 Statistica 10.0 - методы анализа взаимосвязей генотип/фенотип, (Инфаркт миокарда и атеросклероз) |
Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )
  18.02.2015 - 15:08
Сообщение
#1
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 4 Регистрация: 18.02.2015 Пользователь №: 27040  |
Здравствуйте!
Проблема моя такая. Есть группа больных (167 человек), и для них известны: - генотипы по нескольким генам (7 шт.), - данные биохимических анализов, представленные в виде числовых переменных (29 шт.), - и еще один параметр -- принимал пациент препарат статины или нет (закодировано 0/1). Мне нужно проанализировать зависимости между генотипом человека и его анализами (то есть, на какие параметры влияют гены и насколько сильно). Столкнулась с тем, что никто не может дать четкого ответа, какие методики использовать. Пыталась разобраться в регрессионном анализе, но потом оказалось, что он подходит только для исследования взаимосвязей между количественными переменными. Отчаянно нужно помощь статистиков! Как мне правильно проанализировать свою бузу данных? 
|
 |
 
|
 |
|
 |
Ответов
|
22.02.2015 - 16:17
Сообщение
#2
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 381 Регистрация: 18.08.2008 Из: Москва Златоглавая Пользователь №: 5224 |
Цитата(Alianna @ 18.02.2015 - 15:08)  Есть группа больных (167 человек), и для них известны... А где контроль = (генотипы + биохимия) ? С чем вы будете сравнивать группу больных, с самими же больными ? Это бессмысленно. Должна быть группа контроля, специально подобранная (см.литературу: метод исследования случай-контроль) к группе больных. Далее необходимо уточнить, на какой вопрос вы хотите получить ответ:1) как генотипы влияют на данную болезнь, или 2) как генотипы влияют на биохимию, или 3) как биохимия влияет на развитие болезни ? Все эти вопросы разные, поэтому и методы анализа тоже будут отличаться.  Просто включи мозги => http://doctorstat.narod.ru
|
|
|
|
|
|
|
22.02.2015 - 18:21
Сообщение
#3
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 1219 Регистрация: 13.01.2008 Из: Челябинск Пользователь №: 4704 |
Цитата(DoctorStat @ 22.02.2015 - 18:17) А где контроль = (генотипы + биохимия) ? С чем вы будете сравнивать группу больных, с самими же больными ? Это бессмысленно. Должна быть группа контроля, специально подобранная (см.литературу: метод исследования случай-контроль) к группе больных. Далее необходимо уточнить, на какой вопрос вы хотите получить ответ: 1) как генотипы влияют на данную болезнь, или 2) как генотипы влияют на биохимию, или 3) как биохимия влияет на развитие болезни ? Все эти вопросы разные, поэтому и методы анализа тоже будут отличаться. Поскольку ни инфаркт миокарда, ни атеросклероз в вопросе не прозвучал, я писал о 2). С 1) дела обстоят лучше: есть и методы-лидеры, и пакеты, и обсуждения на форуме и даже обзор на русском: https://yadi.sk/i/j9zJzryseq6Si Сообщение отредактировал nokh - 22.02.2015 - 18:23 |
|
|
|
|
|
|
22.02.2015 - 21:07
Сообщение
#4
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 381 Регистрация: 18.08.2008 Из: Москва Златоглавая Пользователь №: 5224 |
Цитата(nokh @ 22.02.2015 - 18:21) и даже обзор на русском: https://yadi.sk/i/j9zJzryseq6Si Спасибо за обзор.Просто включи мозги => http://doctorstat.narod.ru
|
|
|
|
|
|
Сообщений в этой теме
Alianna Statistica 10.0 - методы анализа взаимосвязей генотип/фенотип 18.02.2015 - 15:08
p2004r Цитата(Alianna @ 18.02.2015 - 15:08)... 18.02.2015 - 15:42 nokh Цитата(Alianna @ 18.02.2015 - 17:08)... 18.02.2015 - 19:28 Alianna Цитата(nokh @ 18.02.2015 - 22:28) У ... 19.02.2015 - 07:29 anserovtv Скорее всего, Вам нужно использовать специализиров... 19.02.2015 - 08:22 p2004r Цитата(Alianna @ 19.02.2015 - 07:39)... 19.02.2015 - 12:27 nokh Всяк сверчок знай свой шесток! А то огребёшь... 22.02.2015 - 13:44
p2004r Да, PLS хорошо подходит. Реализация http://cran.r-... 22.02.2015 - 20:57 anserovtv Обнаружил в интернете работу, очень близкую по тем... 22.02.2015 - 22:27 |