Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )
10.03.2008 - 07:36
Сообщение
#1
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 1219 Регистрация: 13.01.2008 Из: Челябинск Пользователь №: 4704 |
Идеальные данные для анализа выживаемости - когда точно известно сколько человек прожил, например, после операции и когда умер. В этом случае цензурированных наблюдений нет. Другой крайний случай - когда все наблюдения цензурированные и дальнейшая судьба пациентов неизвестна. Например один прожил больше года, другой - больше трех. В этом случае может оказаться, что больше года - это 5, а больше трех - это 4. Поэтому, насколько я понимаю, сравнить выживаемость в двух группах где все наблюдения цензурированные невозможно в принципе. А какова допустимая доля цензурированных наблюдений в выборке? Существуют ли какие-то обоснованные или негласные правила? Полазил в и-нете, заглянул в книжки - пока ответа не нашел, хотя везде рассматриваются примеры где полные данные заметно преобладают над цензурированными. Или может считать цензурированными только точно живых на момент анализа, а всех потерявшихся считать умершими в интервале между двумя осмотрами, как прочитал в одной статье?
|
|
|
![]() |
![]() |
![]() |
13.03.2008 - 00:51
Сообщение
#2
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 1219 Регистрация: 13.01.2008 Из: Челябинск Пользователь №: 4704 |
Спасибо за внимание к моей проблеме. С анализом выживаемости знаком, но проводил его всего дважды. В первом случае выживали мушки дрозофилы и данные были на 100% полные. Во втором случае выживали онкологические больные и данные содержали 3-5% цензурированных наблюдений. Все прекрасно считалось и сравнивалось. Сейчас столкнулся с ситуацией, когда 3-5% умерло, процентов 15 живы, а большинство потерялись. Далеко не во во всех городах существует раковый регистр и полноценные базы данных. В данной больнице сведения о смерти пациентов выцарапывают кто как может: кто письма шлет, кто через спецслужбы действует
|
|
|
![]() |
![]() |
13.03.2008 - 12:58
Сообщение
#3
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 1013 Регистрация: 4.10.2006 Пользователь №: 1933 |
Спасибо за внимание к моей проблеме. С анализом выживаемости знаком, но проводил его всего дважды. В первом случае выживали мушки дрозофилы и данные были на 100% полные. Во втором случае выживали онкологические больные и данные содержали 3-5% цензурированных наблюдений. Все прекрасно считалось и сравнивалось. Сейчас столкнулся с ситуацией, когда 3-5% умерло, процентов 15 живы, а большинство потерялись. Далеко не во во всех городах существует раковый регистр и полноценные базы данных. В данной больнице сведения о смерти пациентов выцарапывают кто как может: кто письма шлет, кто через спецслужбы действует Для того, чтобы ответить на конкретный и общий вопросы надо немного задуматься над принципом анализа выживаемости. В нем анализируются, грубо говоря, два компонента - количество наступивших исходов (т.е. умерших) и время наблюдения (за умершими и не умершими). Показатели смертности тогда являются просто отношением количества умерших к суммарному времени наблюдения. Соответственно, если у Вас много цензурированных наблюдений, то это не страшно, поскольку Вы увеличиваете знаменатель. В кардиологических исследованиях не редко цензурируются до 80-90% случаев и более. НО. Речь идет о цензурированных сулчаях, т.е. известно, что к моменту окончания исследования больной был жив или на третьем месяце наблюдения он погиб в автокатастрофе, а не от инфаркта. Проблема Ваших данных в том, что у Вас цензурированные данные двух типов - качественные (известно, что живы) и некачественные (неизвестно, что с ними). Соответственно, формально Вы их можете включать в исследование только с тем временем наблюдения, когда они _точно_ были живы. Если они потерялись сразу же после операции (т.е. их выписали, а далее судьба неизвестна - то такие наблюдения следует игнорировать. В принципе, при подобных потерях используется обычное правило определения репрезентативности используемой группы, когда данные еще считаются репрезентативными, если потерялось не более 30% наблюдений. Считать потерявшихся больных умершими нельзя, ибо какое время Вы им отведете? Момент последнего контакта - резко завысите смертность, какую-то еще дату - а почему именно ее? С другой стороны, честно говоря, мне не совсем понятны проблемы с нахождением пациентов. Для них известны адреса, по идее должны быть записаны телефоны. В конце концов, есть поликлиника по месту жительства. Поскольку я принимал участие и организовывал не одно исследование с длительным наблюдением могу сказать - данные получить сложно (особенно с прошлого года, когда адресные бюро стали отказывать в предоставлении данных о проживающих), но возможно. Просто для этого надо приложить значительные усилия, а на блюдечке с голубой каемочкой их никто не принесет - не Швеция. В крупных проектах налаживаются связи с Росстатом (региональным отделением) и договариваются о проверке базы данных сотрудниками Росстата (иным образом - запрос умер/жив) нельзя. Вместе с тем, пусть плохие данные остаются на совести исследователей. Я бы анализировал эти данные по факту - т.е. когда был последний контакт (перед потерей связи или окончанием исследования) или установлен факт смерти и отдельно привел статистику по потерянным пациентам. Это наиболее честный способ представления подобных данных. |
|
|
![]() |
![]() |
1.06.2008 - 09:16
Сообщение
#4
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 13 Регистрация: 1.06.2008 Пользователь №: 5074 |
Речь идет о цензурированных сулчаях, т.е. известно, что к моменту окончания исследования больной был жив или на третьем месяце наблюдения он погиб в автокатастрофе, а не от инфаркта. Проблема Ваших данных в том, что у Вас цензурированные данные двух типов - качественные (известно, что живы) и некачественные (неизвестно, что с ними).
А я опять о своих регистрах! Раковые регистры - это государственное дело. Почему они не могут получать информацию о смерти больных из органов, которые выдают справки о смерти с указанием причин смерти? Тогда проблема "некачественных" данных будет решена! Это делается? |
|
|
![]() |
![]() |
nokh Допустимая доля цензурированных наблюдений в анализе выживаемости 10.03.2008 - 07:36
DrgLena Естественно, что анализ выживаемости не проводят,... 12.03.2008 - 23:55
ВалНест Цитата(nokh @ 13.03.2008 - 01:51) Сп... 1.06.2008 - 09:10
плав Цитата(ВалНест @ 1.06.2008 - 10:10) ... 3.06.2008 - 22:57
DrgLena Вы затронули очень важную тему в анализе данных. Ч... 13.03.2008 - 12:53
DrgLena Обведенная колонка у меня съехала, я хотела отмети... 13.03.2008 - 12:57
плав To DrgLena
Если известно, что человек был жив чере... 13.03.2008 - 13:24
ВалНест Уважаемый ПЛАВ!
У меня проблемы при сравнении ... 1.06.2008 - 08:48
DrgLena Как именно игнориорвать мне и не ясно. Условие вкл... 13.03.2008 - 14:12
DrgLena Вот пример реальный, из той же базы данных, сравни... 13.03.2008 - 14:37
плав Цитата(DrgLena @ 13.03.2008 - 14:37)... 13.03.2008 - 18:38
DrgLena График убежал, повторяю jpg 13.03.2008 - 14:40
nokh Спасибо! На свои вопросы я ответы получил. Вых... 13.03.2008 - 22:55
Igoroshka Позвольте и свои 5 копеек добавить .
Усеченные (ц... 4.08.2008 - 17:58
плав Ну и каким образом это "улучшает" выжива... 5.08.2008 - 13:24
Igoroshka Цитата(плав @ 5.08.2008 - 13:24) Ну ... 5.08.2008 - 14:11
плав Цитата(Igoroshka @ 5.08.2008 - 15:11... 9.08.2008 - 20:14
Igoroshka Цитата(плав @ 9.08.2008 - 20:14) Глу... 12.08.2008 - 12:20
плав Цитата(Igoroshka @ 12.08.2008 - 13:2... 20.08.2008 - 11:10
Игорь Цитата(плав @ 9.08.2008 - 20:14) Глу... 10.08.2008 - 18:58
Игорь По информационным каналам прошло сообщение. Как ра... 1.10.2008 - 15:26
Igoroshka Цитата(Игорь @ 1.10.2008 - 15:26) По... 4.10.2008 - 09:42
nokh Еще информация к размышлению по части анализа выжи... 9.10.2008 - 21:44
Игорь Цитата(nokh @ 9.10.2008 - 22:44) Еще... 10.10.2008 - 13:19
nokh Не стал открывать новую ветку, т.к. вопрос опять п... 14.11.2008 - 08:59
плав Цитата(nokh @ 14.11.2008 - 08:59) Не... 14.11.2008 - 16:43
nokh Большое спасибо, пока все получилось красиво. Но я... 17.11.2008 - 18:28
плав Цитата(nokh @ 17.11.2008 - 18:28) Бо... 21.11.2008 - 23:13
nokh Спасибо. Получается, что если переменная бинарная,... 22.11.2008 - 18:05
DrgLena Да, если предиктор бинарный, то экспоненциальный к... 23.11.2008 - 00:56
nokh Спасибо за разъяснения. Выходит что если предиктор... 27.11.2008 - 19:21
плав Цитата(nokh @ 27.11.2008 - 19:21) 1)... 27.11.2008 - 22:17
DrgLena «Как вы это проделываете?»
Да также ка... 28.11.2008 - 03:30
плав Цитата(DrgLena @ 28.11.2008 - 03:30)... 28.11.2008 - 10:29
DrgLena Мы очевидно для разных целей используем кокс регре... 28.11.2008 - 14:27
плав Цитата(DrgLena @ 28.11.2008 - 14:27)... 28.11.2008 - 17:54
DrgLena Да, мне наконец удалось, посчитать руками, помогла... 29.11.2008 - 04:11
плав Цитата(DrgLena @ 29.11.2008 - 04:11)... 1.12.2008 - 00:53
nokh Спасибо за ответы и интересную дискуссию. Использо... 30.11.2008 - 23:23
плав Цитата(nokh @ 30.11.2008 - 23:23) Сп... 1.12.2008 - 00:56
DrgLena "Все не так уж просто"
Безусловно, не пр... 1.12.2008 - 02:09
плав Цитата(DrgLena @ 1.12.2008 - 02:09) ... 1.12.2008 - 21:57
Игорь Цитата(DrgLena @ 1.12.2008 - 02:09) ... 1.12.2008 - 18:37
DrgLena Я не стала бы возражать уважаемому модератору, но ... 2.12.2008 - 02:37
плав Цитата(DrgLena @ 2.12.2008 - 02:37) ... 2.12.2008 - 22:18
DrgLena Ответ уже нашла
http://www.weibull.com/ 2.12.2008 - 21:37
DrgLena Плав, спасибо большое за внимание и терпение, с к... 3.12.2008 - 16:05
плав Цитата(DrgLena @ 3.12.2008 - 16:05) ... 3.12.2008 - 22:21
DrgLena Да, не используется не только кокс регрессионное м... 3.12.2008 - 23:58![]() ![]() |