Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )
18.10.2007 - 00:52
Сообщение
#1
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 5 Регистрация: 18.10.2007 Пользователь №: 4452 |
Уважаемые форумчане, помогите разобраться! Проблема в следующем: как анализировать полученные данные реакции ОТ-ПЦР? Вопрос на который я хочу ответить с помощью анализа данных: увеличилась ли экспрессия определенного гена после проведения определенных процедур с клетками по отношению к контрольным клеткам, без тех самых процедур. cDNA полученный из клеток я исследовали с помощью реакции ОТ-ПЦР, итак я имею данные на мой проверяемый ген X и housekeeping gene, и так для двух разных процедур. С тем что бы выяснить какая прцедура была эффективней, мне необходимо сравнит эти данные, но для этого необходимо нормализовать данные X по housekeeping gene. Как это сделать вручную или в Excel, если это возможно? Заранее благодарю.
|
|
|
![]() |
![]() |
![]() |
21.10.2007 - 21:51
Сообщение
#2
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 5 Регистрация: 18.10.2007 Пользователь №: 4452 |
Спасибо Плав! Дело в том что результаты ПЦР, это номер цикла, начиная с которого система начинает видеть ДНК, и так тот ген, который начинает светиться на более раннем цикле, его изначальное количество было выше. Но все же то, что я имею на руках, это те самые циклы. Для примера: 1 процедура: HPRT - 22, Х-25, 2 процедура: HPRT-23, Х-26, вот как это сравнить? Ведь каждый цикл это увелечение количества копий гена в два раза, примерно, а значит что я не могу просто так поделить эти значения. У меня не очень хорошо с математикой, поэтому я не могу с этим разобраться.
|
|
|
![]() |
![]() |
nansy Анализ данных ОТ-ПЦР 18.10.2007 - 00:52
nansy Ребята, мой вопрос настолько глуп или никто действ... 19.10.2007 - 14:19
venera51 nansy, уверен, единственная причина, по которой на... 19.10.2007 - 23:31
Игорь Если это так, как сформулировано в предыдущем пост... 20.10.2007 - 15:14
http://uborshizzza.livejou Что такое "необходимо нормализовать данные X ... 20.10.2007 - 21:02
nansy Всем спасибо за ответы, я извиняюсь за неточность ... 21.10.2007 - 10:51
плав На самом деле, боюсь, что тут ответить будет сложн... 21.10.2007 - 11:03
плав Если количество копий растет в геометрической прог... 22.10.2007 - 12:51
nansy Всем спасибо за участие, все получилось, работу за... 1.11.2007 - 20:36![]() ![]() |