Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> Корреляция, определение значимости коэффициента
SurgeonAnastasia
сообщение 27.02.2017 - 01:42
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 14
Регистрация: 27.02.2017
Пользователь №: 29398



Здравствуйте
Проведено исследование, связанное с изучением стоматологических и психологических параметров, по 4 параметра в каждом разделе. Психологические параметры выражались в дихотомической шкале и ранговой. Стоматологические - в ранговой. Необходимо было провести корреляционный анализ.
Анализ был проведён с использованием расчета коэффициентов Спирмена, биссериального коэффициентов. Коэффициенты получены как положительные, так и отрицательные. Затем проведено определение значимости этих коэффициентов. Также получены различные значения, как и значимые значения, так и значения, соответствующие гипотезе о нулевом коэффициенте.
Все считала в Excel.
В итоге, много вопросов:
1. Правильный ли у меня алгоритм действий?
2. Если да, то что интерпретировать: сам коэффициент или его значимость?
3. Правильно ли использовать Excel или другая программа лучше для этих целей.
Заранее прошу прощения за возможную некомпетентность.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
SurgeonAnastasia
сообщение 8.03.2017 - 12:03
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 14
Регистрация: 27.02.2017
Пользователь №: 29398



Да!
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
p2004r
сообщение 8.03.2017 - 14:00
Сообщение #3





Группа: Пользователи
Сообщений: 1091
Регистрация: 26.08.2010
Пользователь №: 22699



1. Поиск оптимальной структуры сети связей объясняющей данные наилучшим непротиворечивым методом.

Методы основанные на поиске максимума критерия оптимальности сети показывают упорно в сторону отсутствия связи между обоими наборами показателей (при учете их внутренней структуры).

Код
> print(hc(data, optimized = F, debug = F))

  Bayesian network learned via Score-based methods

  model:
   [лк][ш][э.н][иг][уд][э.у|лк][м.т|уд][к.т|иг:м.т]
  nodes:                                 8
  arcs:                                  4
    undirected arcs:                     0
    directed arcs:                       4
  average markov blanket size:           1.25
  average neighbourhood size:            1.00
  average branching factor:              0.50

  learning algorithm:                    Hill-Climbing
  score:                                 BIC (cond. Gauss.)
  penalization coefficient:              1.914321
  tests used in the learning procedure:  280
  optimized:                             FALSE

> AIC(hc(data, optimized = F, debug = F), data)
[1] -132.8683

> print(tabu(data, optimized = F, debug = F))

  Bayesian network learned via Score-based methods

  model:
   [лк][ш][э.н][иг][уд][э.у|лк][м.т|уд][к.т|иг:м.т]
  nodes:                                 8
  arcs:                                  4
    undirected arcs:                     0
    directed arcs:                       4
  average markov blanket size:           1.25
  average neighbourhood size:            1.00
  average branching factor:              0.50

  learning algorithm:                    Tabu Search
  score:                                 BIC (cond. Gauss.)
  penalization coefficient:              1.914321
  tests used in the learning procedure:  1008
  optimized:                             FALSE

> AIC(tabu(data, optimized = F, debug = F), data)
[1] -132.8683


Сеть связей предлагается одинаковая.

Большинство методов основанных на анализе "непротиворечивоти" двухсторонних связей подтверждают наличие связи л.к -- э.у (как обычно не определяя сразу направленность, это нужно делать оценивая изменение суммы критерия сети в целом при помощи choose.direction() ) ну и изредка других связей найденными алгоритмами поиска по критерию оценки сети в целом.

Однако, Max-Min Parents and Children (MMPC) находит интересующую связь между двумя группами переменных.

Цитата
Tsamardinos I, Aliferis CF, Statnikov A (2003). "Time and Sample Efficient Discovery of Markov Blankets and Direct Causal Relations". In "KDD '03: Proceedings of the Ninth ACM SIGKDD International Conference on Knowledge Discovery and Data Mining", pp. 673-678. ACM.

Tsamardinos I, Brown LE, Aliferis CF (2006). "The Max-Min Hill-Climbing Bayesian Network Structure Learning Algorithm". Machine Learning, 65(1), 31-78.


Код
> print(mmpc(data, optimized = F, debug = F))

  Bayesian network learned via Constraint-based methods

  model:
    [undirected graph]
  nodes:                                 8
  arcs:                                  3
    undirected arcs:                     3
    directed arcs:                       0
  average markov blanket size:           0.75
  average neighbourhood size:            0.75
  average branching factor:              0.00

  learning algorithm:                    Max-Min Parent Children
  conditional independence test:         Mutual Information (cond. Gauss.)
  alpha threshold:                       0.05
  tests used in the learning procedure:  74
  optimized:                             FALSE

> plot(mmpc(data, optimized = F, debug = F), main = "Max-Min Parent Children")



Но такая картина, если тыкать в связи бутстреп тестами, не очень то подтверждается.

Эскизы прикрепленных изображений
Прикрепленное изображение
Прикрепленное изображение
 


Signature
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- SurgeonAnastasia   Корреляция, определение значимости коэффициента   27.02.2017 - 01:42
- - nokh   Цитата(SurgeonAnastasia @ 27.02.2017 - 0...   27.02.2017 - 23:38
- - SurgeonAnastasia   Nokh, спасибо за развёрнутый ответ! Я скачаю S...   28.02.2017 - 09:45
- - SurgeonAnastasia   Прошу прощения, последнее смотрела не по Стьюденту...   28.02.2017 - 09:49
- - nokh   Вы собираетесь скачать нелицензированную программу...   1.03.2017 - 09:09
- - SurgeonAnastasia   Спасибо большое за помощь!   1.03.2017 - 19:37
- - leo_biostat   Цитата(SurgeonAnastasia @ 27.02.2017 - 0...   2.03.2017 - 20:09
|- - nokh   Цитата(leo_biostat @ 2.03.2017 - 22...   2.03.2017 - 21:35
|- - p2004r   Цитата(nokh @ 2.03.2017 - 21:35) Вы ...   3.03.2017 - 11:42
|- - leo_biostat   Цитата(nokh @ 2.03.2017 - 21:35) Вы ...   3.03.2017 - 16:43
|- - 100$   Цитата(leo_biostat @ 3.03.2017 - 16...   3.03.2017 - 23:30
||- - leo_biostat   Цитата(100$ @ 4.03.2017 - 00:30...   4.03.2017 - 14:08
|- - nokh   Цитата(leo_biostat @ 3.03.2017 - 18...   12.03.2017 - 06:09
- - SurgeonAnastasia   Да, у меня были мысли относительно логистической р...   2.03.2017 - 22:40
- - DoctorStat   У меня такое ощущение, что парные корреляции могут...   4.03.2017 - 13:38
- - SurgeonAnastasia   Я согласна с тем, что, наверное, необходимо более ...   4.03.2017 - 17:17
|- - p2004r   Цитата(SurgeonAnastasia @ 4.03.2017 - 17...   6.03.2017 - 12:46
||- - SurgeonAnastasia   Цитата(p2004r @ 6.03.2017 - 12:46) Н...   7.03.2017 - 10:27
||- - p2004r   Цитата(SurgeonAnastasia @ 7.03.2017 - 10...   7.03.2017 - 13:06
|- - leo_biostat   Цитата(SurgeonAnastasia @ 4.03.2017 - 17...   6.03.2017 - 17:53
|- - leo_biostat   Цитата(SurgeonAnastasia @ 4.03.2017 - 17...   12.03.2017 - 19:09
|- - 100$   Цитата(leo_biostat @ 12.03.2017 - 19...   12.03.2017 - 20:28
- - passant   Ой, как запугали запутали человека Еще немног...   4.03.2017 - 18:07
- - SurgeonAnastasia   Уважаемый passant, спасибо, Вы меня успокоили и ве...   5.03.2017 - 14:19
- - SurgeonAnastasia   Попробовала посчитать регрессию-при анализе R кв в...   8.03.2017 - 01:28
|- - p2004r   Цитата(SurgeonAnastasia @ 8.03.2017 - 01...   8.03.2017 - 11:25
- - SurgeonAnastasia   Да!   8.03.2017 - 12:03
|- - p2004r   Цитата(SurgeonAnastasia @ 8.03.2017 - 12...   8.03.2017 - 12:45
|- - p2004r   1. Поиск оптимальной структуры сети связей объясня...   8.03.2017 - 14:00
|- - p2004r   Если рассматривать "нужный вариант" (кот...   8.03.2017 - 14:23
- - SurgeonAnastasia   Вспасибо за столь обширно проделанную работу. Я по...   8.03.2017 - 14:16
|- - p2004r   Цитата(SurgeonAnastasia @ 8.03.2017 - 14...   8.03.2017 - 14:30
- - DrgLena   Цитата(SurgeonAnastasia @ 8.03.2017 - 01...   8.03.2017 - 23:34
|- - SurgeonAnastasia   Цитата(DrgLena @ 8.03.2017 - 23:34) ...   9.03.2017 - 11:12
|- - p2004r   Цитата(SurgeonAnastasia @ 9.03.2017 - 11...   9.03.2017 - 12:02
|- - SurgeonAnastasia   Цитата(p2004r @ 9.03.2017 - 12:02) С...   9.03.2017 - 14:34
|- - p2004r   Цитата(SurgeonAnastasia @ 9.03.2017 - 14...   9.03.2017 - 18:39
- - DrgLena   Виды мотивации и локус контроль не влияют на состо...   9.03.2017 - 13:18
- - SurgeonAnastasia   Ну почему же не влияют? Работая каждый день с паци...   9.03.2017 - 14:31
- - Олег Кравец   [Moderator on] PLS, постарайтесь не уходить к личн...   12.03.2017 - 21:30
- - 100$   Цитата(Олег Кравец @ 12.03.2017 - 21...   12.03.2017 - 23:21


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему