Анализ данных ОТ-ПЦР Опции

[nansy]

Уважаемые форумчане, помогите разобраться! Проблема в следующем: как анализировать полученные данные реакции ОТ-ПЦР? Вопрос на который я хочу ответить с помощью анализа данных: увеличилась ли экспрессия определенного гена после проведения определенных процедур с клетками по отношению к контрольным клеткам, без тех самых процедур. cDNA полученный из клеток я исследовали с помощью реакции ОТ-ПЦР, итак я имею данные на мой проверяемый ген X и housekeeping gene, и так для двух разных процедур. С тем что бы выяснить какая прцедура была эффективней, мне необходимо сравнит эти данные, но для этого необходимо нормализовать данные X по housekeeping gene. Как это сделать вручную или в Excel, если это возможно? Заранее благодарю.

[плав]

На самом деле, боюсь, что тут ответить будет сложно. Статистическая генетика отдельная - и быстро развивающаяся - область статистики. Проблема здесь не в том, что используется ПЦР или нет, а в том, что обычно изучается экспрессия большого количества генов и поэтому мы мгновенно влетаем в проблему множественного сравнения.
В данном случае из объяснения вроде бы следует, что проверяются только два гена (или это было упрощение?). если так, то возникает вопрос в каких единицах измерялась экспрессия? Оптическая плотность (или иной показатель, отражающий концентрацию ДНК после ПЦР)? Если так, что Вы просто делите показатель для Вашего гена Х на концентрацию HPRT в пробе. затем сравниваете эти отношения в тех клетках, который подвергались воздействию и в тех, что не подвергались.