Вопрос по MDR, Multifactor Dimensionality Reductin Опции

[don]

Добрый день, коллеги.
Прошу помощи в понимании результатов анализа с помощью MDR, а также ссылок на работы, где проводился подобный анализ.
Конкретно интересует как понимать графики энтропии:




Также, если кто встречался, подскажите где посмотреть что то вроде руководства к программе MDR.

Благодарю вас!

Сообщение отредактировал don - 7.11.2014 - 08:04

[anserovtv]

don
Почему вычисляется одно единственное значение р для всей модели, а не для каждой клетки?
Нулевая гипотеза, если я правильно понимаю, звучит следующим образом:
Данная комбинация факторов (nat, CAT_rs...) случайным образом разделяет выборку на категории с повышенным и пониженным (относительно глобального среднего) уровнем исследуемого показателя. То есть, распределение "тестирующей Т-статистики" согласно нулевой гипотезе должно соответствовать нормальному распределению со средним = 0.

Вроде бы я понял, как примерно звучит нулевая гипотеза в этом случае (далее цитата):
На основании этого можно оценить статистическую значимость отличия реальных суперпозиций видового состава двух сообществ от случайных композиций, извлеченных из некоторого общего "резервуара" видов.
http://ecopri.ru/journal/article.php?id=481
Перестановочный тест в многомерном случае (для проверки этой гипотезы) реализован и в пакете PAST /профессор на него ссылается/. Я пробовал, работает.
Только я не совсем понимаю (как человек, далекий от биологии, хотя в студенческие годы и изучал математическую генетику), тот ли индекс оценивается.

Сообщение отредактировал anserovtv - 11.01.2015 - 17:39