Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> Байес и проблема множественных сравнений
Skif
сообщение 24.05.2025 - 11:09
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 6
Регистрация: 20.05.2025
Пользователь №: 39693



Здравствуйте!
Как рассчитывается поправка Холма-Бонферрони (сама формула мне известна и как бы понятна) при расчёте парных корреляций по Спирмену в одной группе. Матрица исходных данных достаточно разреженная. И, как следствие, при нескольких группах ( > 2 ) как посчитать поправку. Все прочитанные сообщения в разных темах допускают неоднозначные толкования. А что говорит Байес?
С уважением.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
Skif
сообщение 3.06.2025 - 00:56
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 6
Регистрация: 20.05.2025
Пользователь №: 39693



Мне кажется, что не стоит уходить в обсуждение терминологии (см. https://ru.wikipedia.org/wiki/Разреженная_матрица). И в попытке перейти к конкретному примеру "Пару раз ткнуть мышкой и посмотреть, что получится - разве не интересно? Я бы сделал.", как предлагает "Игорь". Вопрос, на мой взгляд, глубже. Правильно заметил ИНО. "Это да, хрен найдёшь в литературе примеров коррекции значимости для корреляций в исследованиях, где проверяется парная корреляция всего со всем, а потом выбирается лишь то, что понравилось исследователю, зато самих таких исследований пруд пруди. Продуктивная статистика, мать ее!".
Проблема формулируется просто:
Посчитать парные непараметрические корреляции, при достаточно большом количестве входных параметров, которые содержат пропуски.
Но природа их такова (в моём случае): ПЦР реакции, где часть значений заведомо опускается из-за не значимости клинической(?).
При изучении микробиома человека (в частности женщины) методами параллельного секвенирования (секвенирование нового поколения, NGS) гена16S rRNA и
биоинформационный анализ полученных данных с классификацией ДНК по таксономическим единицам, где часть данных просто не обнаруживается существующими методами
NGS. (сотни параметров с пропущенными данными).
Таким образом природа "дырок" в данных носит не случайный характер, но в некотором смысле квазислучайный, а также преднамеренный (не хотелось бы уходить в обсуждение типов пропусков).
При подсчёте корреляций надо учесть множественность сравнений.
ВСЁ ОЧЕНЬ ПРОСТО!
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- Skif   Байес и проблема множественных сравнений   24.05.2025 - 11:09
- - nokh   Цитата(Skif @ 24.05.2025 - 13:09) Зд...   24.05.2025 - 14:01
- - Skif   Да, но Ограничения   24.05.2025 - 18:12
- - Skif   Поправка Беньямини - Хохберга хороша, но требует н...   24.05.2025 - 18:26
- - Игорь   А нельзя использовать специальные тесты для множес...   30.05.2025 - 09:28
- - Skif   А можно указать что за специальные тесты для множе...   30.05.2025 - 13:48
|- - Игорь   Цитата(Skif @ 30.05.2025 - 13:48) А ...   30.05.2025 - 17:18
- - ИНО   И как это богатство критериев поможет решение конк...   30.05.2025 - 22:55
|- - Игорь   Цитата(ИНО @ 30.05.2025 - 23:55) И к...   31.05.2025 - 08:29
- - ИНО   Это да, хрен найдёшь в литер утре примеров коррекц...   31.05.2025 - 12:44
- - Игорь   От неудачных наименований возникает непонимание - ...   31.05.2025 - 14:54
- - ИНО   Терминологию мы не будем оспаривать (С). Но медици...   31.05.2025 - 15:20
|- - Игорь   Цитата(ИНО @ 31.05.2025 - 15:20) коэ...   31.05.2025 - 15:57
- - ИНО   Куда предлагаете тыкать мышкой? Не вижу ни единой ...   31.05.2025 - 21:45
- - Skif   Мне кажется, что не стоит уходить в обсуждение тер...   3.06.2025 - 00:56
|- - ИНО   Цитата(Skif @ 3.06.2025 - 00:56) Так...   3.06.2025 - 12:33
- - Skif   "Уже предложение к топикстартеру - привести ч...   3.06.2025 - 01:08


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему