Индекс сходства Жаккара., Проблемы с оценкой статистической значимости Опции

[nokh]

Провели анализ микробных ассоциаций в ожоговых ранах, выборка хорошая - более 400 проб. При оценке значимости ассоциаций с помощью индекса Жаккара в R-пакете jaccard выявилась такая штука: относительно большие индексы могли оказаться незначимыми (J=0.32; Р=0,504), а почти нулевые - значимыми (J=0.06; P=0.049). Если интересно - могу выложить данные, хотя я понял почему так происходит и сделал простой маленький пример. Стал искать другие пути, но не получается справиться самостоятельно. Буду очень признателен за помощь. Описание проблемы и вопросы в прикреплённом файле Help. Второй файл - статья, на которую есть надежда. Может ещё какие варианты подскажите...

Сообщение отредактировал nokh - 17.05.2019 - 00:49

Прикрепленные файлы

 Real_The_probabilistic_basis_of_Jaccard_s_index_1996.pdf ( 638,93 килобайт ) Кол-во скачиваний: 467
 Help.pdf ( 203,41 килобайт ) Кол-во скачиваний: 611

 

[p2004r]

Провели анализ микробных ассоциаций в ожоговых ранах, выборка хорошая - более 400 проб. При оценке значимости ассоциаций с помощью индекса Жаккара в R-пакете jaccard выявилась такая штука: относительно большие индексы могли оказаться незначимыми (J=0.32; Р=0,504), а почти нулевые - значимыми (J=0.06; P=0.049). Если интересно - могу выложить данные, хотя я понял почему так происходит и сделал простой маленький пример. Стал искать другие пути, но не получается справиться самостоятельно. Буду очень признателен за помощь. Описание проблемы и вопросы в прикреплённом файле Help. Второй файл - статья, на которую есть надежда. Может ещё какие варианты подскажите...

Единственно разумный подход это (как и написано в обзоре литературы статьи) рандомизационный тест (или он + бутстреп доверительный интервал на сами частоты, что тоже там есть). Причина -- прямой подсчет частот не дает оценки мощности исследования и размера эффекта, что делает весь этот индекс практически эквивалентным "достигнутому p".

Это все о практически полезных конструктивных результатах которые можно извлечь из этой ситуации. (Ну а статью с "индексом своего имени" конечно не запрещено написать никому ).