Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> ROC-анализ, определение чувствительности и специфичности метода
Татьяна24
сообщение 30.06.2008 - 19:50
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 10
Регистрация: 18.10.2007
Пользователь №: 4453



Объясните, пожалуйста, как вычислить все показатели необходимые для рассчета.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
Игорь
сообщение 6.07.2008 - 09:35
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 1141
Регистрация: 10.04.2007
Пользователь №: 4040



Справедливые слова. И дельные советы. Неполиткорректно свою фразу составил, за что приношу плав свои искренние извинения. Обещаю попытаться сменить тон на более приемлемый.

Итак, у плав написано
Цитата(плав @ 3.07.2008 - 20:17) *
Для примера выше получаем:

Se FP Площадь
1 1 0,143
0,857 1 0,000
...

Не должно ли быть так?

FP Se Площадь
1 1 0,143
0,857 1 0,000
0,857 0,875 0,125
...

А то ведь график будет FP от Se, а должен, предположительно, Se от FP? Если построить график Se от FP, как в таблице плав, то график DrgLena не получается таким, как она представила. У Власова, конечно, рассматриваются различные типы ROC, но здесь, насколько мне удалось понять при моих скромных познаниях, речь идет о конкретном типе кривой.

Если я ошибся (надеюсь, что так и есть), заранее прошу прощения у уважаемого плав.

Цитата(DrgLena @ 5.07.2008 - 01:57) *
Игорь, по видимому, не верно определил больных и здоровых в этом примере. Принято кодировать тех, у кого тест положительный, т.е. больных "1", а здоровых "0", как у Плава в примере. Чувствительность и специфичность относится к этим понятиям. Если поменять кодировку, площадь под кривой будет хоть и не отрицательной, но меньше 0,5 (0,24 в этом примере). Плав дал ручной расчет, совпадающий с MedCalc (Trapezoidal (Wilcoxon) area). Присоединен файл с документацией по этому модулю и решением примера Плава в NCSS может пригодится для расширения познаний.

Уважаемая DrgLena, спасибо за материалы! Поделюсь, что у нас получилось. В наших численных экспериментах (не более того - никакой теории не предлагаю) наблюдалось такое явление. Если мы считаем чувствительность по выборке большей численности, а неспецифичность (1 - Sp, позвольте мне назвать ее так - как у Власова, плав называет это как FP - его право) по выборке меньшей численности, мы всегда получаем выпуклую (правильную smile.gif) ROC. Если наоборот, то ROC всегда будет вогнутой. Рискну предположить, что порядок кодирования (0 или 1) безразличен. Важна только численность выборок опыта и контроля (ну, или больных и здоровых, в зависимости от условий задачи). Этот факт наблюдался в расчетах. Т.е., предположительно, в алгоритме можно предусмотреть выбор той или иной ветки расчета в зависимости от численности, и забыть о кодировке.
Цитата(плав @ 6.07.2008 - 09:32) *
Действительно, обычно использование бинормального метода для построения ROC кривой приводит к несколько другому значению площади под кривой (и более сглаженной форме кривой - без зигзагов, поскольку зигзаги рассматриваются как случайные колебания).

Предположим, так или иначе мы получим гладкую ROC. А справедливо ли это? ROC разве не должна быть по своей природе дискретной?
Выше AUC мы считали по правилу трапеций. А можно ли воспользоваться более точным численным методом? Например, правилом Симпсона? Хотя для дискретной ROC этот вопрос, естественно, не стоит.
Еще вопрос. А зачем нужна стандартная ошибка AUC? И как ее рассчитать?


Signature
Ebsignasnan prei wissant Deiws ainat! As gijwans! Sta ast stas arwis!
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- Татьяна24   ROC-анализ   30.06.2008 - 19:50
- - плав   Зависит от того, в какой форме данные. Если совсем...   30.06.2008 - 20:53
- - Игорь   Цитата(плав @ 30.06.2008 - 20:53) За...   1.07.2008 - 17:00
|- - Med_Elena   Цитата(Игорь @ 1.07.2008 - 17:00) Мн...   10.04.2020 - 21:04
- - плав   На самом деле довольно много материала просто в Ин...   1.07.2008 - 19:17
- - DrgLena   Еще моожно посмотреть 1. Biostatistics. A Methodol...   1.07.2008 - 21:58
- - nokh   Книга В.Власова "Эффективность диагностически...   1.07.2008 - 22:35
- - Игорь   Цитата(nokh @ 1.07.2008 - 22:35) Кни...   2.07.2008 - 10:49
|- - Marinheiro   Цитата(Игорь @ 2.07.2008 - 10:49) Сп...   28.02.2020 - 22:16
- - плав   Если будете где-то новый скан размещать, лучше спр...   2.07.2008 - 11:30
- - Игорь   Цитата(плав @ 30.06.2008 - 20:53) Со...   3.07.2008 - 12:29
|- - плав   Цитата(Игорь @ 3.07.2008 - 13:29) Не...   3.07.2008 - 20:17
- - DrgLena   Конечно, по Ребровой не научишься, ее книга ориент...   3.07.2008 - 13:12
- - DrgLena   Блестяще! Добавить можно только график самой к...   4.07.2008 - 00:23
- - Игорь   Удалено автором.   4.07.2008 - 11:19
|- - плав   Цитата(Игорь @ 4.07.2008 - 12:19) За...   4.07.2008 - 21:48
- - DrgLena   Игорь, по видимому, не верно определил больных и ...   5.07.2008 - 01:57
- - nokh   Цитата(DrgLena @ 5.07.2008 - 04:57) ...   5.07.2008 - 09:38
- - DrgLena   Почти совпадающий, по MedCalc, действительно ROC=0...   5.07.2008 - 12:53
|- - плав   Цитата(DrgLena @ 5.07.2008 - 13:53) ...   5.07.2008 - 16:20
- - Игорь   Цитата(плав @ 4.07.2008 - 21:48) Пре...   5.07.2008 - 16:50
|- - плав   Цитата(Игорь @ 5.07.2008 - 17:50) Мн...   6.07.2008 - 08:29
- - DrgLena   Не стоит горячиться, не так много мест, где есть о...   6.07.2008 - 00:40
- - nokh   Знатоком себя не считаю, но ответ знаю - как раз э...   6.07.2008 - 07:46
|- - плав   Цитата(nokh @ 6.07.2008 - 08:46) Зна...   6.07.2008 - 09:32
- - Игорь   Справедливые слова. И дельные советы. Неполиткорре...   6.07.2008 - 09:35
- - плав   1) FP - сокращение от False Positives (ложноположи...   6.07.2008 - 13:25
- - Игорь   Цитата(nokh @ 6.07.2008 - 07:46) Так...   6.07.2008 - 15:23
- - DrgLena   http://www.rad.jhmi.edu/jeng/javarad/roc/JROCFITi....   6.07.2008 - 16:09
- - Игорь   Цитата(DrgLena @ 6.07.2008 - 16:09) ...   6.07.2008 - 16:28
|- - плав   Цитата(Игорь @ 6.07.2008 - 17:28) Сп...   9.07.2008 - 21:34
- - Игорь   Цитата(плав @ 9.07.2008 - 21:34) Нас...   10.07.2008 - 08:32
- - Игорь   Обнаружен интересный эффект при построении ROC. В ...   12.07.2008 - 09:21
|- - плав   Цитата(Игорь @ 12.07.2008 - 10:21) О...   12.07.2008 - 12:44
- - DrgLena   Я вам об этом и писала 5.07.2008 - 01:57 ПОэтому,...   12.07.2008 - 10:27
- - Игорь   Цитата(DrgLena @ 12.07.2008 - 10:27)...   12.07.2008 - 10:59
- - DrgLena   Я пользуюсь лицензионной программой MedCalc, сама ...   12.07.2008 - 12:01
- - DrgLena   ROC обычно применяют во второй части анализа, посл...   12.07.2008 - 14:25
- - Игорь   Большое спасибо, плав, DrgLena! Теперь о ROC ...   12.07.2008 - 16:38
- - DrgLena   Хорошо, чтобы и автор поста Татьяна24 смогла выпол...   12.07.2008 - 17:07
- - Игорь   Цитата(DrgLena @ 12.07.2008 - 17:07)...   12.07.2008 - 18:55
|- - log   Цитата(Игорь @ 12.07.2008 - 19:55) Н...   14.04.2015 - 22:48
|- - nokh   Цитата(log @ 15.04.2015 - 00:48) Иго...   18.04.2015 - 19:05
- - плав   Я тут проанализировал результаты разных подходов (...   12.07.2008 - 18:55
- - малой   В одной из работ видел, что критерием определения ...   20.04.2015 - 08:44
|- - p2004r   Цитата(малой @ 20.04.2015 - 08:44) В...   20.04.2015 - 10:01
- - малой   Спасибо. Подскажите пожалуйста еще, принят ли како...   20.04.2015 - 10:11
|- - p2004r   Цитата(малой @ 20.04.2015 - 10:11) С...   20.04.2015 - 12:42
- - малой   Большое спасибо   20.04.2015 - 13:55
- - малой   Подскажите еще пожалуйста. Где-то нашёл формулу Юд...   20.04.2015 - 14:16
|- - p2004r   Цитата(малой @ 20.04.2015 - 14:16) П...   20.04.2015 - 15:08
- - md416   Подскажите пожалуйста, где можно почитать про выбо...   8.12.2019 - 22:32
|- - nokh   Цитата(md416 @ 9.12.2019 - 00:32) По...   9.12.2019 - 00:30
|- - p2004r   Цитата(md416 @ 8.12.2019 - 22:32) По...   9.12.2019 - 18:49
- - md416   На самом деле я пытаюсь применить данную методику ...   9.12.2019 - 19:20
|- - Игорь   Цитата(md416 @ 9.12.2019 - 20:20) На...   11.12.2019 - 14:11
- - EkaterinaN   Добрый вечер, применим ли ROC-анализ для определен...   24.04.2020 - 23:37
- - nokh   Цитата(EkaterinaN @ 25.04.2020 - 01...   26.04.2020 - 06:53


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему