![]() |
Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )
![]() |
![]()
Сообщение
#1
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 27 Регистрация: 7.12.2012 Пользователь №: 24440 ![]() |
Салют! Столкнулся с проблемой сравнения двух выборок, в каждой из которых по 3 значения. Это результаты иммуноблоттинга (определение концентрации целевого белка в пробе) очень ценных образцов, полученных от трансгенных животных. Но их - образцов, было всего 3 для каждой из групп (2 группы: интактная и подвергнутая воздействию исследуемого фактора). Покопавшись в литературе, нашёл статьи, где есть такие выборки и авторы как ни в чём не бывало используют t-критерий Стьюдента для сравнения средних. Нашёл статьи, где используют U-критерий Манна-Уитни... Скажем так, в биологии 3 образца - это нормально для публикации, если речь идёт об особо ценном и сложнополучаемом биоматериале (к примеру как у меня, когда животные практически не дают потомства). Т.е. представить эти данные можно и не стыдно. Но вот как сравнить, как показать, что эти выборки отличаются статистически значимо, иными словами, что наш исследуемый фактор значимо повлиял на концентрацию целевого белка?
Почитал ещё о таком методе, как ресамплинг или бутстреп, когда объём выборки искусственно увеличивают. Ну, не знаю насколько это правильно... также не нашёл софт и чёткого понимания как это сделать у меня нет. Работаю в проге Statistica 12 Посоветуйте, как всё же обработать эти данные. Вот пример исходных цифр: Выборка 1: 221,60112 305,217725 295,251684 Выборка 2: 371,3313 397,452722 437,212724 |
|
![]() |
![]() |
![]() |
![]()
Сообщение
#2
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 262 Регистрация: 1.06.2022 Из: Донецк Пользователь №: 39632 ![]() |
Почитал мануал ПАСТа, относительно "permutation t tes" там сказано:
Цитата The permutation test for equality of means uses the absolute difference in means as test statistic. This is equivalent to using the t statistic. The permutation test is non-parametric with few assumptions, but the two samples are assumed to be equal in distribution if the null hypothesis is true. The number of permutations can be set by the user. The power of the test is limited by the sample size ? significance at the p<0.05 level can only be achieved for n>3 in each sample. То есть никакого t там в реальности нет, а тупо модуль разности средних. Попробовал повторить это на R: Код x<-c(221.60112, 305.217725, 295.251684, 371.3313, 397.452722, 437.212724) R<-9999 absdiff<-abs(mean(x[1:3])-mean(x[4:6])) res<-numeric(R) for (i in 1:R) { perm<-sample(x) permdiff<-abs(mean(perm[1:3])-mean(perm[4:6])) if(permdiff>=absdiff) res [i]<-1 } p<-(sum(res)+1)/(R+1) p Получилось уже знакомое p=0,1 с копейками. Откуда они берут p=0,03, тайна сия велика есть. Сообщение отредактировал ИНО - 11.06.2022 - 15:13 |
|
![]() |
![]() |
![]() ![]() |