Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> Допустимая доля цензурированных наблюдений в анализе выживаемости, а что если 100%?
nokh
сообщение 10.03.2008 - 07:36
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 1219
Регистрация: 13.01.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 4704



Идеальные данные для анализа выживаемости - когда точно известно сколько человек прожил, например, после операции и когда умер. В этом случае цензурированных наблюдений нет. Другой крайний случай - когда все наблюдения цензурированные и дальнейшая судьба пациентов неизвестна. Например один прожил больше года, другой - больше трех. В этом случае может оказаться, что больше года - это 5, а больше трех - это 4. Поэтому, насколько я понимаю, сравнить выживаемость в двух группах где все наблюдения цензурированные невозможно в принципе. А какова допустимая доля цензурированных наблюдений в выборке? Существуют ли какие-то обоснованные или негласные правила? Полазил в и-нете, заглянул в книжки - пока ответа не нашел, хотя везде рассматриваются примеры где полные данные заметно преобладают над цензурированными. Или может считать цензурированными только точно живых на момент анализа, а всех потерявшихся считать умершими в интервале между двумя осмотрами, как прочитал в одной статье?
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
плав
сообщение 5.08.2008 - 13:24
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 1013
Регистрация: 4.10.2006
Пользователь №: 1933



Ну и каким образом это "улучшает" выживаемость? Итак у нас есть 5 человек. Умирают с перерывом в месяц. Один на третьем месяце попал под машину. Имеем:
5 0 0 1 1
5 1 0 0,8 0,8
4 0 1 1 0,8
3 1 0 0,67 0,54
2 1 0 0,5 0,27
1 1 0 0 0
Как выживаемость должна выглядеть без цензурирования? Если хочется сказать, что человек должен был на третьем месяце умереть от изучаемой причины, а умер от машины, то вопрос а откуда исследователь об этом знает? Почему пациент не должен был прожить еще пять или шесть месяцев? Тогда цензурирование "ухудшает" выживаемость (на четверотом месяце она была бы не 0,54, а 0,60. Мне кажется, просто немного путается оценка выживаемости с цензурированием с делением умерших на общее число наблюдений.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
Igoroshka
сообщение 5.08.2008 - 14:11
Сообщение #3





Группа: Пользователи
Сообщений: 53
Регистрация: 22.06.2007
Пользователь №: 4178



Цитата(плав @ 5.08.2008 - 13:24) *
Ну и каким образом это "улучшает" выживаемость? Итак у нас есть 5 человек. Умирают с перерывом в месяц. Один на третьем месяце попал под машину...

У меня получилось:
с усечением:
N d cens f 1-f S
5 1 0 0.20 0.80 0.80
4 0 0 0.00 1.00 0.80
3 1 1 0.33 0.67 0.53
2 1 0 0.50 0.50 0.27
1 1 0 1.00 0.00 0.00

без усечения (цензурирования):
N d cens f 1-f S
5 1 0 0.20 0.80 0.80
4 1 0 0.25 0.75 0.60
3 1 0 0.33 0.67 0.40
2 1 0 0.50 0.50 0.20
1 1 0 1.00 0.00 0.00

Т.е., если умершего больного посчитать, как умершего от других причин (т.е., вместо завершенного наблюдения указать как усеченное), выживаемость получается выше.
По-моему, так.

Куда отнести пациента, попавшего под машину, -- вопрос протокола исследования. В случае с расчетом на популяционном уровне на основе регистра (онкологического) лично я предпочитаю относить такие случаи к умершим от основного заболевания. Аргументов несколько: а) подобные случаи достаточно редки и случайны, б) выживаемость получается несколько более низкая, но более определенная, в) при оценке относительной выживаемости эти риски учитываются через общую популяционную смертность.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
плав
сообщение 9.08.2008 - 20:14
Сообщение #4





Группа: Пользователи
Сообщений: 1013
Регистрация: 4.10.2006
Пользователь №: 1933



Цитата(Igoroshka @ 5.08.2008 - 15:11) *
Куда отнести пациента, попавшего под машину, -- вопрос протокола исследования. В случае с расчетом на популяционном уровне на основе регистра (онкологического) лично я предпочитаю относить такие случаи к умершим от основного заболевания. Аргументов несколько: а) подобные случаи достаточно редки и случайны, б) выживаемость получается несколько более низкая, но более определенная, в) при оценке относительной выживаемости эти риски учитываются через общую популяционную смертность.

Глубокая ошибка.
Вы не знаете, сколько человек бы еще прожил, если бы не попал под машину (умер от других причин). Вы искусственно меняете (фактически подделываете) причину смерти. В реальности единственно, что Вы знаете, это то, что человек был жив три месяца на протяжении исследования. Сколько он еще бы прожил, не известно. Он мог бы прожить месяц, два месяца или десять лет. То, что Вы относите его смерть к "основному заболеванию" не обосновано абсолютно ничем, кроме желания избежать цензурирования. Найдите хоть одну приличную публикацию по анализу выживаемости где-бы так делалось. Весь анализ выживаемости построен на концепции цензурирования как последствия конкурирующих рисков.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
Igoroshka
сообщение 12.08.2008 - 12:20
Сообщение #5





Группа: Пользователи
Сообщений: 53
Регистрация: 22.06.2007
Пользователь №: 4178



Цитата(плав @ 9.08.2008 - 20:14) *
Глубокая ошибка.
[1] Вы не знаете, сколько человек бы еще прожил, если бы не попал под машину (умер от других причин). Вы искусственно меняете (фактически подделываете) причину смерти. В реальности единственно, что Вы знаете, это то, что человек был жив три месяца на протяжении исследования. Сколько он еще бы прожил, не известно. Он мог бы прожить месяц, два месяца или десять лет.
[2] То, что Вы относите его смерть к "основному заболеванию" не обосновано абсолютно ничем, кроме желания избежать цензурирования.
[3] Найдите хоть одну приличную публикацию по анализу выживаемости где-бы так делалось.
[4] Весь анализ выживаемости построен на концепции цензурирования как последствия конкурирующих рисков.

Безусловно, с каждым случаем смерти, указанным, как "смерть от других причин", следует разбираться отдельно. С моей точки зрения это вопрос медицинского характера и четкого определения условий определения конечных состояний в протоколе исследования или в разделе материалов и методов и соответствующей оценки возможного смещения оценок.

1. Хотел бы доуточнить ситуацию. В случаях, с которыми мне, как правило, приходится сталкиваться, информация о статусе пациента (имеется ввиду жив/умер), как правило, поступает из канцер-регистра. Там это отмечено как "жив", "умер от основного заболевания", "умер от причин, не связанных с основным заболеванием", др. В случае со смертью "от других причин", я не знаю не столько, сколько бы он прожил, сколько, что стоит за "смерть от других причин". Особенно, если речь идет о высоколетальных локализациях или распространенных процессах.

2. При отнесении всех смертей, безотносительно от ее причины, к одной категории, с моей точки зрения, мы получаем пусть и заниженный, но нижний предел оценки. Но, повторюсь,
При оценках выживаемости на популяционном уровне (речь идет об относительной выживаемости), разделять причину смерти, чтобы учесть конкурирующие риски, нет смысла, поскольку влияние конкурирующих рисков оценивается через общую популяционную смертность (методы Эдеррера, Хакулинена).

3. Например, "Report of an International Workshop to Standardize Response Criteria for Non-Hodgkin's Lymphomas", Journal of Clinical Oncology, Vol 17, Issue 4 (April), 1999: 1244, http://jco.ascopubs.org/cgi/content/full/17/4/1244: "End Points/
The major end points of interest in clinical trials should5670252 event-free survival (time to treatment failure), which includes failure or death from any causes, freedom from progression, and overall survival.
"
"Postoperative Radiotherapy in High-Risk Premenopausal Women with Breast Cancer Who Receive Adjuvant Chemotherapy", The New England Journal of Medicine, Volume 337:949-955 October 2, 1997 Number 14, http://content.nejm.org/cgi/content/full/3...9e933752eb#R11: "Statistical Analysis/Overall survival was calculated as the length of time until death, irrespective of cause. "

Позволю себе еще одну цитату подхода к решению вопроса о типе наблюдения, соответствующему моему представлению: "Deaths attributed to causes other than breast cancer with no reported recurrence of breast cancer are described as "non?breast-cancer deaths," and all other deaths are described as "breast-cancer deaths"; the latter includes not only the deaths attributed to breast cancer but also deaths from unknown causes without reported recurrence and deaths from any cause after recurrence. These conventions necessitate the use of special statistical methods to avoid bias. These special methods compensate for the fact that if someone who would otherwise have had a recurrence of breast cancer before dying of an unrelated cause were to be given a treatment that had no effect on the time or cause of death but merely prevented the recurrence from preceding it, then instead of being categorized as due to breast cancer, that death would be recategorized as a "non?breast-cancer death."",
Effects of Radiotherapy and Surgery in Early Breast Cancer ? An Overview of the Randomized Trials, http://content.nejm.org/cgi/content/full/3...c07e6f44a00a8ed

4. Был бы благодарен за более развернутое объяснение этой точки зрения.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- nokh   Допустимая доля цензурированных наблюдений в анализе выживаемости   10.03.2008 - 07:36
- - DrgLena   Естественно, что анализ выживаемости не проводят,...   12.03.2008 - 23:55
- - nokh   Спасибо за внимание к моей проблеме. С анализом вы...   13.03.2008 - 00:51
|- - плав   Цитата(nokh @ 13.03.2008 - 00:51) Сп...   13.03.2008 - 12:58
||- - ВалНест   Речь идет о цензурированных сулчаях, т.е. известно...   1.06.2008 - 09:16
|- - ВалНест   Цитата(nokh @ 13.03.2008 - 01:51) Сп...   1.06.2008 - 09:10
|- - плав   Цитата(ВалНест @ 1.06.2008 - 10:10) ...   3.06.2008 - 22:57
- - DrgLena   Вы затронули очень важную тему в анализе данных. Ч...   13.03.2008 - 12:53
- - DrgLena   Обведенная колонка у меня съехала, я хотела отмети...   13.03.2008 - 12:57
- - плав   To DrgLena Если известно, что человек был жив чере...   13.03.2008 - 13:24
|- - ВалНест   Уважаемый ПЛАВ! У меня проблемы при сравнении ...   1.06.2008 - 08:48
- - DrgLena   Как именно игнориорвать мне и не ясно. Условие вкл...   13.03.2008 - 14:12
- - DrgLena   Вот пример реальный, из той же базы данных, сравни...   13.03.2008 - 14:37
|- - плав   Цитата(DrgLena @ 13.03.2008 - 14:37)...   13.03.2008 - 18:38
- - DrgLena   График убежал, повторяю jpg   13.03.2008 - 14:40
- - nokh   Спасибо! На свои вопросы я ответы получил. Вых...   13.03.2008 - 22:55
- - Igoroshka   Позвольте и свои 5 копеек добавить . Усеченные (ц...   4.08.2008 - 17:58
- - плав   Ну и каким образом это "улучшает" выжива...   5.08.2008 - 13:24
|- - Igoroshka   Цитата(плав @ 5.08.2008 - 13:24) Ну ...   5.08.2008 - 14:11
|- - плав   Цитата(Igoroshka @ 5.08.2008 - 15:11...   9.08.2008 - 20:14
|- - Igoroshka   Цитата(плав @ 9.08.2008 - 20:14) Глу...   12.08.2008 - 12:20
|- - плав   Цитата(Igoroshka @ 12.08.2008 - 13:2...   20.08.2008 - 11:10
- - Игорь   Цитата(плав @ 9.08.2008 - 20:14) Глу...   10.08.2008 - 18:58
- - Игорь   По информационным каналам прошло сообщение. Как ра...   1.10.2008 - 15:26
|- - Igoroshka   Цитата(Игорь @ 1.10.2008 - 15:26) По...   4.10.2008 - 09:42
- - nokh   Еще информация к размышлению по части анализа выжи...   9.10.2008 - 21:44
- - Игорь   Цитата(nokh @ 9.10.2008 - 22:44) Еще...   10.10.2008 - 13:19
- - nokh   Не стал открывать новую ветку, т.к. вопрос опять п...   14.11.2008 - 08:59
|- - плав   Цитата(nokh @ 14.11.2008 - 08:59) Не...   14.11.2008 - 16:43
- - nokh   Большое спасибо, пока все получилось красиво. Но я...   17.11.2008 - 18:28
|- - плав   Цитата(nokh @ 17.11.2008 - 18:28) Бо...   21.11.2008 - 23:13
- - nokh   Спасибо. Получается, что если переменная бинарная,...   22.11.2008 - 18:05
- - DrgLena   Да, если предиктор бинарный, то экспоненциальный к...   23.11.2008 - 00:56
- - nokh   Спасибо за разъяснения. Выходит что если предиктор...   27.11.2008 - 19:21
|- - плав   Цитата(nokh @ 27.11.2008 - 19:21) 1)...   27.11.2008 - 22:17
- - DrgLena   «Как вы это проделываете?» Да также ка...   28.11.2008 - 03:30
|- - плав   Цитата(DrgLena @ 28.11.2008 - 03:30)...   28.11.2008 - 10:29
- - DrgLena   Мы очевидно для разных целей используем кокс регре...   28.11.2008 - 14:27
|- - плав   Цитата(DrgLena @ 28.11.2008 - 14:27)...   28.11.2008 - 17:54
- - DrgLena   Да, мне наконец удалось, посчитать руками, помогла...   29.11.2008 - 04:11
|- - плав   Цитата(DrgLena @ 29.11.2008 - 04:11)...   1.12.2008 - 00:53
- - nokh   Спасибо за ответы и интересную дискуссию. Использо...   30.11.2008 - 23:23
|- - плав   Цитата(nokh @ 30.11.2008 - 23:23) Сп...   1.12.2008 - 00:56
- - DrgLena   "Все не так уж просто" Безусловно, не пр...   1.12.2008 - 02:09
|- - плав   Цитата(DrgLena @ 1.12.2008 - 02:09) ...   1.12.2008 - 21:57
- - Игорь   Цитата(DrgLena @ 1.12.2008 - 02:09) ...   1.12.2008 - 18:37
- - DrgLena   Я не стала бы возражать уважаемому модератору, но ...   2.12.2008 - 02:37
|- - плав   Цитата(DrgLena @ 2.12.2008 - 02:37) ...   2.12.2008 - 22:18
- - DrgLena   Ответ уже нашла http://www.weibull.com/   2.12.2008 - 21:37
- - DrgLena   Плав, спасибо большое за внимание и терпение, с к...   3.12.2008 - 16:05
|- - плав   Цитата(DrgLena @ 3.12.2008 - 16:05) ...   3.12.2008 - 22:21
- - DrgLena   Да, не используется не только кокс регрессионное м...   3.12.2008 - 23:58


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему