Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> Поиск типичного объекта
nokh
сообщение 23.06.2020 - 09:43
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 1218
Регистрация: 13.01.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 4704



Имеется несколько выборок образцов с измеренными в ImageJ показателями размеров и формы. Посчитана описательная статистика.
Теперь я хочу найти образец, наиболее типичный для каждой выборки по комплексу показателей и использовать его контур в качестве иллюстрации для всей выборки.
Подскажите, пожалуйста, каким методом проще всего найти типичный образец и что использовать: среднее, медиану, моду? Может есть готовые рекомендации для таких задач?
Спасибо!
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
nokh
сообщение 24.06.2020 - 20:30
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 1218
Регистрация: 13.01.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 4704



Благодарю всех откликнувшихся! Всё прочитал, просмотрел, попробовал... и решил отказаться от игр с расстояниями и от кластерного анализа. Пока остановился на старом добром PCA. Рассчитал факторные метки для каждого объекта по всем PC и нашёл сумму их абсолютных значений по всем осям. Навеяно 100$ и желанием сохранить в анализе коррелирующие показатели. Объект с минимальной суммой расположен ближе всего к центроиду гипероблака. Если у форумчан есть время и желание прикрепляю свои объекты. Теперь у меня есть кандидат на победу!

PS Конечно, никакие PCA не опишут форму так, как геометрическая морфометрия, но для моей задачи это немыслимая трудоёмкость. А так я за 5 мин могу получить массив годных цифр, включая время на фото, его портирование в комп и обработку в ImageJ. В дополнение к книге р2004r хорошее русскоязычное руководство: https://ipae.uran.ru/sites/default/files/pu...silyevEtAl2.pdf

Сообщение отредактировал nokh - 24.06.2020 - 20:33
Эскизы прикрепленных изображений
Прикрепленное изображение
 

Прикрепленные файлы
Прикрепленный файл  Mean_object.xls ( 20,5 килобайт ) Кол-во скачиваний: 479
 
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
p2004r
сообщение 26.06.2020 - 20:32
Сообщение #3





Группа: Пользователи
Сообщений: 1091
Регистрация: 26.08.2010
Пользователь №: 22699



Цитата(nokh @ 24.06.2020 - 20:30) *
Благодарю всех откликнувшихся! Если у форумчан есть время и желание прикрепляю свои объекты.


А где вот эти "овалы", что на картинке "по отдельности"?


Signature
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
nokh
сообщение 30.06.2020 - 22:13
Сообщение #4





Группа: Пользователи
Сообщений: 1218
Регистрация: 13.01.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 4704



Цитата(p2004r @ 26.06.2020 - 22:32) *
А где вот эти "овалы", что на картинке "по отдельности"?

По отдельности нет, только кучкой (если я правильно вас понял). В этом большое преимущество: всё кучкой и обрабатывается автоматически (модуль в ImageJ - Analyze - Analyze Particles)
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- nokh   Поиск типичного объекта   23.06.2020 - 09:43
- - 100$   Цитата(nokh @ 23.06.2020 - 09:43) Им...   23.06.2020 - 11:18
- - nokh   Спасибо большое, действенно и быстро! Единств...   23.06.2020 - 12:46
|- - 100$   ЦитатаМожет тогда лучше расстояния Махаланобиса? ...   23.06.2020 - 13:48
- - passant   По-моему, то, что вы описали есть типичнейшая зада...   23.06.2020 - 14:25
- - p2004r   Цитата(nokh @ 23.06.2020 - 09:43) Им...   23.06.2020 - 18:18
- - 100$   К слову, в этой книженции параграф 4.4. как раз по...   23.06.2020 - 19:31
- - passant   Что-бы немного развлеч достопочтенную публику и не...   23.06.2020 - 22:59
- - nokh   Благодарю всех откликнувшихся! Всё прочитал, п...   24.06.2020 - 20:30
- - 100$   Цитата(nokh @ 24.06.2020 - 20:30) Бл...   24.06.2020 - 22:32
|- - nokh   Цитата(100$ @ 25.06.2020 - 00:3...   25.06.2020 - 21:30
|- - 100$   Вас понял. А что это за объекты? Вареники, пельме...   25.06.2020 - 22:02
|- - nokh   Цитата(100$ @ 26.06.2020 - 00:0...   25.06.2020 - 22:17
|- - 100$   Цитата(nokh @ 25.06.2020 - 22:17) ...   25.06.2020 - 22:25
- - p2004r   Цитата(nokh @ 24.06.2020 - 20:30) Бл...   26.06.2020 - 20:32
- - nokh   Цитата(p2004r @ 26.06.2020 - 22:32) ...   30.06.2020 - 22:13


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему