2015 - 06:39
|- - 100$   Цитата(Диагностик @ 1.01.2015 - 07:3...   1.01.2015 - 18:08
|- - nokh   Цитата(Диагностик @ 1.01.2015 - 08:3...   6.01.2015 - 00:39
|- - p2004r   Тут принципиально получается может быть несколько ...   7.01.2015 - 19:30
- - DrgLena   ?Статисты? ?сатанисты продолжают издеваться над м...   27.12.2014 - 18:08
- - 100$   А вообще очень забавно: 1. Критерий типа омега-кв...   27.12.2014 - 19:44
|- - Диагностик   Цитата(100$ @ 28.12.2014 - 00:4...   28.12.2014 - 13:55
|- - 100$   Цитата(Диагностик @ 28.12.2014 - 14...   28.12.2014 - 18:59
- - 100$   Ну никак не дает мне модератор культурно пообщатьс...   29.12.2014 - 10:12
|- - p2004r   Цитата(100$ @ 29.12.2014 - 10:1...   29.12.2014 - 12:37
|- - 100$   Цитата(p2004r @ 29.12.2014 - 13:37) ...   29.12.2014 - 13:41
||- - p2004r   Цитата(100$ @ 29.12.2014 - 13:4...   29.12.2014 - 17:27
||- - 100$   Цитата(p2004r @ 29.12.2014 - 18:27) ...   29.12.2014 - 17:40
|- - Диагностик   Цитата(p2004r @ 29.12.2014 - 17:37) ...   29.12.2014 - 15:51
- - Олег Кравец   5 суток. Всем необходимо остыть и расслабиться. И ...   2.01.2015 - 18:35
- - p2004r   Цитата(Insaniens @ 12.12.2014 - 12:2...   3.01.2015 - 13:34
- - 100$   Здесь надо для каждого пациента несколько раз изме...   3.01.2015 - 22:11
|- - Диагностик   Цитата(100$ @ 4.01.2015 - 03:11...   4.01.2015 - 10:59
- - DrgLena   Цитата(Диагностик @ 4.01.2015 - 10:5...   4.01.2015 - 12:20
|- - p2004r   Цитата(DrgLena @ 4.01.2015 - 12:20) ...   5.01.2015 - 19:14
- - Диагностик   Показано конечно и очень коряво, но почему Вы не у...   4.01.2015 - 12:39
- - DrgLena   Цитата(Диагностик @ 4.01.2015 - 12:3...   4.01.2015 - 14:00
- - Диагностик   Из их сообщений этого не следует.   4.01.2015 - 15:44
- - DrgLena   Да уж, действительно забавно, не знаком ( по ссылк...   4.01.2015 - 18:05
- - 100$   Я исхожу из той вероятностно-статистической модели...   4.01.2015 - 21:55
|- - p2004r   Цитата(100$ @ 4.01.2015 - 21:55...   4.01.2015 - 22:34
|- - 100$   ЦитатаR -- _выборочный_ показатель Золотые слова....   5.01.2015 - 01:53
|- - p2004r   Цитата(100$ @ 5.01.2015 - 01:53...   5.01.2015 - 12:19
||- - 100$   Цитата(p2004r @ 5.01.2015 - 13:19) 1...   5.01.2015 - 14:07
|- - Диагностик   Цитата(100$ @ 5.01.2015 - 06:53...   6.01.2015 - 15:25
- - p2004r   Господин Модератор! Мне самовыпилиться с этог...   5.01.2015 - 21:20
- - anserovtv   В некоторых пакетах программ (XLStat) имеется про...   6.01.2015 - 11:26
- - Insaniens   Уважаемые участники форума! Благодарю за выска...   6.01.2015 - 15:09
|- - Диагностик   Цитата(Insaniens @ 6.01.2015 - 20:09...   6.01.2015 - 15:39
- - Insaniens   Ага Именно коэффициент корреляции я и использовал...   6.01.2015 - 16:37
|- - 100$   Insaniens, не в службу, а в дружбу сообщите, пож-с...   6.01.2015 - 20:22
|- - Insaniens   Цитата(100$ @ 6.01.2015 - 20:22...   7.01.2015 - 10:53
|- - Диагностик   Цитата(Insaniens @ 7.01.2015 - 15:53...   7.01.2015 - 15:14
|- - Insaniens   Цитата(Диагностик @ 7.01.2015 - 15:1...   14.01.2015 - 10:28
|- - nokh   Цитата(Insaniens @ 14.01.2015 - 12:2...   19.01.2015 - 15:42
- - Диагностик   Я сейчас решаю подобную задачу, поэтому и зантерес...   8.01.2015 - 12:02
- - Insaniens   Цитата(nokh @ 19.01.2015 - 15:42) Во...   20.01.2015 - 16:59


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему