Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> Допустимая доля цензурированных наблюдений в анализе выживаемости, а что если 100%?
nokh
сообщение 10.03.2008 - 07:36
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 1219
Регистрация: 13.01.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 4704



Идеальные данные для анализа выживаемости - когда точно известно сколько человек прожил, например, после операции и когда умер. В этом случае цензурированных наблюдений нет. Другой крайний случай - когда все наблюдения цензурированные и дальнейшая судьба пациентов неизвестна. Например один прожил больше года, другой - больше трех. В этом случае может оказаться, что больше года - это 5, а больше трех - это 4. Поэтому, насколько я понимаю, сравнить выживаемость в двух группах где все наблюдения цензурированные невозможно в принципе. А какова допустимая доля цензурированных наблюдений в выборке? Существуют ли какие-то обоснованные или негласные правила? Полазил в и-нете, заглянул в книжки - пока ответа не нашел, хотя везде рассматриваются примеры где полные данные заметно преобладают над цензурированными. Или может считать цензурированными только точно живых на момент анализа, а всех потерявшихся считать умершими в интервале между двумя осмотрами, как прочитал в одной статье?
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
nokh
сообщение 13.03.2008 - 00:51
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 1219
Регистрация: 13.01.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 4704



Спасибо за внимание к моей проблеме. С анализом выживаемости знаком, но проводил его всего дважды. В первом случае выживали мушки дрозофилы и данные были на 100% полные. Во втором случае выживали онкологические больные и данные содержали 3-5% цензурированных наблюдений. Все прекрасно считалось и сравнивалось. Сейчас столкнулся с ситуацией, когда 3-5% умерло, процентов 15 живы, а большинство потерялись. Далеко не во во всех городах существует раковый регистр и полноценные базы данных. В данной больнице сведения о смерти пациентов выцарапывают кто как может: кто письма шлет, кто через спецслужбы действует insane.gif. По-хорошему, конечно, всех потерявшихся нужно считать цензурированными - и тогда, действительно, что это за данные, когда почти все живы? С другой стороны хорошо понятно, куда могли потеряться онкобольные через год-два после операции , но не ясно как грамотно эту информацию обработать. Считать их цензурированными - нечего анализировать, считать умершими - скорее да, но велика степень неопределенности. Где-то читал что всех потерявшихся можно считать умершими в интервале между двумя осмотрами (на первый пришел, на второй - нет) и заносить в актуарные таблицы, но сомневаюсь что это корректно. Кто плотно занимался выживаемостью, подскажите! Это про конктретные данные. Но также остался открытым более общий вопрос: как много может быть цензурированных наблюдений в выборке?
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
плав
сообщение 13.03.2008 - 12:58
Сообщение #3





Группа: Пользователи
Сообщений: 1013
Регистрация: 4.10.2006
Пользователь №: 1933



Цитата(nokh @ 13.03.2008 - 00:51) *
Спасибо за внимание к моей проблеме. С анализом выживаемости знаком, но проводил его всего дважды. В первом случае выживали мушки дрозофилы и данные были на 100% полные. Во втором случае выживали онкологические больные и данные содержали 3-5% цензурированных наблюдений. Все прекрасно считалось и сравнивалось. Сейчас столкнулся с ситуацией, когда 3-5% умерло, процентов 15 живы, а большинство потерялись. Далеко не во во всех городах существует раковый регистр и полноценные базы данных. В данной больнице сведения о смерти пациентов выцарапывают кто как может: кто письма шлет, кто через спецслужбы действует insane.gif. По-хорошему, конечно, всех потерявшихся нужно считать цензурированными - и тогда, действительно, что это за данные, когда почти все живы? С другой стороны хорошо понятно, куда могли потеряться онкобольные через год-два после операции , но не ясно как грамотно эту информацию обработать. Считать их цензурированными - нечего анализировать, считать умершими - скорее да, но велика степень неопределенности. Где-то читал что всех потерявшихся можно считать умершими в интервале между двумя осмотрами (на первый пришел, на второй - нет) и заносить в актуарные таблицы, но сомневаюсь что это корректно. Кто плотно занимался выживаемостью, подскажите! Это про конктретные данные. Но также остался открытым более общий вопрос: как много может быть цензурированных наблюдений в выборке?

Для того, чтобы ответить на конкретный и общий вопросы надо немного задуматься над принципом анализа выживаемости. В нем анализируются, грубо говоря, два компонента - количество наступивших исходов (т.е. умерших) и время наблюдения (за умершими и не умершими). Показатели смертности тогда являются просто отношением количества умерших к суммарному времени наблюдения. Соответственно, если у Вас много цензурированных наблюдений, то это не страшно, поскольку Вы увеличиваете знаменатель. В кардиологических исследованиях не редко цензурируются до 80-90% случаев и более.
НО. Речь идет о цензурированных сулчаях, т.е. известно, что к моменту окончания исследования больной был жив или на третьем месяце наблюдения он погиб в автокатастрофе, а не от инфаркта. Проблема Ваших данных в том, что у Вас цензурированные данные двух типов - качественные (известно, что живы) и некачественные (неизвестно, что с ними). Соответственно, формально Вы их можете включать в исследование только с тем временем наблюдения, когда они _точно_ были живы. Если они потерялись сразу же после операции (т.е. их выписали, а далее судьба неизвестна - то такие наблюдения следует игнорировать. В принципе, при подобных потерях используется обычное правило определения репрезентативности используемой группы, когда данные еще считаются репрезентативными, если потерялось не более 30% наблюдений. Считать потерявшихся больных умершими нельзя, ибо какое время Вы им отведете? Момент последнего контакта - резко завысите смертность, какую-то еще дату - а почему именно ее? С другой стороны, честно говоря, мне не совсем понятны проблемы с нахождением пациентов. Для них известны адреса, по идее должны быть записаны телефоны. В конце концов, есть поликлиника по месту жительства. Поскольку я принимал участие и организовывал не одно исследование с длительным наблюдением могу сказать - данные получить сложно (особенно с прошлого года, когда адресные бюро стали отказывать в предоставлении данных о проживающих), но возможно. Просто для этого надо приложить значительные усилия, а на блюдечке с голубой каемочкой их никто не принесет - не Швеция. В крупных проектах налаживаются связи с Росстатом (региональным отделением) и договариваются о проверке базы данных сотрудниками Росстата (иным образом - запрос умер/жив) нельзя.
Вместе с тем, пусть плохие данные остаются на совести исследователей. Я бы анализировал эти данные по факту - т.е. когда был последний контакт (перед потерей связи или окончанием исследования) или установлен факт смерти и отдельно привел статистику по потерянным пациентам. Это наиболее честный способ представления подобных данных.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
ВалНест
сообщение 1.06.2008 - 09:16
Сообщение #4





Группа: Пользователи
Сообщений: 13
Регистрация: 1.06.2008
Пользователь №: 5074



Речь идет о цензурированных сулчаях, т.е. известно, что к моменту окончания исследования больной был жив или на третьем месяце наблюдения он погиб в автокатастрофе, а не от инфаркта. Проблема Ваших данных в том, что у Вас цензурированные данные двух типов - качественные (известно, что живы) и некачественные (неизвестно, что с ними).
А я опять о своих регистрах! Раковые регистры - это государственное дело. Почему они не могут получать информацию о смерти больных из органов, которые выдают справки о смерти с указанием причин смерти? Тогда проблема "некачественных" данных будет решена! Это делается?
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- nokh   Допустимая доля цензурированных наблюдений в анализе выживаемости   10.03.2008 - 07:36
- - DrgLena   Естественно, что анализ выживаемости не проводят,...   12.03.2008 - 23:55
- - nokh   Спасибо за внимание к моей проблеме. С анализом вы...   13.03.2008 - 00:51
|- - плав   Цитата(nokh @ 13.03.2008 - 00:51) Сп...   13.03.2008 - 12:58
||- - ВалНест   Речь идет о цензурированных сулчаях, т.е. известно...   1.06.2008 - 09:16
|- - ВалНест   Цитата(nokh @ 13.03.2008 - 01:51) Сп...   1.06.2008 - 09:10
|- - плав   Цитата(ВалНест @ 1.06.2008 - 10:10) ...   3.06.2008 - 22:57
- - DrgLena   Вы затронули очень важную тему в анализе данных. Ч...   13.03.2008 - 12:53
- - DrgLena   Обведенная колонка у меня съехала, я хотела отмети...   13.03.2008 - 12:57
- - плав   To DrgLena Если известно, что человек был жив чере...   13.03.2008 - 13:24
|- - ВалНест   Уважаемый ПЛАВ! У меня проблемы при сравнении ...   1.06.2008 - 08:48
- - DrgLena   Как именно игнориорвать мне и не ясно. Условие вкл...   13.03.2008 - 14:12
- - DrgLena   Вот пример реальный, из той же базы данных, сравни...   13.03.2008 - 14:37
|- - плав   Цитата(DrgLena @ 13.03.2008 - 14:37)...   13.03.2008 - 18:38
- - DrgLena   График убежал, повторяю jpg   13.03.2008 - 14:40
- - nokh   Спасибо! На свои вопросы я ответы получил. Вых...   13.03.2008 - 22:55
- - Igoroshka   Позвольте и свои 5 копеек добавить . Усеченные (ц...   4.08.2008 - 17:58
- - плав   Ну и каким образом это "улучшает" выжива...   5.08.2008 - 13:24
|- - Igoroshka   Цитата(плав @ 5.08.2008 - 13:24) Ну ...   5.08.2008 - 14:11
|- - плав   Цитата(Igoroshka @ 5.08.2008 - 15:11...   9.08.2008 - 20:14
|- - Igoroshka   Цитата(плав @ 9.08.2008 - 20:14) Глу...   12.08.2008 - 12:20
|- - плав   Цитата(Igoroshka @ 12.08.2008 - 13:2...   20.08.2008 - 11:10
- - Игорь   Цитата(плав @ 9.08.2008 - 20:14) Глу...   10.08.2008 - 18:58
- - Игорь   По информационным каналам прошло сообщение. Как ра...   1.10.2008 - 15:26
|- - Igoroshka   Цитата(Игорь @ 1.10.2008 - 15:26) По...   4.10.2008 - 09:42
- - nokh   Еще информация к размышлению по части анализа выжи...   9.10.2008 - 21:44
- - Игорь   Цитата(nokh @ 9.10.2008 - 22:44) Еще...   10.10.2008 - 13:19
- - nokh   Не стал открывать новую ветку, т.к. вопрос опять п...   14.11.2008 - 08:59
|- - плав   Цитата(nokh @ 14.11.2008 - 08:59) Не...   14.11.2008 - 16:43
- - nokh   Большое спасибо, пока все получилось красиво. Но я...   17.11.2008 - 18:28
|- - плав   Цитата(nokh @ 17.11.2008 - 18:28) Бо...   21.11.2008 - 23:13
- - nokh   Спасибо. Получается, что если переменная бинарная,...   22.11.2008 - 18:05
- - DrgLena   Да, если предиктор бинарный, то экспоненциальный к...   23.11.2008 - 00:56
- - nokh   Спасибо за разъяснения. Выходит что если предиктор...   27.11.2008 - 19:21
|- - плав   Цитата(nokh @ 27.11.2008 - 19:21) 1)...   27.11.2008 - 22:17
- - DrgLena   «Как вы это проделываете?» Да также ка...   28.11.2008 - 03:30
|- - плав   Цитата(DrgLena @ 28.11.2008 - 03:30)...   28.11.2008 - 10:29
- - DrgLena   Мы очевидно для разных целей используем кокс регре...   28.11.2008 - 14:27
|- - плав   Цитата(DrgLena @ 28.11.2008 - 14:27)...   28.11.2008 - 17:54
- - DrgLena   Да, мне наконец удалось, посчитать руками, помогла...   29.11.2008 - 04:11
|- - плав   Цитата(DrgLena @ 29.11.2008 - 04:11)...   1.12.2008 - 00:53
- - nokh   Спасибо за ответы и интересную дискуссию. Использо...   30.11.2008 - 23:23
|- - плав   Цитата(nokh @ 30.11.2008 - 23:23) Сп...   1.12.2008 - 00:56
- - DrgLena   "Все не так уж просто" Безусловно, не пр...   1.12.2008 - 02:09
|- - плав   Цитата(DrgLena @ 1.12.2008 - 02:09) ...   1.12.2008 - 21:57
- - Игорь   Цитата(DrgLena @ 1.12.2008 - 02:09) ...   1.12.2008 - 18:37
- - DrgLena   Я не стала бы возражать уважаемому модератору, но ...   2.12.2008 - 02:37
|- - плав   Цитата(DrgLena @ 2.12.2008 - 02:37) ...   2.12.2008 - 22:18
- - DrgLena   Ответ уже нашла http://www.weibull.com/   2.12.2008 - 21:37
- - DrgLena   Плав, спасибо большое за внимание и терпение, с к...   3.12.2008 - 16:05
|- - плав   Цитата(DrgLena @ 3.12.2008 - 16:05) ...   3.12.2008 - 22:21
- - DrgLena   Да, не используется не только кокс регрессионное м...   3.12.2008 - 23:58


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему