Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> Критерий для анализа сверхмалых выборок, выборки из 3 значений. Применение стат. анализа
Vitek_22
сообщение 25.05.2022 - 12:45
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 30
Регистрация: 7.12.2012
Пользователь №: 24440



Салют! Столкнулся с проблемой сравнения двух выборок, в каждой из которых по 3 значения. Это результаты иммуноблоттинга (определение концентрации целевого белка в пробе) очень ценных образцов, полученных от трансгенных животных. Но их - образцов, было всего 3 для каждой из групп (2 группы: интактная и подвергнутая воздействию исследуемого фактора). Покопавшись в литературе, нашёл статьи, где есть такие выборки и авторы как ни в чём не бывало используют t-критерий Стьюдента для сравнения средних. Нашёл статьи, где используют U-критерий Манна-Уитни... Скажем так, в биологии 3 образца - это нормально для публикации, если речь идёт об особо ценном и сложнополучаемом биоматериале (к примеру как у меня, когда животные практически не дают потомства). Т.е. представить эти данные можно и не стыдно. Но вот как сравнить, как показать, что эти выборки отличаются статистически значимо, иными словами, что наш исследуемый фактор значимо повлиял на концентрацию целевого белка?
Почитал ещё о таком методе, как ресамплинг или бутстреп, когда объём выборки искусственно увеличивают. Ну, не знаю насколько это правильно... также не нашёл софт и чёткого понимания как это сделать у меня нет.
Работаю в проге Statistica 12

Посоветуйте, как всё же обработать эти данные. Вот пример исходных цифр:
Выборка 1:
221,60112
305,217725
295,251684

Выборка 2:
371,3313
397,452722
437,212724
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
ИНО
сообщение 11.08.2025 - 12:32
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 290
Регистрация: 1.06.2022
Из: Донецк
Пользователь №: 39632



Я выложил распределение статистики. Постройте гистограмму и убедитесь, что оно абсолютно симметрична. Не уверен, что в случае с разными объемами выборок будет так же, но в данном примере так. Утверждать, будто Рунион и все известные программы неправильно считают p, и только Ваше творение правильно (да еще PAST, но он в разных версиях считает по-разному, причем не только это - сырой и непроверенный продукт на мой взгляд) - такое себе. В данном примере p будет одинаково для статистик Стьюдента, Уэлча, разности средних, Уилкоксона, поскольку зависит не от самих значений статистик, а лишь от того, какая их доля больше или равна наблюдаемому значению. Повторюсь, в случаях "упора в технический барьер", всегда будет только два экстремальных перестановочных значения тестовой статистики, на противоположных хвостах распределения. Одно будет равно наблюдаемому, второе - минус наблюдаемому. Это не зависит ни от величины различий, ни от статистики. Разве что если выбирать статистику, принимающую только положительные значения (например F, или модуль разности средних), то оба экстремальных значения съедут в одну точку.

Код
x<-c(0.18, 0.27, 0.19, 0.36, 0.43)
y<-c(0.41, 0.38, 0.73, 0.49, 0.58)

wilcox.test(x, y)


Wilcoxon rank sum exact test

data: x and y
W = 2, p-value = 0.03175
alternative hypothesis: true location shift is not equal to 0

Код
xy<-data.frame(value=c(x,y), group=as.factor(c(1,1,1,1,1,2,2,2,2,2)))
library(coin)
oneway_test(value~group, data=xy, distribution="exact")

Exact Two-Sample Fisher-Pitman Permutation Test

data: value by group (1, 2)
Z = -2.1509, p-value = 0.03175
alternative hypothesis: true mu is not equal to 0
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- Vitek_22   Критерий для анализа сверхмалых выборок   25.05.2022 - 12:45
- - Игорь   В принципе любая непараметрика. Можно посмотреть к...   26.05.2022 - 08:42
|- - salm   Цитата(Игорь @ 26.05.2022 - 08:42) В...   24.02.2023 - 13:32
|- - ИНО   В указанных критериях объемы выборок, учитывается ...   24.02.2023 - 14:47
||- - salm   Цитата(ИНО @ 24.02.2023 - 14:47) В у...   24.02.2023 - 20:55
||- - 100$   > Спасибо. А в принципе, такое выражение ...   24.02.2023 - 23:32
|- - Игорь   Цитата(salm @ 24.02.2023 - 14:32) Зд...   24.02.2023 - 17:37
|- - salm   Цитата(Игорь @ 24.02.2023 - 17:37) Е...   24.02.2023 - 20:47
|- - ИНО   Цитата(salm @ 24.02.2023 - 20:47) А ...   25.02.2023 - 05:37
|- - Игорь   Удалено автором поста.   1.03.2023 - 10:25
- - Vitek_22   Игорь, спасибо. А как обосновать использование это...   26.05.2022 - 10:41
|- - 100$   Цитата(Vitek_22 @ 26.05.2022 - 10:41...   26.05.2022 - 17:46
|- - Игорь   Цитата(Vitek_22 @ 26.05.2022 - 10:41...   31.05.2022 - 07:07
- - ИНО   Вот-только при помощи перестановок Вы никогда не д...   5.06.2022 - 23:55
- - Игорь   Цитата(Vitek_22 @ 25.05.2022 - 13:45...   9.06.2022 - 13:53
|- - 100$   Цитата(Игорь @ 9.06.2022 - 13:53) Кр...   9.06.2022 - 16:17
|- - ИНО   Цитата(100$ @ 9.06.2022 - 16:17...   9.06.2022 - 23:21
|- - 100$   Цитата(ИНО @ 9.06.2022 - 23:21) Поче...   10.06.2022 - 10:08
- - ИНО   Сдается мне, Ваше творение нагло врет, по крайней ...   9.06.2022 - 16:05
- - Игорь   Спасибо коллегам за подробный разбор. Проверил. Сн...   9.06.2022 - 20:08
- - ИНО   ЦитатаГрубо говоря - одно и то же. Исправлять нече...   9.06.2022 - 22:28
|- - Игорь   Цитата(ИНО @ 9.06.2022 - 22:28) Одна...   10.06.2022 - 13:15
- - ИНО   Очевидно, сии подделки экселя прозрачно намекают, ...   10.06.2022 - 14:00
- - ИНО   Почитал мануал ПАСТа, относительно "permutati...   11.06.2022 - 15:09
|- - 100$   Цитата(ИНО @ 11.06.2022 - 15:09) Пол...   12.06.2022 - 12:43
- - ИНО   ЦитатаА это разовое значение (в смысле, полученное...   13.06.2022 - 19:29
- - nokh   Цитата(Vitek_22 @ 25.05.2022 - 14:45...   17.06.2022 - 07:34
|- - ИНО   Цитата(nokh @ 17.06.2022 - 07:34) Мо...   17.06.2022 - 13:17
|- - 100$   Цитата(ИНО @ 17.06.2022 - 13:17) ......   17.06.2022 - 13:26
- - 100$   ЦитатаНе знаю почему уважаемые участники форума не...   17.06.2022 - 12:13
- - ИНО   Хороший вопрос! Документация пакета boot (свер...   17.06.2022 - 17:12
|- - 100$   Цитата(ИНО @ 17.06.2022 - 17:12) Выв...   18.06.2022 - 01:12
- - ИНО   Ну что поделать, я не умею толком ни программирова...   18.06.2022 - 01:54
- - comisora   Добрый день. Предлагаю рассмотреть на жизнеспособн...   18.06.2022 - 17:49
- - ИНО   ИМХО бета тут как бы совсем за уши притянута, огра...   18.06.2022 - 18:17
- - comisora   2ИНО Ошибки исправил, результат тоже, спасибо. По...   18.06.2022 - 19:12
- - 100$   >comisora, а вы можете откомментировать констр...   18.06.2022 - 21:26
- - comisora   2 100$ Конечно. Это я усложнил код, так как ...   18.06.2022 - 23:53
|- - 100$   Цитата(comisora @ 18.06.2022 - 23:53...   19.06.2022 - 00:16
- - 100$   Подведем некоторые промежуточные итоги. В соответ...   19.06.2022 - 22:20
- - comisora   2 100$ У меня опыта создания пакетов нет (да...   20.06.2022 - 00:42
- - ИНО   Цитата(100$ @ 19.06.2022 - 22:2...   20.06.2022 - 04:56
|- - 100$   "Я проснулся сегодня рано..." (Исполняет...   20.06.2022 - 13:01
- - ИНО   Нет, на той гистограмме - распределение при нулево...   20.06.2022 - 17:10
|- - 100$   ЦитатаНет, на той гистограмме - распределение при ...   20.06.2022 - 23:24
- - ИНО   Да все в порядке изначально было с гистограммой ст...   21.06.2022 - 03:31
|- - 100$   ЦитатаС этим не спорю. Заметьте, здесь порядок циф...   21.06.2022 - 12:21
- - ИНО   Ну, результаты моделирования как бы намекают, что ...   21.06.2022 - 21:00
|- - 100$   Цитата(ИНО @ 21.06.2022 - 21:00) А в...   23.06.2022 - 00:19
- - comisora   Цитата(100$ @ 21.06.2022 - 12:2...   22.06.2022 - 10:42
- - ИНО   Этот ответ справедлив только для критериев рандоми...   23.06.2022 - 04:56
- - 100$   Но, если уж на то пошло, для желаемого соотношения...   23.06.2022 - 11:10
- - salm   Добрый день. пожалуйста, у меня есть парные измер...   12.01.2023 - 11:51
|- - 100$   Цитата(salm @ 12.01.2023 - 11:51) До...   12.01.2023 - 13:39
|- - salm   Цитата(100$ @ 12.01.2023 - 13:3...   12.01.2023 - 16:09
- - ИНО   Проблема множественных сравнений отнюдь не исчерпы...   1.03.2023 - 12:35
|- - Игорь   Удалено автором поста.   1.03.2023 - 20:24
- - ИНО   Пример 1. Почему у Смирнова мощность значительно м...   2.03.2023 - 07:16
|- - Игорь   Удалено автором поста.   2.03.2023 - 07:39
- - ИНО   Так-то оно так, вот только для перестраховки приня...   2.03.2023 - 10:06
- - ИНО   Причем тут смежные области? Вопрос лежит сугубо в ...   2.03.2023 - 11:51
- - Vitek_22   Господа, я что-то совсем позабыл выложить пример. ...   8.08.2025 - 00:33
|- - Игорь   Цитата(Vitek_22 @ 8.08.2025 - 01:33)...   8.08.2025 - 07:38
- - ИНО   Если я правильно понял задачу, то получить p<0...   8.08.2025 - 18:26
- - Vitek_22   тов. Игорь, можете привести эти две выборки по 3 з...   8.08.2025 - 20:53
|- - Игорь   Цитата(Vitek_22 @ 8.08.2025 - 21:53)...   9.08.2025 - 10:01
- - ИНО   Признаю свою неправоту. Хотя она не столкьо моя, с...   8.08.2025 - 21:21
- - Vitek_22   Тов. Игорь, в статье. что я приложил объём выборок...   9.08.2025 - 13:02
|- - Игорь   Цитата(Vitek_22 @ 9.08.2025 - 14:02)...   9.08.2025 - 15:58
- - ИНО   Дело не в мощности. Мощность критерия - функция, з...   9.08.2025 - 17:51
- - ИНО   RE: Критерий для анализа сверхмалых выборок   9.08.2025 - 18:24
- - ИНО   Один неприятный технический момент, который можно ...   9.08.2025 - 18:34
- - Игорь   Удалено автором поста.   10.08.2025 - 18:41
- - ИНО   Я выложил распределение статистики. Постройте гист...   11.08.2025 - 12:32
|- - Игорь   Удалено автором поста.   11.08.2025 - 19:16
- - ИНО   То есть слово "exact" в выдаче Вы в упор...   11.08.2025 - 20:52
- - ИНО   ЦитатаStudent test (location): two sided p = 0.019...   11.08.2025 - 21:06
|- - Игорь   Удалено автором поста.   11.08.2025 - 21:56
- - ИНО   Скачал Руниона этого. Алгоритм, который он предлаг...   11.08.2025 - 22:13
- - ИНО   Цитата(Игорь @ 11.08.2025 - 21:56) У...   11.08.2025 - 22:25
- - Игорь   Удалено автором поста.   12.08.2025 - 13:29
- - ИНО   R правильно считает. StatXact, наверное, тоже счи...   12.08.2025 - 21:52
|- - Игорь   Удалено автором поста.   13.08.2025 - 11:44
- - ИНО   Вы неверно считаете двустороннее. Что есть односто...   13.08.2025 - 13:55
|- - Игорь   Удалено автором поста.   14.08.2025 - 07:10
- - ИНО   Вот именно двустороннее и неверное, к односторонни...   14.08.2025 - 17:40
|- - Игорь   Удалено автором поста   15.08.2025 - 09:21
- - ИНО   Только что совершенно случайно в процессе чтения с...   14.08.2025 - 18:01
- - ИНО   Игорь, полагаю, откуда и как установить R или еще ...   15.08.2025 - 13:48
|- - Игорь   Удалено автором поста.   15.08.2025 - 14:31
- - ИНО   Если Вы считаете слово "творения" оскорб...   16.08.2025 - 13:13
- - Игорь   Думаю, что мы немного погорячились. Да и я, винова...   26.08.2025 - 19:58
- - ИНО   Тогда и меня простите. Но это касается исключитель...   26.08.2025 - 23:54
|- - Игорь   Цитата(ИНО @ 27.08.2025 - 00:54) Во-...   27.08.2025 - 08:09
- - ИНО   Ну все ж хотелось бы докопаться до истины - какой ...   27.08.2025 - 16:26
- - Игорь   В комментариях исходников coin есть названия источ...   4.09.2025 - 19:12


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему