Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> Критерий для анализа сверхмалых выборок, выборки из 3 значений. Применение стат. анализа
Vitek_22
сообщение 25.05.2022 - 12:45
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 30
Регистрация: 7.12.2012
Пользователь №: 24440



Салют! Столкнулся с проблемой сравнения двух выборок, в каждой из которых по 3 значения. Это результаты иммуноблоттинга (определение концентрации целевого белка в пробе) очень ценных образцов, полученных от трансгенных животных. Но их - образцов, было всего 3 для каждой из групп (2 группы: интактная и подвергнутая воздействию исследуемого фактора). Покопавшись в литературе, нашёл статьи, где есть такие выборки и авторы как ни в чём не бывало используют t-критерий Стьюдента для сравнения средних. Нашёл статьи, где используют U-критерий Манна-Уитни... Скажем так, в биологии 3 образца - это нормально для публикации, если речь идёт об особо ценном и сложнополучаемом биоматериале (к примеру как у меня, когда животные практически не дают потомства). Т.е. представить эти данные можно и не стыдно. Но вот как сравнить, как показать, что эти выборки отличаются статистически значимо, иными словами, что наш исследуемый фактор значимо повлиял на концентрацию целевого белка?
Почитал ещё о таком методе, как ресамплинг или бутстреп, когда объём выборки искусственно увеличивают. Ну, не знаю насколько это правильно... также не нашёл софт и чёткого понимания как это сделать у меня нет.
Работаю в проге Statistica 12

Посоветуйте, как всё же обработать эти данные. Вот пример исходных цифр:
Выборка 1:
221,60112
305,217725
295,251684

Выборка 2:
371,3313
397,452722
437,212724
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
Vitek_22
сообщение 8.08.2025 - 20:53
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 30
Регистрация: 7.12.2012
Пользователь №: 24440



тов. Игорь, можете привести эти две выборки по 3 значения? Я скачал в djva эту книгу, но на 116 стр есть только выборки: [4,9,12] и [5,11,17], сравнение которых даёт p=0,6


Тов. ИНО,
Можете привести выборки объёмом 3, которые дадут p=0,05 или p<0,1 ?

Вот, я попросил коллегу проверить в R с модулем на питоне (в сети этот модуль есть - называется coin), и собственно в питоне есть Фишер-Питман в стандартной библиотеке (fisher_pitman_test в библиотеке SciPy,) - я лично с её использованием посчитал... собственно, не я, а компьютер, руками там вообще ничего не правил - всё уже реализовано в библиотеке - только подсунь выборки. Наконец, я попросил посчитать ИИ фишера-питмана в "ручном режиме", перебрав все комбинации и приведя их, чтоб я видел правильно ли он перебирает... Не выходит там 0,03. 0,1 мне дали все 3 попытки!
Вывод - не надо верить всему, что написано в книгах. Сегодня любой может написать код и компьютер всё за него посчитает. Не доверять - нет причин.

P.S. Эра спецсофта для статистики канула в Лету, я перешёл на питон и теперь всё считаю там. Что есть в программе Statistica от Statsoft - проверил, всё совпадает, считает чётко. Чего нет - проверил на выборках из статей (тот же Фишер-Питман, Бруннер-Мюнцель (включая перестановочный варианта), Йена, Уэлча, Бутстрэп с коррекцией смещения и ускорением и т.д.) - всё совпало с литературой, конечно, перестановочные тесты немного отличаются - на пару %, но это для них нормально.

Сообщение отредактировал Vitek_22 - 8.08.2025 - 21:04
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- Vitek_22   Критерий для анализа сверхмалых выборок   25.05.2022 - 12:45
- - Игорь   В принципе любая непараметрика. Можно посмотреть к...   26.05.2022 - 08:42
|- - salm   Цитата(Игорь @ 26.05.2022 - 08:42) В...   24.02.2023 - 13:32
|- - ИНО   В указанных критериях объемы выборок, учитывается ...   24.02.2023 - 14:47
||- - salm   Цитата(ИНО @ 24.02.2023 - 14:47) В у...   24.02.2023 - 20:55
||- - 100$   > Спасибо. А в принципе, такое выражение ...   24.02.2023 - 23:32
|- - Игорь   Цитата(salm @ 24.02.2023 - 14:32) Зд...   24.02.2023 - 17:37
|- - salm   Цитата(Игорь @ 24.02.2023 - 17:37) Е...   24.02.2023 - 20:47
|- - ИНО   Цитата(salm @ 24.02.2023 - 20:47) А ...   25.02.2023 - 05:37
|- - Игорь   Удалено автором поста.   1.03.2023 - 10:25
- - Vitek_22   Игорь, спасибо. А как обосновать использование это...   26.05.2022 - 10:41
|- - 100$   Цитата(Vitek_22 @ 26.05.2022 - 10:41...   26.05.2022 - 17:46
|- - Игорь   Цитата(Vitek_22 @ 26.05.2022 - 10:41...   31.05.2022 - 07:07
- - ИНО   Вот-только при помощи перестановок Вы никогда не д...   5.06.2022 - 23:55
- - Игорь   Цитата(Vitek_22 @ 25.05.2022 - 13:45...   9.06.2022 - 13:53
|- - 100$   Цитата(Игорь @ 9.06.2022 - 13:53) Кр...   9.06.2022 - 16:17
|- - ИНО   Цитата(100$ @ 9.06.2022 - 16:17...   9.06.2022 - 23:21
|- - 100$   Цитата(ИНО @ 9.06.2022 - 23:21) Поче...   10.06.2022 - 10:08
- - ИНО   Сдается мне, Ваше творение нагло врет, по крайней ...   9.06.2022 - 16:05
- - Игорь   Спасибо коллегам за подробный разбор. Проверил. Сн...   9.06.2022 - 20:08
- - ИНО   ЦитатаГрубо говоря - одно и то же. Исправлять нече...   9.06.2022 - 22:28
|- - Игорь   Цитата(ИНО @ 9.06.2022 - 22:28) Одна...   10.06.2022 - 13:15
- - ИНО   Очевидно, сии подделки экселя прозрачно намекают, ...   10.06.2022 - 14:00
- - ИНО   Почитал мануал ПАСТа, относительно "permutati...   11.06.2022 - 15:09
|- - 100$   Цитата(ИНО @ 11.06.2022 - 15:09) Пол...   12.06.2022 - 12:43
- - ИНО   ЦитатаА это разовое значение (в смысле, полученное...   13.06.2022 - 19:29
- - nokh   Цитата(Vitek_22 @ 25.05.2022 - 14:45...   17.06.2022 - 07:34
|- - ИНО   Цитата(nokh @ 17.06.2022 - 07:34) Мо...   17.06.2022 - 13:17
|- - 100$   Цитата(ИНО @ 17.06.2022 - 13:17) ......   17.06.2022 - 13:26
- - 100$   ЦитатаНе знаю почему уважаемые участники форума не...   17.06.2022 - 12:13
- - ИНО   Хороший вопрос! Документация пакета boot (свер...   17.06.2022 - 17:12
|- - 100$   Цитата(ИНО @ 17.06.2022 - 17:12) Выв...   18.06.2022 - 01:12
- - ИНО   Ну что поделать, я не умею толком ни программирова...   18.06.2022 - 01:54
- - comisora   Добрый день. Предлагаю рассмотреть на жизнеспособн...   18.06.2022 - 17:49
- - ИНО   ИМХО бета тут как бы совсем за уши притянута, огра...   18.06.2022 - 18:17
- - comisora   2ИНО Ошибки исправил, результат тоже, спасибо. По...   18.06.2022 - 19:12
- - 100$   >comisora, а вы можете откомментировать констр...   18.06.2022 - 21:26
- - comisora   2 100$ Конечно. Это я усложнил код, так как ...   18.06.2022 - 23:53
|- - 100$   Цитата(comisora @ 18.06.2022 - 23:53...   19.06.2022 - 00:16
- - 100$   Подведем некоторые промежуточные итоги. В соответ...   19.06.2022 - 22:20
- - comisora   2 100$ У меня опыта создания пакетов нет (да...   20.06.2022 - 00:42
- - ИНО   Цитата(100$ @ 19.06.2022 - 22:2...   20.06.2022 - 04:56
|- - 100$   "Я проснулся сегодня рано..." (Исполняет...   20.06.2022 - 13:01
- - ИНО   Нет, на той гистограмме - распределение при нулево...   20.06.2022 - 17:10
|- - 100$   ЦитатаНет, на той гистограмме - распределение при ...   20.06.2022 - 23:24
- - ИНО   Да все в порядке изначально было с гистограммой ст...   21.06.2022 - 03:31
|- - 100$   ЦитатаС этим не спорю. Заметьте, здесь порядок циф...   21.06.2022 - 12:21
- - ИНО   Ну, результаты моделирования как бы намекают, что ...   21.06.2022 - 21:00
|- - 100$   Цитата(ИНО @ 21.06.2022 - 21:00) А в...   23.06.2022 - 00:19
- - comisora   Цитата(100$ @ 21.06.2022 - 12:2...   22.06.2022 - 10:42
- - ИНО   Этот ответ справедлив только для критериев рандоми...   23.06.2022 - 04:56
- - 100$   Но, если уж на то пошло, для желаемого соотношения...   23.06.2022 - 11:10
- - salm   Добрый день. пожалуйста, у меня есть парные измер...   12.01.2023 - 11:51
|- - 100$   Цитата(salm @ 12.01.2023 - 11:51) До...   12.01.2023 - 13:39
|- - salm   Цитата(100$ @ 12.01.2023 - 13:3...   12.01.2023 - 16:09
- - ИНО   Проблема множественных сравнений отнюдь не исчерпы...   1.03.2023 - 12:35
|- - Игорь   Удалено автором поста.   1.03.2023 - 20:24
- - ИНО   Пример 1. Почему у Смирнова мощность значительно м...   2.03.2023 - 07:16
|- - Игорь   Удалено автором поста.   2.03.2023 - 07:39
- - ИНО   Так-то оно так, вот только для перестраховки приня...   2.03.2023 - 10:06
- - ИНО   Причем тут смежные области? Вопрос лежит сугубо в ...   2.03.2023 - 11:51
- - Vitek_22   Господа, я что-то совсем позабыл выложить пример. ...   8.08.2025 - 00:33
|- - Игорь   Цитата(Vitek_22 @ 8.08.2025 - 01:33)...   8.08.2025 - 07:38
- - ИНО   Если я правильно понял задачу, то получить p<0...   8.08.2025 - 18:26
- - Vitek_22   тов. Игорь, можете привести эти две выборки по 3 з...   8.08.2025 - 20:53
|- - Игорь   Цитата(Vitek_22 @ 8.08.2025 - 21:53)...   9.08.2025 - 10:01
- - ИНО   Признаю свою неправоту. Хотя она не столкьо моя, с...   8.08.2025 - 21:21
- - Vitek_22   Тов. Игорь, в статье. что я приложил объём выборок...   9.08.2025 - 13:02
|- - Игорь   Цитата(Vitek_22 @ 9.08.2025 - 14:02)...   9.08.2025 - 15:58
- - ИНО   Дело не в мощности. Мощность критерия - функция, з...   9.08.2025 - 17:51
- - ИНО   RE: Критерий для анализа сверхмалых выборок   9.08.2025 - 18:24
- - ИНО   Один неприятный технический момент, который можно ...   9.08.2025 - 18:34
- - Игорь   Удалено автором поста.   10.08.2025 - 18:41
- - ИНО   Я выложил распределение статистики. Постройте гист...   11.08.2025 - 12:32
|- - Игорь   Удалено автором поста.   11.08.2025 - 19:16
- - ИНО   То есть слово "exact" в выдаче Вы в упор...   11.08.2025 - 20:52
- - ИНО   ЦитатаStudent test (location): two sided p = 0.019...   11.08.2025 - 21:06
|- - Игорь   Удалено автором поста.   11.08.2025 - 21:56
- - ИНО   Скачал Руниона этого. Алгоритм, который он предлаг...   11.08.2025 - 22:13
- - ИНО   Цитата(Игорь @ 11.08.2025 - 21:56) У...   11.08.2025 - 22:25
- - Игорь   Удалено автором поста.   12.08.2025 - 13:29
- - ИНО   R правильно считает. StatXact, наверное, тоже счи...   12.08.2025 - 21:52
|- - Игорь   Удалено автором поста.   13.08.2025 - 11:44
- - ИНО   Вы неверно считаете двустороннее. Что есть односто...   13.08.2025 - 13:55
|- - Игорь   Удалено автором поста.   14.08.2025 - 07:10
- - ИНО   Вот именно двустороннее и неверное, к односторонни...   14.08.2025 - 17:40
|- - Игорь   Удалено автором поста   15.08.2025 - 09:21
- - ИНО   Только что совершенно случайно в процессе чтения с...   14.08.2025 - 18:01
- - ИНО   Игорь, полагаю, откуда и как установить R или еще ...   15.08.2025 - 13:48
|- - Игорь   Удалено автором поста.   15.08.2025 - 14:31
- - ИНО   Если Вы считаете слово "творения" оскорб...   16.08.2025 - 13:13
- - Игорь   Думаю, что мы немного погорячились. Да и я, винова...   26.08.2025 - 19:58
- - ИНО   Тогда и меня простите. Но это касается исключитель...   26.08.2025 - 23:54
|- - Игорь   Цитата(ИНО @ 27.08.2025 - 00:54) Во-...   27.08.2025 - 08:09
- - ИНО   Ну все ж хотелось бы докопаться до истины - какой ...   27.08.2025 - 16:26
- - Игорь   В комментариях исходников coin есть названия источ...   4.09.2025 - 19:12


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему