Анализ данных ОТ-ПЦР Опции

[nansy]

Уважаемые форумчане, помогите разобраться! Проблема в следующем: как анализировать полученные данные реакции ОТ-ПЦР? Вопрос на который я хочу ответить с помощью анализа данных: увеличилась ли экспрессия определенного гена после проведения определенных процедур с клетками по отношению к контрольным клеткам, без тех самых процедур. cDNA полученный из клеток я исследовали с помощью реакции ОТ-ПЦР, итак я имею данные на мой проверяемый ген X и housekeeping gene, и так для двух разных процедур. С тем что бы выяснить какая прцедура была эффективней, мне необходимо сравнит эти данные, но для этого необходимо нормализовать данные X по housekeeping gene. Как это сделать вручную или в Excel, если это возможно? Заранее благодарю.

[nansy]

Всем спасибо за ответы, я извиняюсь за неточность формулировок. Поясню себя. На самом деле я воздействую на стволовые клетки с помощью различных вещест, с тем что бы получить экспресию определенных генов, которые не характерны для данного вида взрослых стволовых клеток. Для упрощения, скажем что есть два разных способа воздействия на клетки. После я добываю РНК и cDNA соответственно. Затем, когда я выполняю реакцию Real time PCR, я проверяю експрессию разных генов. Колво cDNA взятое для каждой реакции одинакого. То есть экспрессия housekeeping gene тоже должна быть одинакова. Для простоты скажем, что проверяю два гена после каждой процедуры: HPRT (housekeeping gene) и ген Х. Из за того что данные по HPRT не были одинаковыми, для того что бы сравнить экспресию гена Х мне необходимо сначала как бы привести их к общему знаменателю, то есть нормализовать. ВоспросЖ как это сделать?