Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> Регрессионный анализ Кокса. Как работать с количественными переменными?
EkaterinaN
сообщение 22.04.2020 - 01:58
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 4
Регистрация: 22.04.2020
Пользователь №: 38661



Доброй ночи. Подскажите, пожалуйста, для включения в однофакторный регрессионный анализ Кокса количественной переменной с целью изучения влияния на исход (выборка=229 больных, из них 15 больных с исходом), как лучше поступить:
1. Преобразовать в дихотомическую, используя медиану;
2. Преобразовать в дихотомическую, используя общепринятый cut-off;
3. Преобразовать в дихотомическую, используя cut-off, полученный с помощью ROC-анализа (практически не используется в исследованиях по моей специальности)
3. Провести однофакторный и многофакторный (в случае достоверного влияния) анализы используя количественный ряд и далее определить cut-off:
- с помощью ROC-кривой (также, мало где видела);
- использовать медиану для преобразования в дихотомическую и повторить многофакторный анализ (встречается в других работах)?

Сообщение отредактировал EkaterinaN - 22.04.2020 - 02:00
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
Игорь
сообщение 31.10.2022 - 18:03
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 1141
Регистрация: 10.04.2007
Пользователь №: 4040



Недостаточная и противоречивая информация - отсюда и повод для шуток. Опишите Ваши данные (естественно, без раскрытия конфиденциальных сведений) и сообщите, какой результат Вы хотите получить. Только после этого можно предложить метод решения и, возможно, программное обеспечение.

Сообщение отредактировал Игорь - 31.10.2022 - 18:04


Signature
Ebsignasnan prei wissant Deiws ainat! As gijwans! Sta ast stas arwis!
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
"Наташа"
сообщение 31.10.2022 - 20:59
Сообщение #3





Группа: Пользователи
Сообщений: 16
Регистрация: 25.07.2022
Пользователь №: 39636



Цитата(Игорь @ 31.10.2022 - 18:03) *
Недостаточная и противоречивая информация - отсюда и повод для шуток. Опишите Ваши данные (естественно, без раскрытия конфиденциальных сведений) и сообщите, какой результат Вы хотите получить. Только после этого можно предложить метод решения и, возможно, программное обеспечение.

У меня есть количественная переменная (параметр метаболической активности), есть исход (рецидив), который с этим параметром должен бы быть связан. Мой руководитель, вдохновленный абсолютно всеми статьями на эту тему, хочет получить модель с удобоваримым AUCом и желательно еще с оптимальной пороговой величиной, призванной прогнозировать вероятность рецидива со всеми Ч И С))
Но дело обстоит так, что пациентов группы случая достаточно мало, и значимой разницы в группах у этого параметра пока нет.
Но для этого же параметра в уравнении Кокса коэффициент оказался знаичимый. Исход тот же- рецидив. Вот мой вопрос наверное даже так корректней (ну или вообще еще хуже)) Уж извините!))
Вот при отсутствии значимого различия по этому параметру между группами (рецидив/без рецидива) возможно ли то что в уравнении регрессии (мы оцениваем вероятность рецидива) этот фактор будет значимый?
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
Игорь
сообщение 2.11.2022 - 07:32
Сообщение #4





Группа: Пользователи
Сообщений: 1141
Регистрация: 10.04.2007
Пользователь №: 4040



Цитата("Наташа @ 31.10.2022 - 21:59) *
У меня есть количественная переменная (параметр метаболической активности), есть исход (рецидив), который с этим параметром должен бы быть связан. Мой руководитель, вдохновленный абсолютно всеми статьями на эту тему, хочет получить модель с удобоваримым AUCом и желательно еще с оптимальной пороговой величиной, призванной прогнозировать вероятность рецидива со всеми Ч И С))
Но дело обстоит так, что пациентов группы случая достаточно мало, и значимой разницы в группах у этого параметра пока нет.
Но для этого же параметра в уравнении Кокса коэффициент оказался знаичимый. Исход тот же- рецидив. Вот мой вопрос наверное даже так корректней (ну или вообще еще хуже)) Уж извините!))
Вот при отсутствии значимого различия по этому параметру между группами (рецидив/без рецидива) возможно ли то что в уравнении регрессии (мы оцениваем вероятность рецидива) этот фактор будет значимый?

Действуем следующим образом.
1. Исходные данные - длительности, индикаторы цензурирования и матрица ковариат.
2. Строим модель пропорциональных рисков Кокса. На данном этапе контролируется значимость предикторов.
3. Если нужен прогноз, строим регрессию Кокса (в источниках может называться подбором распределения длительностей). Отметим, что под "регрессией Кокса" может пониматься любая из регрессий, применяемых в анализе данных типа времени жизни и удовлетворительно описывающая эти данные. Используем полученные на данном и предыдущем шагах результаты для прогноза по конкретному пациенту.

Теперь о ROC анализе. Это - алгоритм оценки качества модели, предполагающей бинарные исходы. Как и нужно ли его применять в рассматриваемой задаче, у меня нет идей (разве что использовать индикаторы цензурирования в качестве исходов, но куда тогда "пристроить" длительности - а это основной момент в анализе данных типа времени жизни). Пользуйтесь оценками значимости, полученными при решении модели Кокса.

Сообщение отредактировал Игорь - 2.11.2022 - 07:44


Signature
Ebsignasnan prei wissant Deiws ainat! As gijwans! Sta ast stas arwis!
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- EkaterinaN   Регрессионный анализ Кокса. Как работать с количественными переменными?   22.04.2020 - 01:58
- - 100$   Модель пропорциональных рисков Кокса (Cox proporti...   22.04.2020 - 19:08
- - "Наташа"   Добрый день. пожалуйста. У меня при анализе выжив...   29.10.2022 - 09:47
- - ИНО   Если рок-анализ не дает желаемого результата, попр...   30.10.2022 - 22:23
|- - "Наташа"   Цитата(ИНО @ 30.10.2022 - 22:23) Есл...   31.10.2022 - 11:45
- - Игорь   Недостаточная и противоречивая информация - отсюда...   31.10.2022 - 18:03
|- - "Наташа"   Цитата(Игорь @ 31.10.2022 - 18:03) Н...   31.10.2022 - 20:59
|- - Игорь   Цитата("Наташа @ 31.10.2022 - 21...   2.11.2022 - 07:32
- - ИНО   Почему у приема внутрь молока и водки разные p пос...   2.11.2022 - 02:43
|- - "Наташа"   Цитата(ИНО @ 2.11.2022 - 02:43) Поче...   2.11.2022 - 07:19
- - ИНО   Игорь, не плодите лишние сущности: модель пропорци...   2.11.2022 - 18:54
|- - Игорь   Как говорится, есть один нюанс... Регрессия Кокса ...   3.11.2022 - 09:54
- - ИНО   ЦитатаРегрессия Кокса - это h = h0 * на что-то там...   3.11.2022 - 21:08
|- - Игорь   Цитата(ИНО @ 3.11.2022 - 21:08) Это ...   4.11.2022 - 11:55
- - ИНО   Я не знаком с Вашей "последней монографией...   5.11.2022 - 00:53
|- - Игорь   Может, действительно некогда... Klein, с 245 (форм...   5.11.2022 - 08:41
- - ИНО   И как прикажете по приведенным Вами, с позволения ...   6.11.2022 - 00:13


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему