Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )
24.05.2025 - 11:09
Сообщение
#1
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 6 Регистрация: 20.05.2025 Пользователь №: 39693 |
Здравствуйте!
Как рассчитывается поправка Холма-Бонферрони (сама формула мне известна и как бы понятна) при расчёте парных корреляций по Спирмену в одной группе. Матрица исходных данных достаточно разреженная. И, как следствие, при нескольких группах ( > 2 ) как посчитать поправку. Все прочитанные сообщения в разных темах допускают неоднозначные толкования. А что говорит Байес? С уважением. |
|
|
![]() |
![]() |
![]() |
3.06.2025 - 00:56
Сообщение
#2
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 6 Регистрация: 20.05.2025 Пользователь №: 39693 |
Мне кажется, что не стоит уходить в обсуждение терминологии (см. https://ru.wikipedia.org/wiki/Разреженная_матрица). И в попытке перейти к конкретному примеру "Пару раз ткнуть мышкой и посмотреть, что получится - разве не интересно? Я бы сделал.", как предлагает "Игорь". Вопрос, на мой взгляд, глубже. Правильно заметил ИНО. "Это да, хрен найдёшь в литературе примеров коррекции значимости для корреляций в исследованиях, где проверяется парная корреляция всего со всем, а потом выбирается лишь то, что понравилось исследователю, зато самих таких исследований пруд пруди. Продуктивная статистика, мать ее!".
Проблема формулируется просто: Посчитать парные непараметрические корреляции, при достаточно большом количестве входных параметров, которые содержат пропуски. Но природа их такова (в моём случае): ПЦР реакции, где часть значений заведомо опускается из-за не значимости клинической(?). При изучении микробиома человека (в частности женщины) методами параллельного секвенирования (секвенирование нового поколения, NGS) гена16S rRNA и биоинформационный анализ полученных данных с классификацией ДНК по таксономическим единицам, где часть данных просто не обнаруживается существующими методами NGS. (сотни параметров с пропущенными данными). Таким образом природа "дырок" в данных носит не случайный характер, но в некотором смысле квазислучайный, а также преднамеренный (не хотелось бы уходить в обсуждение типов пропусков). При подсчёте корреляций надо учесть множественность сравнений. ВСЁ ОЧЕНЬ ПРОСТО! |
|
|
![]() |
![]() |
Skif Байес и проблема множественных сравнений 24.05.2025 - 11:09
nokh Цитата(Skif @ 24.05.2025 - 13:09) Зд... 24.05.2025 - 14:01
Skif Да, но
Ограничения 24.05.2025 - 18:12
Skif Поправка Беньямини - Хохберга хороша, но требует н... 24.05.2025 - 18:26
Игорь А нельзя использовать специальные тесты для множес... 30.05.2025 - 09:28
Skif А можно указать что за специальные тесты для множе... 30.05.2025 - 13:48
Игорь Цитата(Skif @ 30.05.2025 - 13:48) А ... 30.05.2025 - 17:18
ИНО И как это богатство критериев поможет решение конк... 30.05.2025 - 22:55
Игорь Цитата(ИНО @ 30.05.2025 - 23:55) И к... 31.05.2025 - 08:29
ИНО Это да, хрен найдёшь в литер утре примеров коррекц... 31.05.2025 - 12:44
Игорь От неудачных наименований возникает непонимание - ... 31.05.2025 - 14:54
ИНО Терминологию мы не будем оспаривать (С). Но медици... 31.05.2025 - 15:20
Игорь Цитата(ИНО @ 31.05.2025 - 15:20) коэ... 31.05.2025 - 15:57
ИНО Куда предлагаете тыкать мышкой? Не вижу ни единой ... 31.05.2025 - 21:45
ИНО Цитата(Skif @ 3.06.2025 - 00:56) Так... 3.06.2025 - 12:33
Skif "Уже предложение к топикстартеру - привести ч... 3.06.2025 - 01:08
nokh Пара-тройка идей, не связанных напрямую с коррекци... 20.06.2025 - 21:09
Игорь Название темы немного вводит в заблуждение, т.к. о... 14.07.2025 - 08:25![]() ![]() |