Несколько биоптатов с крысы - как анализировать? Опции

[Varta]

Допустим имеем 2 группы по 6 крыс в каждой. У каждой крысы взято по 3 биоптата. Как анализировать?
Вариант 1 расчитать среднее по 3 биоптатам для каждой крысы и сравнить 6 и 6. (скажем, сделать Манна-Уитни)
Вариант 2 сравнить 18 биоптатов одной группы с 18 другой.
Правильно конечно делать первый вариант, поскольку при втором увеличивается вклад индивидуальной вариабельности и мы недооценим риск получить различия обусловленные случайной комбинацией крыс. Но чувствительность в первом варианте достаточно мала а хочется все-таки больше.
Есть какие-нибудь ещё варианты?

[nokh]

С mixed я еще не разобрался. Ваш код выдает результаты в терминах обобщенных (generalized) линейных моделей, а я не знаю что с ними далее делать кроме как посмотреть стат. значимость фиксированных эффектов. Описанный мной подход - обычный nested anova, который обсчитывается в настоящее время с помощью общих (general) линейных моделей и результаты которого выдаются в терминах классического аnova. Поскольку дизайн в задаче Varta сбалансировнный - дисперсию можно аккуратно разложить и без привлечения обобщенных моделей. В этом случае, в отличие от mixed, достаточно просто найти выражения для ожидаемых средних квадратов и если нужно - разложить далее дисперсию на компоненты. В общем, достаточно изящный анализ. Обобщенные модели становятся все популярнее на глазах, но я это связываю с увеличением использования несбалансированных планов и комплексов с пропущенными ячейками в некоторых областях биологии, а также с необходимостью учета between-within-структуры в сложных логлинейных моделях, например, в longitudinal исследованиях. В рассматриваемой задаче все куда проще.
Принципиальным вижу другое различие. Вы отнесли крысу к фиксированным факторам, почему? Мне она представляется самой что ни на есть случайной, как и биоптаты и поля зрения. Эффект "крыса внутри группы" отражает индивидуальную биологическую изменчивость между крысами - неконтролируемый исследователем случайный фактор.

[плав]

Принципиальным вижу другое различие. Вы отнесли крысу к фиксированным факторам, почему? Мне она представляется самой что ни на есть случайной, как и биоптаты и поля зрения. Эффект "крыса внутри группы" отражает индивидуальную биологическую изменчивость между крысами - неконтролируемый исследователем случайный фактор.

крыса - индивидуальный фактор (поэтому там код subject(rat), характерно для синтаксиса смешанных моделей)
Кстати, вот тут картинки по смешанным моделям в SPSS
http://www.medspan.info/spss-guide/ch14/c14-2.htm